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绍兴市位于浙江省中北部、杭州湾南岸。东连宁波市，南邻台州市和金华市，西接杭州市，北隔钱塘江与嘉兴市相望，位于北纬29°13′35″至30°17′30″、东经119°53′03″至121°13′38″，属于亚热带季风气候，温暖湿润，四季分明。全境域东西长130.68千米，南北宽118.1千米，海岸线长40千米，陆域总面积为8279.07平方千米，市区（越城区、柯桥区、上虞区）面积2965.05平方千米。
绍兴市全境位于浙西山地丘陵、浙东丘陵山地和浙北平原三大地貌单元的交接地带，地势南高北低，形成群山环绕、盆地内嵌、平原集中的地貌特征，地形骨架呈“山”字形。地貌可概括为“四山三盆二江一平原”，而在面积分配上，则表现为“七山一水两分田”，全境地势从西南向东北倾斜，最高点位于诸暨市境内的会稽山脉主峰东白山，海拔1194.1米，而最低点则是海拔仅3.1米的诸暨‘湖田’地区，中部多为海拔500米以下的丘陵地和台地。北部平原地表地貌比较单调，但地下空间比较复杂，发育了分布较复杂的淤泥层、软土层和硬土层，为地表建筑提供了多样的建设基础。
远古的绍兴，一片沼泽平原，山洪漫流，潮汐泛滥。战国地理名著《禹贡》列其为“下下”。春秋战国时代，齐国宰相管仲曰：“越之水重浊而洎，故其民愚疾而垢。”历来疫疠多有流行，且有一定季节性和地方性。春冬多“风温”“春温”，夏天多“暑温”，长夏多“湿温”“痧气”，入秋多“燥病”，隆冬则多“冬温”“伤寒”。绍兴医家根据绍兴本地地理环境和发病因素，结合“伤寒”与“温病”，寒温一统，统括“伤寒”，细分明目，如“大伤寒”“小伤寒”“暑湿伤寒”“湿温伤寒”“漏底伤寒”“脱脚伤寒”等，因地制宜，制定相应治疗方法。又由于绍兴的地理东低畦滨海卑处，西北丘陵山峰重叠。故东北滨海之地多卑湿热，病多“湿阻”“痧气”“霍乱”等。而西部山地多山岚瘴气，民病则多患“疟”，更苦于“臌”。特定的地理环境和气候风貌，与越人独特的风俗习惯、疾病特征息息相关。