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中医学理论体系是以气一元论和阴阳、五行学说为哲学思辨模式，以整体观念为指导思想，以脏腑、经络和精气血津液神等的生理和病理为基础，以辨证论治为诊疗特点，包括理、法、方、药在内的医学理论体系。
人体是一个有机整体并具有自身的完整性，也是一个开放而复杂的巨系统，传统中医学理论有大量相关记载，《素问·六节藏象论》 [17] 云：“心者，生之本，神之变也，其华在面，其充在血脉，为阳中之太阳，通于夏气。肺者，气之本，魄之处也，其华在毛，其充在皮，为阳中之少阴，通于秋气。肾者，主蛰，封藏之本，精之处也，其华在发，其充在骨，为阴中之太阴，通于冬气。肝者，罢极之本，魂之居也，其华在爪，其充在筋，以生血气，其味酸，其色苍，此为阴中之少阳，通于春气。脾、胃、大肠、小肠、三焦、膀胱者，仓廪之本，营之居也，名曰器，能化糟粕，转味而出入者也，其华在唇四白，其充在肌，其味甘，其色黄，此至阴之类，通于土气。”同时人体以五脏（心、肝、脾、肺、肾）为中心，配合六腑（胆、胃、大肠、小肠、膀胱、三焦）、形体（筋、脉、肉、骨、皮毛）、官窍（目、舌、口、鼻、耳、前后二阴），通过经络系统的联络作用，精、气、血、津、液的生理作用，在神的主宰调节下，构成了脏腑形窍的五脏核心系统。《金匮要略·脏腑经络先后病脉证》云：“五脏元真通畅，人即安和。”《素问·上古天真论》 [18] 云：“能形与神俱，而尽终其天年。”《灵枢·天年》 [19] 云：“血气已和，荣卫已通，五脏已成，神气舍心，魂魄毕具，乃成为人。”形神合一，是人体生命存在的基础，因此，从生理功能上，人的整体性不仅包括五脏一体观，还包括形神的统一性。由于生理功能上是整体性与联系性的，那么病理上必然也是整体性与联系性的。如肝其华在爪、其体在筋，开窍于目，其腑为胆，其味酸，其色苍，为阴中之少阳（足厥阴肝经和足少阳胆经）。所以肝病经常可见到爪甲不荣，肢体麻木、震颤，关节拘急不利，两目干涩或视物模糊，胆汁排泄不畅而引起的口苦、黄疸、胆怯、失眠等临床表现，从经络循行上，以巅顶、小腹、环阴器及两侧身体病变为主，如巅顶痛、少腹痛、疝气、耳鸣、胸胁隐痛等，同时脏腑之间也是整体联系的，肝系统功能病变进一步影响脾胃的运化功能，如《金匮要略》云：“见肝之病，知肝传脾，当先实脾。”
人体的局部还可以反映整体情况，比较有代表性的有三部九候的脉诊，舌尖、舌边、舌中、舌根分布的舌诊，面诊、手诊、足底反射区等，如中医眼诊将眼部根据五行八卦理论进行分区定位取穴，将球结膜分为相等的 8 个经区进行观察，每个经区所代表的脏腑如下：1 区为肺和大肠，2 区为肾和膀胱，3 区为上焦，4 区为肝胆，5 区为中焦，6 区为心和小肠，7 区为脾胃，8 区为下焦。主要通过观察球结膜（白睛）上的血管变化，推测病情。这些具有中医特色的诊断方法，都是通过局部来反映人体整体的病理生理变化的，在临床实践中经过了反复验证，经得起实践的检验，是符合辩证唯物主义的。但其科学解释并不完善，目前的科学理论为全息论，部分是整体的缩影，任一部分包含整体的全部信息，中医对其是有哲学解释的，即宇宙一体观和气一元论，并通过经络系统（十二正经、奇经八脉、十二经别、十二经筋、十二皮部、十五别络）相联系。
多维空间性还体现在地域对人的影响。不同的地域由于地势、气候条件及生活习惯各异，人的生理活动和病理变化特点也不尽相同，例如，西北多燥寒、东南多湿热。随着科技的发展，既往根据气候推断的因地制宜概念可能发生改变，如空调、冰箱等电器的广泛使用，冷饮等夏季产品的热销，导致东南地区阳虚、阴暑、寒湿病邪类疾病的发病率逐渐增高，淡舌、胖舌、齿痕舌屡见不鲜，因此广东地区产生了扶阳派、火神派；而东北地区冬季长、气温低，暖气成了必备之品，加之寒邪闭郁毛孔，人们嗜食酒肉，导致火热内生，红舌、黄苔比比皆是。因此，在结合地域、气候进行辨证的同时，更应该与时俱进，考虑科技发展对疾病谱造成的变化 [20] 。