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鹦鹉热衣原体（CPs），CPs和CT沙眼衣原体仅有10%的DNA同源。可通过CPs包涵体不含糖原、包涵体形态和对磺胺类药物的敏感性与CT沙眼衣原体相鉴别。CPs有多个不同的种，可感染大多数的鸟类和包括人在内的哺乳动物，目前认为CPs菌株至少有5个生物变种，单克隆抗体测定显示鸟生物变种至少有4个血清型，其中鹦鹉和火鸡血清型是美国鸟类感染的最重要血清型。
虽然原先命名为鹦鹉热，实际上所有的鸟类，包括家鸟和野鸟均是CPs的天然宿主。对人类威胁最大的是家禽加工厂（特别是火鸡加工厂）、饲养鸽子和笼中宠鸟。近几年在美国通过对家禽喂含四环素的饲料和对进口鸟在检疫期用四环素治疗，这种感染率已经降低。这种病原体可存在于鸟排泄物、血、腹腔脏器和羽毛内。引起人类感染的主要机制大概是由于吸入干的排泄物；吸入粪便气溶胶、粪尘和含病原的动物分泌物是感染的主要途径。作为感染源的鸟类可无症状或表现拒食、羽毛竖立、无精打采和排绿水样便。受染的鸟类可以是无症状或仅有轻微症状，但在感染后仍能排菌数月。易患鹦鹉热的高危人群包括养鸟者、鸟的爱好者、宠物店的工作人员。人类感染常见于长期或密切接触者，但据报道约20%的鹦鹉热患者无鸟类接触史。但是在家禽饲养场发生鹦鹉热流行时，也有仅接触死家禽、切除死禽内脏者发病。已有报道人类发生反复感染者可持续携带病原体达10年之久。
鹦鹉热几乎只是成人的疾病，可能因为小儿接触鸟类或加工厂或在家庭内接触的可能性较少。病原体吸入呼吸道，经血液循环侵入肝、脾等单核－吞噬细胞系统，在单核吞噬细胞内繁殖后，再血行播散至肺和其他器官。肺内病变常开始于肺门区域，血管周围有炎症反应，并向周围扩散小叶性和间质性肺炎，以肺叶或肺段的下垂部位最为明显，细支气管及支气管上皮引起脱屑和坏死。早期肺泡内充满中性粒细胞及水肿渗出液，不久即被多核细胞所代替，病变部位可产生实变及少量出血，肺实变有淋巴细胞浸润，可出现肺门淋巴结肿大。有时产生胸膜炎症反应。肝脏可出现局部坏死，脾常肿大，心、肾、神经系统以及消化道均可受累产生病变。有猜测存在人与人之间的传播，但尚未证实。
鹦鹉热既可以是呼吸道感染，也可以是以呼吸系统为主的全身性感染。儿童鹦鹉热的临床表现可从无症状感染到出现肺炎、多脏器感染不等。潜伏期平均为15日，一般为5～21日，也可长达4周。起病多隐匿，病情轻时如流感样，也可突然发病，出现发热、寒战、头痛、出汗和其他许多常见的全身和呼吸道症状，如不适无力、关节痛、肌痛、咯血和咽炎。发热第一周可达40℃以上，伴寒战和相对缓脉，常有乏力，肌肉关节痛，畏光，鼻出血，可出现类似伤寒的玫瑰疹，常于病程1周左右出现咳嗽，咳嗽多为干咳，咳少量黏痰或痰中带血等。肺部很少有阳性体征，偶可闻及细湿啰音和胸膜摩擦音，双肺广泛受累者可有呼吸困难和发绀。躯干部皮肤可见一过性玫瑰疹。严重肺炎可发展为谵妄、低氧血症甚至死亡。头痛剧烈，可伴有呕吐，常被疑诊为脑膜炎。
白细胞常不升高，可出现轻度白细胞升高，同时可有门冬氨酸氨基转移酶（谷丙转氨酶）、碱性磷酸酶和胆红素增高。
有报道25%鹦鹉热患者存在脑膜炎，其中半数脑脊液蛋白增高（400～1135mg/L），未见脑脊液中白细胞增加。
CPs肺炎胸片常有异常发现，肺部主要表现为不同程度的肺部浸润，如弥散性支气管肺炎或间质性肺炎，可见由肺门向外周放射的网状或斑片状浸润影，多累及下叶，但无特异性。单侧病变多见，也可双侧受累，肺内病变吸收缓慢，偶见大叶实变或粟粒样结节影及胸膜渗出。可出现胸腔积液。肺内病变吸收缓慢，有报道治疗7周后有50%的患者病灶不能完全吸收。
由于临床表现各异，鹦鹉热的诊断困难。与鸟类的接触史非常重要，但20%的鹦鹉热患者接触史不详。尚无人与人之间传播的证据。出现高热、严重头痛和肌肉痛症状的肺炎患者，结合患者有鸟接触史等阳性流行病学资料和血清学检查确定诊断。
从胸腔积液和痰中可培养出病原体，CPs与CP、CT的培养条件是相同的，由于其潜在的危险，鹦鹉热衣原体除研究性实验室外一般不能培养。
实验室检查诊断多数是靠特异性补体结合性抗体检测。特异性补体结合试验或微量免疫荧光试验阳性，恢复期（发病第2～3周）血清抗体效价比急性期增高4倍或单次效价为1∶32或以上即可确定诊断。诊断的主要方法是血清补体结合试验，是种特异性的。
补体结合（CF）抗体试验不能区别是CP还是CPs，如小儿抗体效价增高，更多可能是CP感染的血清学反应。
CDC认为鹦鹉热确诊病例需要符合临床疾病过程、鸟类接触病史，采用以下三种方法之一进行确定：呼吸道分泌物病原学培养阳性；相隔2周血CF抗体4倍上升或MIF抗体4倍以上升高；MIF单份血清IgM抗体滴度大于或等于16。
可疑病例必须在流行病学上与确诊病例密切相关，或症状出现后单份CF或MIF抗体在1∶32以上。
由于MIF也用于诊断CP感染，用MIF检测可能存在与其他衣原体种或细菌感染间的交叉反应，早期针对鹦鹉热采用四环素进行治疗，可减少抗体反应。
1．MP肺炎
多见于学龄儿童及青少年，婴幼儿也不少见，潜伏期2～3周，症状轻重不等，主要特点是持续剧烈咳嗽，婴幼儿可出现喘息，全身中毒症状相对较轻，可伴发多系统、多器官损害，X线所见远较体征显著，外周血白细胞数大多数正常或增高，血沉增快，血清特异性抗体测定有诊断价值。
2．结核病
小儿多有结核病接触史，起病隐匿或呈现慢性病程，有结核中毒症状，肺部体征相对较少，X线所见远较体征显著，不同类型结核有不同特征性影像学特点，结核菌素试验阳性、结核菌检查阳性，可较早出现全身结核播散病灶等明确诊断。
3．真菌感染
不同的真菌感染的临床表现多样，根据患者有无免疫缺陷等基础疾患、长期应用抗生素、激素等病史、肺部影像学特征、病原学组织培养、病理等检查，经试验和诊断性治疗明确诊断。
CPs对四环素、氯霉素和红霉素敏感，但不主张四环素在8岁以下小儿应用。新生儿和婴儿的用量为红霉素每日40mg/kg，疗程2～3周。也有采用新型大环内酯类抗生素，应注意鹦鹉热的治疗显效较慢，发热等临床症状一般要在48～72h方可控制，有报道红霉素和四环素这两种抗生素对青少年的用量为每日2g，用7～10日或热退后继续服用10日。复发者可进行第二个疗程，发生呼吸衰竭者，需氧疗和进一步机械呼吸治疗。
多西环素100mg每日2次或四环素500mg每日4次在体温正常后再继续服用10～14日，对危重患者可用多西环素4.4mg/（kg·d）每12h口服1次，每日最大量是100mg。对9岁以下不能用四环素的小儿，可选用红霉素500mg口服每日4次。由于初次感染往往并不能产生长久的免疫力，有治疗2个月后病情仍复发的报道。