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六横港区陆域范围包括六横岛以及西侧佛渡岛、东侧凉潭、悬山、金钵盂、虾峙等岛屿和北侧湖泥岛等岛屿，划分为涨起港、东浪咀、聚源、双塘、沙头山、凉潭、虾峙共7个作业区。规划港口岸线72.3千米，已开发利用18.7千米。已建浙能中煤电厂15万吨、5万吨、3.5万吨、2万吨级煤炭泊位各1个，武港25万吨、5万吨级矿石泊位各1个，1万吨级装船泊位2个，中奥1万～5万吨级石油化工泊位2个，金润2万吨级油品泊位1个。涨起港规划布置大型液体散货泊位12个；聚源规划布置5万吨级及以上煤炭泊位4个；凉潭规划布置4个大型矿石泊位；双塘规划为集装箱泊位区，布置5万吨级及以上集装箱泊位14个；东白莲岛适当发展油品运输。六横港区以集装箱、铁矿石、煤炭为主，兼顾液体散货运输和临港产业发展。
位于黄礁至大夹屯岸段，宁波—舟山港六横梅山疏港公路六横段起点区域。岸段呈东西走向，岸线长约5400米，距岸100～300米，水深在20米以上。规划为集中箱泊位区、港口仓储区和综合服务区，可布局5～10万吨级集装箱泊位15个，吞吐能力680万标准箱。集装箱泊位东侧300米岸线作支持系统岸线。集装箱港区后方建设物流园区和各类临港加工区。
位于六横岛东北岸石柱头到黄礁岸段。利用岸线2600米，布局煤电一体化项目，浙江舟山煤炭配送基地。项目总投资28.7亿元，建设规模为15万吨级和5万吨级卸煤泊位各1个，3.5万吨级、2万吨级、5千吨级装煤泊位各1个，年设计卸船和装船能力各为1500万吨。并建有百万千瓦级超临界燃煤机组。该码头由浙江省能源集团有限公司控股建设。
2004年2月23日，浙江能源集团公司主持召开舟山煤炭配送基地港址比选专家论证会。是年6月4日，浙江省发展和改革委员会主持召开舟山煤炭配送基地预可行性研究报告专家咨询会，两次与会专家一致推荐六横港区为舟山煤炭配送基地首选港址。
2005年4月19—20日，浙江省发展和改革委员会在杭州主持召开《浙江舟山煤炭中转码头工程可行性研究报告》预审会，根据专家组审查意见对可行性研究报告进行调整修改，形成上报稿。
2005年8月13—15日，中国国际工程咨询公司受国家发展和改革委员会委托，组成专家组至六横港区，对浙江省发展和改革委员会报送的《浙江舟山煤炭中转码头工程项目申请报告》及其附件《浙江舟山煤炭中转码头工程可行性研究报告》，现场调研核准咨询。9月，向国家发展和改革委员会报送项目核准评估报告。
2005年11月30—12月1日，交通部规划研究院受交通部委托，组成专家组，在北京召开《浙江舟山煤炭中转码头工程可行性研究报告》审核会，会上通过了该可行性研究报告。同年12月，交通部核准报告并印发《关于对舟山港六横港区煤炭中转码头工程项目核准申请报告的意见》（交函规划〔2005〕465号）。
2006年3月，国家发展和改革委员会印发《国家发展和改革委员会关于对舟山港六横港区煤炭中转码头工程项目核准的批复》（发改交运〔2006〕476号），予以批准。一期建造15万吨级、5万吨级煤炭卸船泊位各1个，3.5万吨级、2万吨级、5000吨级煤炭装船泊位各1个，另设堆煤场及装卸船机等设施。总投资28.7亿元，浙江省能源集团有限公司控股建设。
舟山煤炭中转码头的卸船泊位与装船泊位以共用栈桥与陆域相接，平面布局呈反“F”形。卸船泊位总长639米。位于卸船泊位后侧的装船泊位总长693米。码头基础采用高桩梁板式结构。后方陆域面积110公顷，堆场平面尺度1500×561米，可堆煤310万吨。是年12月1日，正式开工建设。
2009年4月30日投入试运营，6月9日，时任浙江省副省长王建满宣布，浙江舟山煤炭中转码头正式开港，8月获准码头对外开放。2011年10月底通过竣工验收。该码头集海运、存储、中转、配煤等功能一体，时为华东地区最大煤炭中转码头。参加开港仪式的有中国煤炭协会会长濮洪九，浙能集团董事长、党委书记吴国潮，时任中共舟山市委书记、市人大常委会主任梁黎明，中共舟山市委副书记、市长周国辉，市委常委、常务副市长马国华，副市长李善忠。
2009年7月13日，希腊籍磐星散货轮满载7.4万吨澳大利亚铁矿砂，靠泊六横煤电码头卸载。为该码头正式开港后首次接卸铁矿砂中转业务。
2011年1月10日，国家发展和改革委员会印发《国家发展和改革委员会关于浙江浙能六横电厂“上大压小”新建工程项目核准的批复》（发改能源〔2011〕44号文），同意在该段岸线，建设浙江浙能六横电厂。建设规模为2×1000兆瓦超临界燃煤机组，同步建设脱硫、脱硝、电除尘等先进环保设施。动态总投资约80亿元人民币。项目业主为浙江浙能中煤舟山煤电有限责任公司。5月12日，浙江浙能六横电厂在普陀六横岛正式动工建设。
2012年3月28日，首台发电机组开工建设。时系中国首台百万千瓦级“三同时”（即《环境保护法》第26条规定的“建设项目中防治污染的设施，必须与主体工程同时设计、同时施工、同时投产使用”）的超低排放新建机组。
2014年3月26日，浙江浙能港口运营管理有限公司正式运营。公司位于六横港区，由浙能集团和浙江富兴电力燃料有限公司共同出资1亿元组建，为船舶提供码头设施和货物装卸、仓储服务，从事煤炭、矿石等散货的中转、装卸、储存、配置、煤炭物流配送、煤炭贸易及与此相关的其他派生产业经营。7月10日，1号发电机组建成投产，投入商业运行。9月17日，中国首家超低排放电厂——浙能六横电厂百万千瓦国产超临界燃煤2号发电机组通过168小时连续满负荷试运行，正式移交生产。至此，舟山群岛新区获批成立后建设的首个重大基础建设项目——浙能六横电厂一期工程全面建成投产发电。
位于凉潭岛北侧岸线约2000米，占地700余亩。现有浙江舟山武钢码头有限公司矿石中转基地在此作业运营。
2008年4月8日，武汉钢铁集团有限公司、宁波港集团有限公司、浙江和润实业集团有限公司负责人在舟山市签订合作协议，合资成立浙江舟山武钢码头有限公司，兴建年吞吐量3000万吨的大型铁矿石中转码头。5月，浙江舟山武钢码头有限公司注册成立。公司由武汉钢铁集团有限公司、宁波港集团有限公司、浙江和润实业集团有限公司共同出资组建，出资额分别为51％、25％、24％，系经营国际铁矿石进口中转业务的大型港口物流企业。7月28日，三方合资成立的浙江舟山武钢码头有限公司在杭州举行揭牌仪式，时任浙江省副省长王建满、市长周国辉、副市长虞洁夫等出席仪式。2009年7月2日，舟山武钢矿石码头工程项目获国家发改委核准（发改基础〔2009〕1753号）。项目位于六横凉潭岛，总投资24亿元，建25万吨级（兼靠30万吨级）卸船泊位1个（码头前沿底标高-27.0米），5万吨级泊位1个，1万吨级江海直达泊位2个（兼靠3.5万吨级，前沿底标高-16.0米）及堆场6处，堆场容量135万吨。卸船码头配3台桥式抓斗卸船机，单机额定能力2500吨/小时，胯下布置1.8米宽码头带式输送机2条，额定能力5000吨/小时。堆场设备采用“堆、取合—机型”的结构，配备堆场取料机3台，堆、取料额定能力5000吨/小时。装船码头配备具有移动、俯、仰、伸缩、直爬式尾车的装船机2台，单机额定能力5000吨/小时。项目一期建设年吞吐量3000万吨。其中外贸进口矿石1500万吨，内贸出口矿石1500万吨。时为华东地区最大铁矿砂中转码头。
2010年10月，矿石进口中转基地码头工程正式动工。2011年7月，码头主体工程完工。2012年11月，码头陆域工程通过验收投入运营。2013年5月4日中午12时10分许，满载货物的散货船“克里斯汀”轮靠泊武钢中转码头25万吨级卸船泊位。该轮运载177823吨铁矿砂，其中的94922吨澳大利亚特殊粉在六横卸货。该轮是武钢中转码头2012年12月获交通运输部批准同意临时对外开放后到港的首艘外籍船舶。2015年6月2—3日，浙江省交通运输厅在舟山组织召开舟山武钢矿石码头工程竣工验收会议，通过竣工验收。
2021年10月22日，浙江舟山武钢码头有限公司武钢码头获省交通运输厅批复，实现30万吨级散货船舶减载靠泊码头的功能。
位于东浪咀至沙岙岸段。有中远舟山大型船舶修造基地落户和本地龙山船厂等企业在作业区生产经营，已形成规模化船舶修造服务基地。
舟山中远船舶修造公司码头 位于六横岛西北端东浪咀岸段。2002年，中远船务工程集团有限公司10万吨级码头1座；7万吨级码头2座；10万吨级船台2座。集造船、海工、修船、改装于一体的大型公司收购舟山市鑫亚船舶修造有限公司。2004年6月8日，舟山中远船舶修造公司成立。公司可用岸线4060米，在原址扩建，占地达200万平方米。建有“三坞两船台七泊位”，分别是：30万吨级船坞1座，10万吨级船坞1座，15+8万吨级加长干船坞1座；30万吨级码头2座，15万吨级码头2座，修造船基地。
舟山市龙山船厂船坞码头 位于六横岛东浪咀沙岙岸段。始建于2002年8月8日。有20万吨级船坞1座（310米×55米×13米）、6万吨级船坞1座（235米×40米×11米）；20万吨级舾装码头（长420米）1座，6万吨级舾装码头（各长220米）2座，以及各类船舶修造设备设施，年修理国内外船舶160余艘，总吨位2000万载重吨。主要修理散货轮、集装箱轮、油轮及各种特种船舶。
舟山市鑫亚船舶修造有限公司船坞码头 位于东浪咀西侧岸段。建于2002年8月。可用岸线1532米，陆域建筑面积近7万平方米。有20万吨级、8万吨级干船坞各1座；20万吨级、15万吨级舾装码头各1座，8万吨级舾装码头2座。具有承包境外钢质船舶修理工程和境内国际招标工程资质。承修船舶以集装箱、散货船、油船、工程船等大中型船舶为主，并重点向LPG船、海洋工程辅助船、邮轮、牲口船等高附加值船型推进。
涨起港作业区位于火烧山嘴至沙岙岸段。舟山市金润石油转运有限公司和舟山市金晖石油有限公司，在本作业区运营。
舟山市金润石油转运有限公司 2003年成立，浙江和润实业集团旗下企业。舟山金润石油转运码头及油库位于涨起港作业区棕榈湾村海口处。2005年8月，动工建设一期油品转运码头及配套14万立方米库容工程，规模为3万吨级（兼靠5万吨级）和3000吨级码头各1座，配置输油臂：16英寸×3台，8寸×2台，2英寸×2台。管道：公称外径700毫米×2根，公称外径400毫米×3根，储油罐14万立方米。2009年建设二期50万立方米罐区扩建工程。2010年3月完工。储油罐均配备加温和搅拌设施，可储存各种油品。自2010年4月起：进9000立方米/小时，出6000立方米/小时。库区配备自动化控制系统和监控系统，对库区油品装卸进行实时监控。
舟山市金晖石油有限公司 2000年4月28日注册成立。建有3000吨级兼靠5000吨级成品油码头1座，配备石油成品储罐13000立方米。主营汽油、柴油、煤油仓储与批发，润滑油、化工产品（不含化学危险品）及船用物资销售。油库码头提供24小时日夜加油加水业务。
涨起港作业区规划为大型液体散货码头泊位区，可建大型液体散货码头泊位8个，后方陆域面积约14.5万平方米。其余岸线水深条件较好，但后缘陆域较狭窄，可作远景发展区。