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早在100万年前，浙江就有了人类活动，浙江地区的先民在几千年前就懂得如何讲究卫生、养生保健、祛除疾病。2004—2006年，浙江省长兴县泗安镇白莲村七里亭的旧石器时代古人类遗址出土了100万年前的700多件刮削器、砍砸器、手镐等打制石器，正是这些略显粗糙的石器开启了浙江历史的长河。距今1万多年的浦江县黄宅镇境内的上山遗址，是长江下游地区最早的新石器时代遗址。8000年前跨湖桥遗址出土“煎药罐”，7000年前河姆渡、四五千年前良渚文化遗址发现药食两用的酸枣、芡实、灵芝，5000年前桐庐桐君采药传说等，初步勾画出了浙派中医的起源。这既是先民们为了改善生存条件与疾病和大自然长期搏斗的结果，也是浙江地区讲究卫生文明的标志。
浙江中医外科学起源于新石器时代。河姆渡遗址是宁绍地区首次发现的新石器时代遗址，其兴起时间稍晚于跨湖桥文化，距今约有7000年的悠久历史，它的发现是长江流域乃至整个南方地区新石器时代考古的重大突破，为重建中国南方地区新石器时代的历史打开了一扇清晰的窗口，证明长江流域与黄河流域一样是中华远古文化的重要发祥地，是具有里程碑意义的空前发现。作为蜚声中外的新石器时代遗址，河姆渡遗址因其广泛深远的学术意义和社会文化遗产价值而备受关注。史料记载，中国早在新石器时代就已发明“砭针”等外科医疗工具，在河姆渡遗址中发现的无眼孔的管状针（用于刺砭）、骨簇（分铤、锋两个部分，锋甚易刺入皮肉，用于刺砭）、骨锥（一种尖端打磨极其精细，作刺砭用；另一种为凹形带沟，主要用于穿刺引流）等，与史料记载的我国早在新石器时代至奴隶社会时期即已发明“砭针”等外科医疗工具的论述是相一致的。这一发现证明浙江地区在新石器时代就已有外科学。早在六七千年前，生活在那里的人们就掌握了简单外科工具的制造技术，并学会用它们来穿刺引流，以治疗简单的外科疾病。河姆渡遗址中骨锥等外科工具的发现正式揭开了浙江中医外科学的发展序幕。