东寨港地处热带北缘,由于地理位置的特殊性,它的气候比较复杂。该地季风气候显著,在强大季风气候的影响下,东寨港形成具有明显大陆性的岛屿气候,也称热带季风海洋性气候,其基本特征是四季不分明,气温年较差小,年平均气温高,干季、雨季明显,冬春干旱,夏秋多雨,多热带气旋,光、热、水资源丰富,风、旱、寒等气候灾害频繁。
受热带气旋影响,每年8—11月台风多从海南岛东部登陆,一般风力为7~12级。每年5—10月为雨季,降水量丰富,年均降水量1 700~1 933mm,其中台风降水量占全年总降水量的80%左右;太阳年辐射总量为253 kJ/cm 2 ,年均日照2 200 h;年均气温、地温分别为23.8℃和26.7℃;年平均相对湿度约为85%。冬季多东北风,夏季多南-东南风,西北风时湾口浪大,每年1—3月凌晨至上午9时常有雾,年平均风速3.4m/s。