从城上扔下来的正是吴三桂父母妻儿的首级,吴三桂顿时惊得面色如土,坠下马来。被军士扶起后,不禁捶胸大哭。刚好清兵也赶到城下,听说吴三桂家属被杀,多尔衮立即下马劝慰吴三桂。吴三桂谢过多尔衮后,趁着锐气攻打都城。城内的李闯王听说清兵也已到城下,只能逃跑了,便立即收拾行装带着妻妾从西门逃走。临走时,还不忘放一把火,将宫殿及九门城楼都烧了,并把明朝太子一起带走。
到了黎明,清兵才攻进城中,吴三桂急急忙忙赶到宫内,各处搜寻一遍,没有找到自己的心上人。于是领兵出了西门,风驰电掣般地追赶李闯去了。祖大寿、孔有德从京城赶来,命令他班师回去。军令难违,吴三桂只好撤军。回到京城后,吴三桂仍秘密地派心腹探听陈圆圆的消息,却杳无音讯。忽然有一个平民求见,吴三桂将他召入。那人呈上一封信,吴三桂展开一看,正是心上人的来信。
陈圆圆秉性聪明,她听说吴三桂追来,李闯想要逃走,便到李闯面前说明吴三桂的心思。李闯把陈圆圆留在京城,一是为了让她来阻止追兵,二是李闯的妻妾大多嫉妒陈圆圆,拒绝与她同行。就这样,陈圆圆得以留在京城,住在了一户平民的家里。吴三桂看完信喜不自禁,赏了这平民二百两银子,立即派兵将陈圆圆接回来。
清摄政王多尔衮入京后,一切事情都由范文程、洪承畴商量去办。京城百姓因李闯吃了不少苦头,愤恨得不得了。等到清兵入城,赶走义军,已是转悲为喜。又因清兵不加杀戮,而且为已逝的明帝发丧,百姓真是感激到了极点。多尔衮见人心已定,急忙召集民夫修筑宫殿,又派人回沈阳接皇帝和太后入京。
一天,探马来报,明朝的福王朱由崧在南京称帝,令兵部尚书史可法统辖淮、扬、凤、庐四镇,江淮一带都已驻扎重兵。多尔衮知道朱由崧没什么才能,但史可法为人忠义,想要招降他,于是派人给史可法写了一封招降信,由他的弟弟代为转交。
顺治元年(1644年)九月,顺治皇帝和太后顺利入京。到了十月,顺治帝亲自前往南郊,祭告天地社稷,成为中原皇帝。满汉文武百官,拜跪臣服,高呼万岁。顺治帝诏告天下:“国号大清,定都燕京。”当天,加封多尔衮为叔父摄政王,加封济尔哈朗为信义辅政叔王,阿济格为武英亲王,恢复肃亲王豪格爵位,封吴三桂为平西王。
听说李闯逃入陕西,多尔衮授命阿济格为靖远大将军,令他率同吴三桂、尚可喜由大同边外进入榆林、延安,从后面攻打陕西;多铎为定国大将军,率同孔有德等人由河南赶往潼关,从前面攻打陕西。多尔衮又派豪格出军山东,豪格不敢违背,只好带兵出发。
那时,朝政稍稍闲暇,多尔衮便到宫里去跟太后共叙离别之情。一天,洪承畴来见他,说江南派使者来犒赏军队。多尔衮说:“犒赏谁的军队?”洪承畴说:“说来可笑。他说是犒赏我朝军士呢!还有一封史可法的信。”说到这里,就立即从袖中拿出一封信,多尔衮拆开一看,不禁惊叹起来。