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肠漏，从字面上来说就是肠道黏膜上的大开口（就像渔网上的破洞），会让未经消化的大块食物进入血液中。一旦它们进入血液中，大型蛋白质分子，如麸质、酪蛋白（一种乳类蛋白质）或蛋白，可能会被免疫系统标示为危险入侵者而被瞄准，免疫系统会制造出免疫体（飞弹）攻击这些“危险的”食物分子。在食物分子被标示为攻击目标后，每当你吃这些食物时，只要你的肠道是可渗入的，免疫系统就会持续攻击这些食物，导致多种食物敏感性甚至更糟的状况。最后，在易感人群中，免疫系统就会将攻击行动转向身体组织，情况就类似免疫系统企图要摧毁食物蛋白质分子那样。
研究表明，很多情况都会导致肠漏：食物方面包括麸质、乳制品及糖；感染方面则如念珠菌、莱姆病及合并感染；毒素方面包括农药和抗生素等药物；还有持续或创伤性的压力。仔细看“麸质”这东西，在细胞层级上，麸质分子刚好看起来像甲状腺分子。如果你是易患病体质，持续吃麸质可能会让你罹患桥本甲状腺炎。这就是自体免疫性的串联性：环境因素包括食物、感染、毒素及压力导致了肠漏，而肠漏造成免疫反应，如食物敏感性、自体免疫性表现，到最后就是全面的自体免疫疾病。
你可能正在经历对多种所吃食物的延迟反应而不自知。如果你如同许多人和过去的我一样，认为这些症状不过是正常生活的一部分，就不会将所吃的食物和所感到的不适相联结。当你无法分辨所吃食物和身体疼痛或脑雾之间的因果关系时，可能要花很多年的时间才会将两者联结上。要是你继续吃会导致肠道炎症和免疫系统过度反应的食物，所感受到的症状可能会加剧，以吸引你的注意力。
自体免疫疾病不会在一夜之间出现。这是个逐渐发展的过程，通常会持续5年、10年或更长时间，在人们的意识觉知之外酝酿，直到表现出不会被人忽视的自体免疫疾病症状。