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药食同源形成了既可以做药品，又可以做食品的“药食两用”品种，历代医书和本草对这些品种均有大量而详细的论述。
古人对“药食两用”品种的记载主要体现在主流本草和食物（食疗）、救荒类本草上。主流本草记载着大量药食同源物品，食物类本草记载了大量食物类药物，体现了古人重视“药食两用”物品在食疗和食养中的作用。
作为我国现存最早的本草学专著，《神农本草经》中上品就收录了50余种食物，如大枣、枸杞子、薏苡仁、生姜、杏仁、乌梅、核桃、莲子、蜂蜜、百合等，主要强调了这些品种的补益作用，可以“久服”“多服”。梁·陶弘景《本草经集注》在《神农本草经》的基础上，增补《名医别录》的365种药物，首次按药物的自然属性分为“草、木、虫鱼、果、菜、米谷”等类，其中82种食物专列在果部（23种）、菜部（30种）、米谷部（29种）。其后的主流本草，如《新修本草》《证类本草》《本草品汇精要》《本草纲目》等多延续了陶弘景的药物自然属性分类方法，不断增补可食药物。如唐·苏敬等编撰的官修《新修本草》（尚志钧辑本）收载219种食物，兽部56种，虫鱼部72种，果部25种，菜部38种，米部28种。唐·孙思邈《备急千金要方》卷二十六专门列有“食治篇”，分“果实”“菜蔬”“谷米”“鸟兽（附虫鱼）”4篇，共收录药食之物154种（果实29种、菜蔬58种、谷米27种、鸟兽虫鱼40种）。
宋·曹孝忠等编撰的官修《证类本草》收载467种食物，主要有兽部58种，禽部56种，虫鱼部187种，果部53种，米谷部48种，菜部65种。明·刘文泰等编撰的官修《本草品汇精要》收载506种食物，主要有米谷部51种，果部67种，菜部74种，兽部62种，禽部65种，虫鱼部187种。明·李时珍《本草纲目》收载食物约615种，主要有谷部73种（含麻麦稻类、稷粟类、菽豆类、造酿类），菜部150种（含熏辛类、柔滑类、蓏菜类、水菜类、芝栭类），果部127种（含五果类、山果类、夷果类、味果类、蓏果类、水果类），兽部66种（含畜类、兽类），禽部77种（含水禽类、原禽类、林禽类、山禽类），鳞部76种（含蛇类、鱼类、无鳞鱼类），介部46种（含龟鳖类、蚌蛤类），并列有饮食禁忌等内容。
在食物、食疗、救荒类本草文献中，唐·孟诜《食疗本草》（谢海洲辑本）收录食物268种，分上、中、下三卷，卷上包括草部、木部、果部98种，卷中包括兽部、禽部、虫鱼部89种，卷下包括米谷部、菜部81种，并附4款饮食方。唐·昝殷《食医心鉴》（丹波元坚辑本）三卷，按15类疾病收集食治方论述食物的治疗作用。
元·吴瑞《日用本草》八卷，按诸水、五谷、五畜、诸禽、虫鱼、五果、五菜、五味等八类收载540余种食物（明·钱允治校注同名书则改为三卷，按米谷、瓜菜、飞禽、走兽、鳞甲、五味等七类收载可食药物170余种）。元·忽思慧《饮膳正要》三卷收载230种食物，其中米谷部49种、兽部35种、禽部18种、鱼部22种、果部39种、菜部40种，附料物诸品28种。
明清数十种食物类本草文献中，以卢和著、汪颖编《食物本草》二卷本为代表，在前人食物分六类（米谷、兽、禽、鱼、果、菜）基础上新增两类（水、味），收载食物386种（水33种、谷35种、菜87种、果57种、禽57种、兽35种、鱼60种、味22种）。明代宫廷佚名写本《（绣像）食物本草》彩绘386种食物丹青493图，大部分一味一图，少数一味多图，如鸡5图，茶10图，梨11图，酒16图，李21图。后经王贵、钱允治增补为四卷本、七卷本（403种），姚可成增《本草纲目》《野菜博录》等缉补成二十二卷本，收载食物达1682味，为食物本草类书籍之冠。明·高濂《遵生八笺》在卷十一至十三《饮馔服食谱》中收集茶、粥、汤、面、蔬、曲等食品配制法及其食疗法。清·何克谏《增补食物本草备考》（又名《增注备载食物本草》）收载食物383种，包括水类30种、谷类34种、菜类80种、果类60种、禽类42种、兽类32种、鱼类77种、味类28种。另附14类食治方103首。
此外，还有明代吴禄《食品集》二卷（347种食物）、宁源《食鉴本草》二卷（252种食物）、穆世锡《食物辑要》八卷（430余种食物）、赵南星《上医本草》四卷（229种食物）、施永图《山公医旨·食物类》（574种食物）、吴文炳《药性全备食物本草》（459种食物），清代朱彝尊《食宪鸿秘》（饮、饭、粉、粥、饵等十六属食物）、沈李龙《食物本草会纂》（600余种食物）、朱本中《饮食须知》（190种食物）、汪启贤《饮食须知》（120种食物）、李文培《食物小录》（200种食物）、李化楠《醒园录》（121种食物）、袁枚《随园食单》（海鲜、点心、饭粥、茶酒等十三单食谱）、章穆《调疾饮食辨》（653种食物）、文晟《本草饮食谱》（300余种食物）、田绵淮《本草省常》（350种食物）、王士雄《随息居饮食谱》（300余种食物）、吴汝纪《每日食物却病考》（200余种食物）。
明·朱橚《救荒本草》收载414种可食植物，分草部245种、木部80种、米谷部20种、果部23种、菜部46种，每部下再按可食部位细分为叶可食（237种）、实可食（61种）、根可食（28种）、花可食（5种）、茎可食（3种）、根笋可食（3种）及多部位皆可食（77种）等。明·鲍山《野菜博录》有草部二卷、木部一卷，收载435种野菜食物，详述煮食法。明·王磐《野菜谱》一卷，收载野菜60种。明·屠本畯《野菜笺》一卷，记载野菜22种。清·顾景星《野菜赞》一卷，收载44种野菜。清·陈仅《济荒必备》三卷，分为辟谷神方四十五则、代匮易知七十三则、备荒食物二十二则。历代本草记录的代表性食物种类见表1。
表1 历代本草记录的代表性食物种类统计
需要说明的是，以上统计的历代本草收载的食物数量，按照药食同源理论和药食两用物质评价标准，包括了一些不宜作为食物的药用品种，如虫鱼部的斑蝥、红娘子，米谷部的罂粟、大麻，菜部的龙葵，兽部的龙骨、底野迦等。尤其明代姚可成《食物本草》二十二卷本收录的玉石部、草部、木部近千余种所谓“食物”，其实是大量药性峻猛或有毒矿物药、有毒中药等。