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检验样品一般应留样，受理登记员负责按照样品贮存条件及品种分类选择相应的留样库。对于剧毒药品、放射性样品、大型医疗器械、菌毒种、细胞等特殊样品，或易腐败、霉变、挥发及开封后质量无保障等无法长期保存的样品，可不留样（但应在检品卡中注明）。留样样品应使用无色或白色透明材料袋封样，且正立码放，不得横放颠倒。四面包装皆可辨认样品标签，正面可辨留样封签。留样周期，一般检验不合格产品保存至效期；国内合格产品，医院制剂保存3个月，苗药材和药包材保存6个月，其他样品保存12个月。
原辅料（含胶囊壳）的留样包装形式与其到货时的市场包装相同或模拟市售包装。固体辅料的留样可密封在聚乙烯袋中并外用铝箔袋包装。液体样品必须依据其特性保存在合适的容器中。一般保存到最后一批使用的成品效期后1年。易挥发和危险液体样品可不留样。所有存放样品的容器必须贴有规定的标签，标签上应注明产品名称、批号、取样日期、储存条件、储存期限等信息。成品的留样必须使用其商业包装。依据产品注册批准的贮藏条件储存在相应的区域，留样外箱上应有留样标签，并注明产品名称、批号、失效期及留样的保留时间等。一般留样数量为3倍全检量，保存期为效期后1年。印字包材和直接接触药品的初级包材可以附在相应实验记录后面，与实验记录一起保存，保存时间与实验记录一致。