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公元904年，由张廉夫始建的三官庙迎来了一位特殊的客人，此人便是第一位受过朝廷敕封的高道李哲玄。
这李哲玄，字静修，号守中子，河南兰义人，生于唐代宣宗大中元年丁卯二月十七日，即公元847年。
孙思邈 （581年—682年），汉族，唐朝京兆华原，现在的陕西耀县人，是著名的医师与道士，是我国乃至世界史上伟大的医学家和药物学家，被后人誉为“药王”，许多华人奉之为“医神”。
李哲玄在他14岁的时候考中进士，因他喜欢过无拘无束的生活，并喜欢读道经，同时受孙思邈、司马承祯等人的道学思想影响。
正是如此，他做官不久后，便选择了弃官云游，四处寻找道家名师，以便拜师学道。
后来，李哲玄几经辗转，来到了广东省惠州博罗县境内的罗浮山曜真洞入道。
修行十数年，当他深研玄理，学得道教的精华以后，他便拜别师友，于唐昭宗天祐元年，即公元904年来到了崂山。
此时，崂山的三官庙自张廉夫创建了三官庵和三清庵以后，直至唐代，并没有多大的变化。
三官殿内殿堂的一角
李哲玄来到此地后，见这里风景优美，环境极佳，但作为一个道教高人来说，他认为，这三官庙宫区的布局很不合理，于是，他便依照道教“道生一，一生二，二生三，三生万物”的哲学思想，对三官庙的甬道和附属建筑布局进行了调整和修建，并集资兴建一座殿堂，名为三皇殿。
李哲玄根据九宫八卦的方位将三皇殿建于“开门”位置。因为在道教的九宫八卦方位中，只有“休门、生门、开门”这三门为吉门。
与此同时，李哲玄还组织了庙内的道士们完成了植树、修路、建庭院和栽花圃等系列工作，使太清宫的园林布局形成了正规的寺庙园林风格。
太清宫现存的三皇殿就是李哲玄当时修建留下的古迹。这是一个长方形院落，并排列有两座殿堂，主殿是三皇殿，副殿是救苦殿和耿祖祠。
九宫八卦 九宫是排局的框架和阵地，中宫之数为五，寄于坤宫。这样，依照次序便是：一宫坎，二宫坤，三宫震，四宫巽，五宫中，六宫乾，七宫兑，八宫艮，九宫离。八卦是我国古代一套有象征意义的符号。用“—”代表阳，用“--”代表阴，用三个这样的符号，组成八种形式，叫作八卦。
太清宫内的道教石刻
太极图 是研究周易学原理的一张重要的图象。太有至的意思，极有极限之义，就是至于极限，没有相匹之意。既包括了至极之理，也包括了至大至小的时空极限，放之则弥六合，卷之退藏于心。可以大于任意量而不能超越圆周和空间，也可以小于任意量而不等于零或无，以上是太极二字的含义。
三皇殿中供奉的是“天皇”、“地皇”、“人皇”三位神仙。他们分别是中华民族远古时期的氏族领袖伏羲、神农和轩辕。
其中，被称为天皇的伏羲氏手里擎着太极图位于中间，旁边那位手捻稻菽的是地皇神农氏，另一边手握护板的是人皇轩辕氏。
关于这三位老祖先传说很多，如：伏羲制八卦；神农尝百草；轩辕皇帝做兵器、造舟车等，他们都被尊为开创华夏文明的始祖。
在三皇殿两侧，供奉的是中华民族历史上出类拔萃的10位民间医生，他们是创始诊病“问、闻、望、切”四法的扁鹊，有发明麻沸散、首创健身五禽戏的华佗，有作《伤寒杂病论》的张仲景，有著有《千金药方》、后被尊为药王的孙思邈，有修《本草纲目》的李时珍，等等。
在正殿中供奉这些名医的造像，意义在于纪念他们继承和发扬中华民族医学，治病救人，广施普济的功绩。
此外，在三皇殿内，还有一株古柏，高22米，胸围近4米，树龄在两千年以上，它与三官殿大门外的古柏同是西汉张廉夫初创太清宫时所种植。
在这株古柏树干北侧距地面1.5米处，生长着一株藤本植物凌霄，这株凌霄的根全部长在树干中，与之相呼应。
五禽戏 又称五禽操、五禽气功、百步汗戏等，它是一种我国传统的健身方法，由五组模仿动物的动作组成。五禽戏传说由东汉医学家华佗创制。五禽戏是我国民间广为流传的、也是流传时间最长的健身方法之一，据传，华佗的徒弟吴普因长年习练此法而达到百岁高龄。
在此古柏的南侧距地面约10米的树干上又生有一株木本植物盐肤木。这凌霄的树龄已超过百年，盐肤木的树龄也有近百年。
在这近百年来，这三树一体同生，在植物界实属罕见，形成独特景观，被称为“汉柏凌霄”。
在此汉柏旁边，还有一棵唐代栽的榆树，名为龙头榆。此树不结榆钱，树身盘曲似苍龙，树高18.2米，胸径1.3米，树龄已有1100余年，居全国古榆之冠。
三皇殿前的汉柏凌霄
盐肤木 又称五倍子树、山梧桐、黄瓤树和漆树，为漆树科盐肤木属落叶小乔木。它是我国主要经济树种，可供制药和作工业染料的原料。其皮部、种子还可榨油。在园林绿化中，可作为观叶、观果的树种。根、叶、花及果均可入药，有清热解毒、舒筋活络之功效。
三皇殿的西配殿是耿祖祠，里面供奉的是明代太清宫道士耿义兰，这是外地道教殿观中没有的。
三皇殿的另一配殿为救苦殿，里面供奉的是救苦天尊。
传说，这位救苦天尊专门济世救苦，拯救世人脱离苦海，帮助世人解脱困境。这实际上仍是道教思想的一个侧面反映。
在救苦殿外，还有一株大山茶，树高10米，胸围1.3米，树荫所及70余平方米，是现存崂山景区内长势最好的一株山茶。
此山茶北侧有一株侧柏，高17米，胸围近2米，树龄也在500年以上。
再说这位组织修建三皇殿的李哲玄，他一共活了120岁，是一位修道有成的长寿道人。
生长在太清宫内的龙头榆
三皇殿内的塑像
959年，李哲玄羽化于崂山太清宫，其骨骸葬于太清宫后山之阳。后来，鉴于李哲玄对崂山庙宇的建设做出了重大贡献，后周太祖郭威敕封他为道化普济真人。
据我国古代的经典著作《易经》中记载，在伏羲存在的历史时期，他制定并修改了华夏历法，所以被后人尊为“天皇”，其意义是纪念他对中华民族科学文化所做出的贡献。
神农氏是我国古代神话中人物，传说他生有一个水晶肚子，为了让人类能有足够赖以生存的食物，他尝遍百草。如果某种植物有毒，他吃了后就要睡半天，而且看到肚子发黑，就告诉人们不要吃；如果吃了某种植物后肚子仍然是红的，则可以采集种子，种植繁育。为此，后人为了纪念他，便把他称为“地皇”。
“人皇”是纪念炎黄部落首领轩辕氏，因为他统一了黄河中上游各分散的部落，建立了一个民族的雏形，实行了对人群的管理，被尊为“人皇”也是不容非议的。