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对神经系统疾病患者的诊断不应局限于神经系统检查，还必须进行全身体格检查。
（1）全身体格检查可以为神经系统疾病的病因诊断提供线索。例如，一般检查如发热可提示中枢神经系统感染（脑膜炎等），低体温常见于酒精中毒、镇静药中毒、低血糖和Wernicke脑病等。呼吸急促常见于肝性脑病、败血症、肺感染和水杨酸中毒，呼吸抑制常见于镇静药中毒，呼吸深快或暂停常见于代谢性脑病，长吸气、丛集性或共济失调性呼吸提示脑干病变等。体重迅速下降需注意恶性病变如肿瘤的可能。高血压、缺血性心脏病和风湿性心脏病是缺血性卒中的重要危险因素，心律失常特别是心房颤动常为脑栓塞的原因，糖尿病是导致脑动脉硬化和卒中的重要危险因素，可合并多发性神经病。此外，角膜色素环（K-F环）可见于肝豆状核变性（又称Wilson病），是由铜沉积所致；突眼可见于甲状腺功能亢进、眶部或眶后占位和海绵窦血栓形成；发热、意识模糊和有精神症状患者出现口唇疱疹可能为单纯疱疹性脑炎等。
（2）全身体格检查可为系统性疾病导致的神经系统并发症的诊断提供依据。如呕血、黄疸和腹泻患者出现意识模糊应考虑肝性脑病；瘀点或瘀斑提示凝血功能障碍须考虑硬膜下出血、颅内出血；发热、头痛、呕吐和颈项强直患者伴中耳炎，应考虑细菌性脑膜炎可能；甲状腺功能减退患者可出现昏迷、痴呆或共济失调等表现；艾滋病患者可能出现痴呆、脊髓病、神经病和肌病表现。