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作为中医学重要组成部分的中医妇科学是在中医学的形成与发展中逐渐建立和充实起来的。因此，妇科药对的形成、充实和发展自然与之相携并进。虽然在中医妇科学萌芽的夏商周时代，一些重要的妇产科用药已经见诸各种典籍，但那毕竟还只是一些散在零星的单味药物知识，远未形成系统的配伍成方原理。春秋战国时代，人们的认识明显跃上了一个新的台阶。《吕氏春秋·别类》明确指出：“夫草有莘有藟，独食之则杀人，合而食之则益寿。”《黄帝内经》则记载了第一个治疗血枯经闭的妇科药方——四乌贼骨一藘茹丸。该方的两味主药乌贼骨与藘茹（茜草）实际上已可视为初期的妇科药对。秦汉以后，由于张仲景《伤寒杂病论》及其他妇产科专著的相继问世，妇科药对日臻完善并成为固定配伍。如源于《金匮要略》用以治胞漏的“阿胶-艾叶”，源于《古今录验》用以安胎的“黄芩-白术”，均是颇为后世医家所推崇并屡试不爽的经典药对。
金元时期，刘、张、李、朱四大家为妇产科做出了卓越贡献，总结其组方用药规律不难发现，灵活准确使用药对正是他们的重要特点之一。如刘完素治妊娠病，所用方剂大多药味很少，轻灵平和。治胎漏的二黄散用熟地黄配生地黄；治妊娠腹痛的当归地黄汤则以熟地黄配当归；治产前胎不动而下坠的立效散却又以当归伍川芎。李东垣治疗血崩的四首代表方如升阳除湿汤、益胃升阳汤、升阳举经汤、凉血地黄汤，虽然它们的组成各异，作用亦有或补、或温、或清之别，然均不离“柴胡-升麻”这一具有升提作用的药对。
最早以药对命名的文献是《雷公药对》四卷。此后徐之才、宗令祺等各有增补，分别为《药对》《新广药对》。惜其年代久远，原书已佚，今仅能从现存医著中见到部分内容。
现代医家对于药对的研究愈加重视，虽无妇科药对专著问世，但在秦伯未《谦斋医学讲稿》、吕景山《施今墨对药临床经验集》《药对论》，以及胥庆华《中药药对大全》等著作中已有诸多治疗妇科疾病的有效药对被重点介绍。尤其可贵的是，现代学者利用科学技术手段对某些药对的配伍意义进行研究探索，用现代医学观点探究药对的配伍及疗效评价，使药对研究展现出无限广阔的前景。