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如前所述，药对与方剂既有区别，又有联系，很多药对实际上就是一首独立的方剂，因此它单独用于妇科临床无可非议。如主治月经不调、痛经、闭经等的“当归-川芎”，即妇科专方佛手散，可用治痛经的“川楝子-延胡索”，即为方剂金铃子散；可用治痛经、闭经、急性盆腔炎、急性附件炎、胎盘残留、产后恶血不去等病症的“大黄-桃仁-䗪虫”，即仲景下瘀血汤；治湿热带下的“苍术-黄檗”，即为著名方剂二妙散；等等。除此以外的众多药对，虽然没有固定的方名，尚未被公认为方剂，但由于其组成是以治法为依据，且配伍严谨，疗效确切，因此将其视作方剂单独运用于临床也未必不可。如外阴溃疡患者，可单用药对“艾叶-苦参”煎水坐浴。
一般而言，药对单独运用，其用量较重，有重点突出、药少力专、精悍不杂之优点，适用于单纯且程度较轻的病症。