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肝木居五脏之首，十二经之末。一方面肝之经脉通过冲任督三脉与胞宫紧密相连；另一方面，肝体阴而用阳，既能贮藏有形之血，又可疏泄无形之气，为人体气血调节之枢，而气血正是行经、养胎、哺乳的物质基础。因此，肝与女性生理病理关系密切。妇女若肝气平和，则经脉流畅，血海宁静。然妇女因经、孕、产、乳而在生理上数伤于血，是以气分偏盛，情绪易于激动，每致肝失条达，疏泄无度，引起冲任不固，发生经、带、胎、产、杂诸病。故而疏肝养肝成为治疗妇科疾病的又一个重要原则。
肝为将军之官，性喜条达而恶抑郁。若抑郁愤怒，则使肝气郁结，冲任失畅，出现月经后期、痛经、不孕等，此时治宜疏肝解郁，常用疏解理气之品配伍成对，如“柴胡-香附子”“川楝子-香附”“柴胡-生麦芽”等。若肝郁化火，易致热伤冲任，或气火上逆，形成月经先期、崩漏、经行吐衄等疾病，治宜疏肝泻火，常用泻肝凉血之药配伍，如“牡丹皮-栀子”“黄芩-栀子”“龙胆草-大黄”等。若肝郁化热，肝气犯脾，导致脾虚湿盛，湿热互结而下注冲任，引起带下、阴痒等疾病，则治宜泻肝清热除湿为主。常用清肝泻火、燥湿、利湿之品组成药对，或内服或外用，如“龙胆草-黄檗”“苍术-黄檗”“黄檗-椿根皮”等。
肝脾二脏，相制相成。肝郁气滞，疏泄失常，往往横逆犯脾，是为“木郁戕土”；脾虚失运，化源不充，肝失所藏，血不养肝，亦每令疏泄失常，是为“土虚木郁”。两者皆致肝脾不和，冲任失司，常引发月经不调、经行泄泻、不孕等疾病。病变既然责之肝脾，故治疗理当肝脾兼治，常用疏肝、养血、益气、健脾之品配伍成对。“木郁戕土”者，以养血疏肝为主，如“柴胡-白芍”“柴胡-枳实”；“土虚木郁”者，以益气健脾为生，如“白术-防风”“白术-白芍”。
肝主藏血。肝血不足，冲任血虚，进而可能导致月经后期、月经过少、闭经、胎动不安、不孕等疾病。此时治宜养血柔肝，故临床常用养血益肝、滋阴补肾之品配伍成对，如“白芍-当归”“熟地黄-白芍”等。若肝血亏虚日重，肝阴不足，或肝血本虚之人，孕后血聚养胎，均可使阴不潜阳，肝阳偏亢，导致妊娠眩晕、产后痉症等，当务之急又为平肝潜阳。此时一般用养血滋阴药与潜镇之品配伍成对，以标本兼顾为良策，如“枸杞子-菊花”“天麻-钩藤”“龟甲-牡蛎”正属此类。若对于阴虚阳亢，肝风内动，所致妊娠痫证，则宜专事镇肝息风，常用药对如“羚羊角-钩藤”“怀牛膝-代赭石”等。
金代医家刘河间说：“妇人童幼天癸未行之间皆属少阴；天癸既行皆以厥阴论治；天癸既竭乃属太阴经也。”刘氏之所以强调妇女“天癸至”至“天癸竭”这一阶段从厥阴论治，显然是因为这一阶段患病与肝关系密切，因此月经、生育年龄阶段的妇女患病，应以调肝为主。妇科药对中调肝药对占有相当大的比例，个中原理似已昭然。