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为了更好地保障此次监测工作数据质量，广东省使用了由广东省国民体质监测中心开发的“广东省国民体质监测数据管理系统”。系统主要由省级、市级、县（区）三级共同管理实施，可随时对全省21个地市监测点进行管理和审核，查看工作进度、管理测试质量等。为省、地市调查队、县（区）调查队三级之间的沟通、监督起到了重要的桥梁作用。
（1）有效地监督了21个地市的数据采集时间、数量、误差、复测等状况。
（2）有效地监督了21个地市数据年龄段特征样本量分布状况。
（3）有效地监督了各抽样地市年龄段特征样本量均衡性状况。
（4）有效地监督了各地市的监测点数量及其变化。
科学的操作流程、方法，高素质、培训合格的技术人员，加之有效的质量控制网络，为科学准确的监测数据提供了坚实的保障基础。