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小肠连接着胃部幽门的括约肌，长度为6~7米。它连接着大肠。大肠的长度约1~1.5米。小肠分泌肠液，以充分消化碳水化合物、蛋白质和脂肪，也会吸收滋养和维持身体运转所需的养分，保护身体不被在胃里盐酸的抗菌行动中存活下来的微生物感染。
当酸性食物（食糜，指食物经胃消化所形成的浆状物）从胃部进入十二指肠时，首先会与胆汁和胰液混合，然后与肠液混合。肝脏及胆囊里的胆结石会明显降低胆汁的分泌，并削弱胰酶消化碳水化合物、蛋白质和脂肪的能力；进而，会让小肠无法适当地吸收这些食物中的营养分子（例如，碳水化合物中的单糖类、蛋白质中的氨基酸，以及脂肪中的脂肪酸和甘油）。这种吸收不完全的情况，会导致营养不良及饥饿感。
既然肠道中的胆汁，是吸收生命所需的脂肪、钙质和维生素K的必要物质，那么胆结石就可能造成足以威胁生命的疾病，例如心脏病、骨质疏松及癌症。肝脏利用脂溶性维生素K，制造血液凝结因子，所以如果缺乏维生素K，就会造成出血性疾病。当身体在消化既有的脂肪上出问题时，由于胆汁、胰脂肪酶和胰腺脂肪供应不足，也会无法完全吸收维生素K。所以遵行低脂或无脂饮食也对身体有害，是有道理的。
钙质是硬化骨骼及牙齿、凝结血液以及强化肌肉机制的必要元素，也是身体在最重要的维持生命正常运转活动中，所需的矿物质之一。而胆汁分泌不足，会妨碍钙质的吸收。
适用于维生素K的原理，也同样适用于其他脂溶性维生素，例如维生素A、E和D。唯有在脂肪正常吸收的情形下，小肠才能有效地吸收维生素A和胡萝卜素。若未能有效地吸收维生素A，上皮细胞就会受损，这些细胞是形成体内所有器官、血管、淋巴管等的必要部分。维生素A也是维持双眼健康、对抗或降低微生物感染的必要物质。维生素D是钙化骨骼和牙齿的必要元素。
我们必须了解一件非常重要的事：仅仅补充这些维生素，并无法解决维生素缺乏的问题。
总而言之，少了正常的胆汁分泌，身体就无法消化与吸收足够的维生素，进而会对循环系统、淋巴系统及泌尿系统，造成大幅度的伤害。
未被适当消化的食物，会在小肠及大肠中发酵、腐败，并招来大量的细菌，帮助加速这个分解过程。这些被分解的食物通常毒性很大，细菌分泌出来的产物也是。这些都会对黏膜造成强烈刺激，而黏膜是身体对抗致病因子的第一道防线。因此，经常接触这些有毒物质，会损坏身体的免疫系统，而免疫系统有60%位于肠道。若小肠和大肠持续负载过多各种毒物，将会引起一大堆疾病，包括腹泻、便秘、肠胃胀气、克罗恩病、溃疡性大肠炎、憩室炎、疝气、息肉、痢疾、阑尾炎、肠扭结和肠套迭以及良性和恶性肿瘤。
充分的胆汁流动，能令食物被完全地消化、吸收，且对整个肠道有良好的清洁作用。身体的各个部位都依靠消化系统提供基本营养，并有效地排除废弃物。而肝脏及胆囊中的胆结石，会大大地干扰这两个重要的过程。因此，即使它们不是所有病痛的起因，至少也是影响身体健康的大多数疾病的成因。排除胆结石，有助于让消化及排泄功能正常化、改善细胞的代谢状况，并维持整个身体的平衡。