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1966年，江华在“文化大革命”中受到冲击。11月上旬，经中央批准，他前往上海住院治病。1967年2月上旬，江华被造反派从上海华东医院抓回杭州秘密关押，周恩来知道后指示驻杭部队负责将江华护送至嘉兴机场，然后飞往北京实施保护。1969年初，江华被安排到二七机车车辆厂劳动。10月，江华被疏散到湖北宜都的国营第二三八厂。在这里，他起了一个“姜志”的化名，被安排在铸造车间有色班劳动。
1973年初，江华被召回北京。8月，中共第十次全国代表大会召开。江华被邀请参加会议，并当选为候补中央委员。1974年底，第四届全国人大第一次会议筹备期间，毛泽东提议江华任最高人民法院院长，李先念代表毛泽东同他谈话，江华表示他没有学过法律，也没有做过司法工作，李先念说：“毛主席要你掌握好政策就行了。”1975年1月20日，第四届全国人民代表大会常务委员会根据毛泽东的提议，任命江华为最高人民法院院长。此后直至1983年6月离任，江华主政最高人民法院8年。后来法学家评价江华：他没学过法律，但他坚守了法律。
1975年2月4日，江华到最高人民法院赴任。此时的人民法院可谓百废待兴。“文革”期间因遭“砸烂公检法”恶浪的冲击，整个司法系统陷入无序状态，宪法和法律被束之高阁，审判工作机制荡然无存，还造成了大量的冤假错案。他贯彻党中央和邓小平关于抓整顿的指示，努力排除“四人帮”的干扰，着重抓学习无产阶级专政理论，落实干部政策，整顿思想组织，特赦战犯，宽大释放全部在押的国民党县团以上党政军人员，派工作组到地方法院调查研究等几件大事。在“四人帮”猖獗之时，江华在最高人民法院率先批判“砸烂公检法”这一口号，并着手恢复在“文革”中被取消的各级人民法院，落实党在司法战线上的各项政策，为“文革”后司法系统拨乱反正打下了基础。
1976年10月粉碎“四人帮”后，法院系统在江华的领导下进行大规模的拨乱反正，平反冤假错案。当时阻力很大，公安部门尤其抵触。公安部某副部长在全国性大会上公开挑战说，江华想当翻案英雄。下面有人攻击他“想出风头”。平反工作推行不久，反对派给他扣政治帽子：“右倾”“砍旗”……关键时刻，最高人民法院向中央呈报《关于善始善终地完成复查纠正冤假错案工作几个问题的请示报告》和《关于复查纠正“文化大革命”期间错判死刑案件的请示报告》，中央全部批转，全力支持法院的工作。全国法院在江华主导下，三年多时间，复查了“文革”期间判处的120万件刑事案件，平反冤案30.1万件，涉及32.6万人。1977年8月，江华参加党的十一大，被选为中央委员。1978年3月，在第五届全国人大第一次会议上，江华再次当选最高人民法院院长。
江华任特别法庭庭长审判林彪、江青反革命集团案
为彻底拨乱反正，中央决定审判林彪、江青反革命集团。1980年3月17日，中共中央书记处决定成立中央“两案”审判指导委员会，由中央政法委书记彭真任主任，统一领导“两案”的审判工作，从全国各地抽调了很多法学专家，准备起诉书。彭真指出：“四道程序把关。公、检、法是三道关，中央领导是第四道关。有不少是路线问题，我们是审理罪行的，路线问题我们管不着。”彭真和胡耀邦力主公审，形成共识。同时又提出，只审判罪行，而“不涉及工作中的错误，包括路线错误”。9月8日，中央政治局常委会决定，将“两案”合并为一案起诉，成立特别法庭，公开审判。9月29日，第五届全国人民代表大会常务委员会第十六次会议通过了《第五届全国人民代表大会常务委员会关于成立最高人民检察院特别检察厅和最高人民法院特别法庭检察、审判林彪、江青反革命集团案主犯的决定》，黄火青任特别检察厅厅长，江华任特别法庭庭长，正式启动了审判程序。从1980年11月20日最高人民法院特别法庭第一次开庭，到1981年1月25日进行法庭宣判，江华带领审判工作人员奋战了近70天。江华摒弃了个人的是非恩怨，认为审判不是为了“解气”或“解恨”，“法庭不是批斗会，也不是控诉会……依法审判，就是文明审判。”两个月零五天的审理中，特别法庭经过42次法庭调查和辩论，有49名证人和被害人出庭作证，对各种证据873件进行了审查，最终以事实为依据，以法律为准绳，对10名被告人作出公正的判决。1981年1月26日《人民日报》全文刊发《判决书》，并发表评论：这是“无法无天”的时代的结束，是以法治国的新时代的开端。
此次审判在中共历史上影响巨大。5个月后，1981年6月27日中共中央第十一届中央委员会第六次全体会议通过《关于建国以来党的若干历史问题的决议》指出：“实践证明，‘文化大革命’不是也不可能是任何意义上的革命或社会进步。”以此为鉴，决议进一步指出：“党的各级组织和其他社会组织一样，都必须在宪法和法律的范围内活动。”
1982年9月，江华参加党的十二大，被选为中央顾问委员会委员，并在中顾委第一次全体会议上当选为常务委员。1983年6月7日，江华在向第六届全国人大一次会议作最高人民法院工作报告后离开最高人民法院院长这一领导岗位。1987年11月，在党的十三大上，江华再次当选为中顾委常委。