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中东呼吸综合征（Middle East respiratory syndrome，MERS）是一种由 MERS冠状病毒引起的病毒性呼吸道疾病。
MERS病毒的基因组也是单股正链RNA，全基因组一般超过3万个核苷酸，其与SARS病毒在基因亲缘关系上具有较高的相似度。MERS病毒在20℃和40%湿度的气溶胶状态下非常稳定，在较高温度和较高湿度下病毒活力迅速下降。
研究发现从单峰骆驼中分离到的MERS病毒基因组与从人类感染病例中分离到的MERS病毒相似度达99%，所以中东地区的单峰骆驼很可能是MERS病毒的潜在来源。目前人们普遍认为MERS病毒是从受感染的单峰骆驼传播给人类的，即MERS是一种人畜共患病，可以在动物和人之间传播，人类可以通过与受感染的动物直接或间接接触而感染。
与SARS病毒不同，MERS病毒与宿主细胞结合的S蛋白功能性受体为二肽基肽酶 - 4（DPP - 4），该受体主要分布于多种哺乳动物的肾脏、肺泡、小肠、肝脏、前列腺等脏器的上皮细胞表面，因此MERS病毒感染者容易进展为重症疾病。MERS病毒除了以胞吞和膜融合的方式进入靶细胞外，还能够直接感染人类树突状细胞和巨噬细胞并在其中复制、繁殖，从而对宿主的免疫系统造成直接损伤。
第1例MERS病例最早于2012年6月在沙特阿拉伯被发现，该病例是一名60岁男子，因发热、咳嗽和气短入院，不久后因进展性呼吸衰竭和肾衰竭而死亡。病毒学专家证实其感染了一种以前没有出现过的冠状病毒。自2012年11月起，沙特阿拉伯卫生部开始频繁报告这种新型冠状病毒的感染病例。
WHO自2012年9月开始通报全球MERS疫情，截至2019年底有27个国家报告MERS病例，累计报告患者2 494例，累计死亡858例，病死率为34%，主要流行国家为沙特阿拉伯、阿拉伯联合酋长国、约旦、卡塔尔、伊朗等中东（西亚）国家及韩国等东亚国家。其中沙特阿拉伯报告病例数2 102例，死亡病例780例，病死率37%。自2012年以来，近几年每年仍有新发MERS病例，形成了MERS病毒与人类长期共存的态势，但自2020年早期开始，全球上报的MERS病例大幅减少。2021年11月15日至16日，WHO召开了关于中东呼吸综合征冠状病毒和其他新出现的人畜共患冠状病毒的全球技术会议。会议报道，截至当前，全球已上报确诊的MERS病例超过2 500例，死亡888人；但在沙特阿拉伯报告了超过80%的病例，在中东以外地区发生了数量有限的MERS疫情。
数据分析发现MERS病例在男性中分布明显多于女性，且将近40%的病例为超过40岁的男性。此外，研究人员已证实MERS病毒可以在人与人之间传播，但观察到的非持续性人际传播主要发生在卫生医疗保健机构和家庭接触。
从MERS疫情观察分析，MERS的传染性似乎较SARS更低，可能与DPP - 4受体在人体细胞表面的分布有关，MERS病毒相对于SARS病毒在上呼吸道的量较少，但各器官表面具有较多的DPP - 4受体，因此MERS病毒感染更容易累及脏器，具有较高的致死风险。
MERS的平均潜伏期为5 ～ 7d，临床症状通常表现为重症肺炎，以发热、咳嗽、呼吸急促为首发症状，部分患者伴发胃肠道症状，发病急，病情进展迅速，多数患者进展为急性呼吸窘迫综合征、感染性休克甚至多器官功能衰竭。
MERS疫情出现至今，WHO及各国的主要防控措施包括以下几方面。
WHO扩展其流感监测和应对系统（GISRS）的监测范围，将流感外的可能引起疫情暴发的病毒纳入，包括MERS病毒、新冠病毒等，并调整相关数据在线平台，对潜在的大流行病毒进行病毒监测、哨点监测、症状监测、实验室监测等。
沙特阿拉伯以国家法定传染病监测系统为基础，针对聚集人群（朝圣人群）加强监测，及时发现关键入境点、医疗卫生场所等地的疑似和确诊病例；同时基于卫生电子监测网络和疫情管理系统，及时向朝圣协作和执行委员会及WHO反馈疫情管理信息。
沙特阿拉伯通过对已有MERS病例评估，已完成全国以区域为单位的MERS感染风险地图；同时加强对动物健康的监测，尤其是骆驼；持续增强动物卫生工作者的防范意识是加强MERS风险应对的重要措施。
WHO在其指南中指出对单峰骆驼进行免疫的兽用疫苗策略可能是阻止人类MERS疫情暴发的最佳方式，即给中东、东非等繁育地的单峰骆驼接种疫苗，预防MERS病毒在单峰骆驼之间传播及从单峰骆驼传给人类。目前尚无上市的针对人类的MERS疫苗，仅少数几种正在研发中。
对接收患者的医疗机构实施严格的隔离和消毒措施，减少或避免在医疗机构内由直接或间接接触导致的感染。
相关部门提醒到中东地区旅行的人员注意防护；同时，提醒社区防控人员关注MERS相关信息，关注中东出差或旅行人员的健康动态。
任何访问农场、市场、谷仓或其他有单峰骆驼和其他动物的地方的人都应采取一般卫生措施，包括在接触动物前后定期洗手、消毒，避免接触生病的动物。避免食用生的或未煮熟的动物产品，包括牛奶和肉类，尤其是未熟的骆驼肉、未经过消毒的骆驼奶等；通过烹调或巴氏杀菌适当加工的动物产品可以安全食用，但也应小心处理，以免与未煮过的食物交叉污染。