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由于消化道疾病早期临床表现并不明显，大多数疾病起病缓慢，没有引起足够的重视或得到及时的治疗，容易进展形成各种慢性疾病，甚至肿瘤，例如胃癌多由早期的慢性萎缩性胃炎经过肠化生逐渐进展而来。
第一，要注意未病先防。未病时养生健体，提高机体抗邪能力，防止病邪侵害，正如《素问·上古天真论》中所说：“法于阴阳，和于术数。食饮有节，起居有常，不妄作劳，故能形与神俱，而尽终其天年，度百岁乃去。”“虚邪贼风，避之有时。恬惔虚无，真气从之，精神内守，病安从来。”应做到顺应自然，外避邪气，形神兼养，益肾健脾，劳逸适度，调摄饮食，配合针灸、推拿、药物调养，养成良好的饮食习惯，避免不良的饮食和活动。
第二，要重视既病防变。不要忽视早期疾病的表现，早期诊断，及时治疗，防止病情迁延进展。如治疗消化道肿瘤的一个重要理念就是预防复发和转移。
第三，要注意愈后防复。疾病治好后，要注意复发的可能，如结肠息肉的患者需定期进行肠镜检查，防止复发，同时要注意生活习惯，谨防劳复、食复和药复。
《素问·至真要大论》说“微者逆之，甚者从之”，“逆者正治，从者反治”。逆者正治，即采用与病症性质相反的方药的治疗原则，适用于疾病征象与本质相一致的病症，包括寒者热之、热者寒之、虚者补之、实者泻之；从者反治，即采用顺从病症的外在假象而治的治疗原则，适用于病情发展比较复杂，或病势危重，出现假象症状，疾病征象与本质不完全符合的病症，包括热因热用、寒因寒用、塞因塞用（如脾虚胀满、久病气血阴阳不足所致的便秘应以补开塞）、通因通用（如食积腹痛泻下不畅、痢疾腹泻、热结旁流应消导泻下）。
治疗疾病时应先分清疾病征象与本质之间的关系，从而选择合适的治则和治法。一些顽固的脾胃病容易出现很多假象症状，尤其是一些慢性胃病出现热象时应尤其引起重视，要仔细地进行鉴别，到底是真热还是假热。笔者发现临床上慢性胃病的患者基本上以假热（虚热）多见，此时运用清热法要中病即止或寒热并用，或直接使用以理中丸、四逆汤等之类的温阳散寒法。
标本指疾病的表现和本质。治病求本指治疗疾病时必须透过疾病的表象，分析病因病机，抓住并针对疾病的本质进行治疗。
由于多数胃肠病为本虚标实之病，因而在治疗的过程中要注意固护脾胃，避免脾胃受损而抗邪无力。同时，对于急需解决的病理表现，应首先解除。正如《素问·标本病传论》所言“小大不利治其标，小大利治其本”，意为凡是出现了大小便不利的，应先通利大小便以治其标，若大小便通利则可治其本病。这可以引伸到很多方面，如消化道大出血时要先止血，暴泻时适当止泻，疼痛剧烈时先予止痛。
标病与本病错杂并重时标本兼治，例如慢性萎缩性胃炎伴有肠化生时，脾胃虚弱为病之本，肠化生为病之标，两者相互错杂，难以速愈。笔者在治疗该病时，遣方用药注重固护脾胃，同时不忘根据不同证型辅以行气消胀、清热祛湿、解毒抗癌、活血祛瘀等疗法，标本兼治。
扶正即扶助正气，增强体质，提高机体抗邪能力，达到战胜疾病、恢复健康的目的。祛邪即祛除邪气消解病邪侵袭和损害，抑制亢奋有余的病理反应。
由于脾胃病多为虚实夹杂之病，临床上常扶正与祛邪结合治疗脾胃病。笔者认为临床治疗需注意两点：一是针对虚证，应健脾土，助中运，补益当以清补，缓缓图之，避免刚阳太过损伤胃阴，或阴柔滋腻以碍脾土，如一味蛮补则有害无益；二是对于虚实夹杂之证或者实证，慎用攻伐之品，攻中寓补，攻而不伐，中病即止，以尽量减少脾胃的负担。由于胃直接与药物接触，脾多虚证，因而要减少脾胃的负担，处处留意勿伤脾胃之气，诚如《格致余论》所云“攻击宜详审，正气须保护”，祛邪不伤正。
调整阴阳指根据机体阴阳失调的具体情况，损其有余，补其不足，恢复人体阴阳的相对平衡，治则核心是以平为期。
在八纲辨证中，阴代表里证、虚证、寒证，阳代表表证、实证、热证，而阴阳的含义远不止这些。治疗脾胃病，始终要有阴阳观。由于胃易热易实，脾易寒易虚，在治疗脾胃病时，胃病常需泻其实热，脾病常需补其阳气。寒热错杂者，常用半夏泻心汤、枳实消痞丸、黄连汤、乌梅丸等方剂平调寒热虚实、辛开苦降。同时也要处理好阴药和阳药之间的比例、主次等问题。
调理精气血津液是针对精气血津液失常这一基本病机的治则，其原则为“有余泻之，不足补之”。
脾主运化水谷和水液，主统血，主升，为后天之本、气血生化之源；胃主收纳和腐熟水谷，主通降。脾胃的功能异常则会导致纳运无力、气血亏虚，气虚则气血津液运行无力，久病易因虚致实，形成气滞、血瘀、水停之疾；水液无以运化，停聚于体内，聚湿生痰，进一步困阻脾；脾不统血，则血溢脉外；气机升降失常，清阳不升，浊阴不降，导致“清气在下，则生飧泄；浊气在上，则生
胀。”
笔者认为，治疗脾胃病时还要关注精气血津液的变化，气血亏虚则补益气血，水湿内停则运脾化湿，气不摄血则益气摄血，清阳不升则益气升清，瘀血内阻则活血化瘀。如化疗药物引起的消化道反应，辨治时应该注重在气、在血。在气则有恶心、呕吐、嗳气、呃逆、腹胀、便秘、泄泻等不同；在血则有面色苍白、爪甲色淡、头晕、心悸、失眠、白细胞降低、血小板减少等不同。在气则调气，在血则理血。及时调整治法，避免诊治延误时机。
中医始终以五脏为中心，治疗脾胃病亦是如此。临床上可以运用五行学说、脏腑关系和脏腑特性进行调理，三者又相互联系。
虚则补其母，如益火补土、培土生金。如临床上某些咳喘病，需要用到健脾法，参苓白术散就是代表。再如某些泄泻，需要用到益火法，肾气丸、四逆汤即是代表。
抑强扶弱，如抑木扶土、培土制水。如肝硬化导致的腹腔积液，经常会用到胃苓汤、实脾饮等就是这个道理。
（1）注重通补：
五脏藏精气而不泻，故脏病多虚，脾属脏，易现气虚、阳虚之疾，虚则补之；六腑传化物而不藏，故腑病多实，胃肠属腑，常有寒客热积、饮食停滞之患，实则通降。
（2）升降有节：
脾气主升，以升为顺，胃气主降，以降为和。脾升胃降，相反相成，升降相因，共同构成人体气机升降之枢纽，脾胃只有保持舒达通降之性，才能奏其纳食运化之功，因而脾气下陷当益气升提，胃气上逆当降逆和胃。
（3）燥润适宜：
“太阴湿土，得阳始运；阳明燥土，得阴自安”，脾喜燥恶湿，当甘温燥湿；胃喜润恶燥，当甘寒生津或清热润燥，因而用药时应遵循脾胃燥湿相济的关系，润燥适宜，寒温有制。
（4）疏肝胆，调气机：
肝主疏泄而调情志，性喜条达，具刚柔曲直之性，肝木冲和，气机畅达，即气血平和。若情志不畅，肝木不能条达，则肝体失于柔和，以致肝气郁结，气郁又可导致湿、痰、食、热、血等诸郁，变生多端。肝和脾胃关系密切，五行中分属木和土，肝能够促进脾胃的运化。肝气郁结，势必克伐脾胃之土，致脾胃受纳和运化失司，痛、胀、呕、嗳诸症迭起。
（5）培补后天，重视先天：
脾胃居中州，脾主运化，胃主受纳，脾升胃降，共同完成水谷的消化吸收和输布，为气血生化之源，后天之本。肾藏精，内育真阴真阳，乃先天之本。先天后天相互资生，脾之阳气必须借助肾阳的温煦，始能健运，肾中精气又赖脾运化的水谷精微不断补充，先天和后天相互依赖、相互资助。
三因制宜是整体观念的具体体现，包括因时制宜、因地制宜和因人制宜。三者应相互配合，共同加强治疗效果，在脾胃病中，除了对应的治疗外，还应注意饮食，可以结合饮食辅助治疗。
指治疗遵循时令节律特点，年、月、日的时间变化规律，主要分为季节、月令和昼夜。在治疗脾胃病时，注意“用寒远寒、用凉远凉，用温远温，用热远热”。
例如慢性萎缩性胃炎患者出现口腔溃疡者，如果发生在冬天时，笔者不会多加清热解毒之品，而是以发散郁火为主，可选用补中益气汤、升降散等加减。
是根据不同地域环境特点来制定适宜的治疗原则，《素问·异法方宜论》“黄帝问曰：医之治病也，一病而治各不同，皆愈何也？岐伯对曰：地势使然也。”对东、南、西、北、中等地域治法各有所宜进行描述，也可应用于脾胃病，说明治疗脾胃病时可根据地理位置进行诊疗。
笔者地处江南湿地，发现患者中湿气偏盛的情况非常常见，因此在笔者的处方中，化湿法经常贯穿于治疗的始终。有些患者舌苔不厚，笔者亦会根据其症状而略施化湿之品，往往其功甚捷。
指根据患者年龄、性别、体质的不同特点，来制定适宜的原则。对于老幼体弱之人需注重固护脾胃，或攻补兼施，慎用峻猛之药，脾阳虚者慎用攻下或耗损阳气之药，胃阴虚者应保护胃中津液，慎用苦燥伤阴之品。