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为了更好地评价医院信息化建设成效，指导医院科学开展信息化建设，构建全面、客观、量化的评价方法至关重要。任何评价方法和指标内容都是根据业务需求设立的，但因角度和覆盖业务内容不同，对医院信息化的评价发展出了许多专项内容。主要可以分为两类：
综合评价类，即全面评估医院整体信息化建设情况。该类评价通常比较宏观地对整个医院的信息化建设理念、人员与设备配备、信息系统功能覆盖范围、系统应用情况、信息化效益等内容进行全方位评估。
专项评价类，即针对信息化建设的某个方面、某类系统进行评估。专项评估往往能够进行深入与量化的考察，形成比较细致的评估结果。例如：电子病历系统应用水平评估、信息系统对医院运营管理支持能力评估、信息人员水平评估、系统连续性评价、信息安全评估等，医院信息互联互通标准化成熟度测评属于此类。专项评价因针对性强、评估指标明确、考察数据容易获得等特点，应用比较广泛。
常见的医院信息化建设评价方法包括专家共识指标、调查问卷、现场调研、功能点评分、数据分析等多种，其中通过专家共识确定指标、通过调查问卷和现场调研获得数据的方法，执行简单方便、评价成本较低，应用最广。但这类方法存在评价结果受专家与调查对象影响因素大、结果不够稳定、大范围获取数据难度大等缺点。功能点评分、数据分析等方法具有很好的客观性和结果稳定性，但由于指标设计困难、执行难度大，应用广度受到影响。近年来，随着互联网+、云计算、大数据等新兴技术深度应用，医院信息化建设评价可能通过互联网与云端的大量基础数据获得新的方法。
美国一家咨询组织HIMSS Analytics提出的EMR Adoption Model（EMRAM）评价模型，是目前在美国比较有影响的、针对电子病历系统应用水平的评价方法，每年在美国和加拿大使用这个模型对医院进行评价。在EMRAM模型中，电子病历的应用水平被分为0～7级共8个等级。通过回答调查问卷中的一系列问题，并将答案经过特定的模型归纳处理，可以将医疗机构电子病历的应用情况划分为相应等级，目的是提升临床记录的合法性、降低处方差错、与医疗指南紧密接轨、增强患者访问其医疗记录的可及性、确保临床医生和医院共享临床数据等。该模型采用定量评分、整体分级的方法进行评价，但未对应用范围给出评价。
美国经济复苏及再投资法案（ American recovery and reinvestment act ，ARRA）提出以后，美国医疗保险与医疗救助中心（Centers for Medicare and Medicaid Services，CMS）向国会提交了一系列指标用于评价医疗卫生机构是否“有效使用（Meaningful Use）”了电子病历系统。CMS提出“Meaningful Use”是为了鼓励70万临床医生和5000家医院积极使用电子病历系统，提高医疗质量和效率。“Meaningful Use”将医疗安全、效率、质量等要求归纳为25个应用考察项目，并确定其中必须应用的内容和可以由医疗机构选择应用的内容，通过考察这些内容的应用情况，确定医院或诊所是否实现了电子病历的有效应用。该评价方法为对医院和诊所使用的电子病历系统进行应用质量评价提供了可行方法，能够有效提升临床记录的合法性，降低处方差错，与医疗指南紧密接轨，增强患者访问其医疗记录的可及性，确保临床医生和医院共享临床数据。但此方法未对功能进行全面考察，也缺乏对应用层次、水平的分级。
国家卫生信息技术协调办公室（Office of the National Coordinator for Health Information Technology，ONCHIT）是美国专门负责国家卫生信息技术的协调管理部门，依据相关规定，自2012年10月起，联合国家标准与技术研究院（National Institute for Standard and Technology，NIST），对卫生信息技术（HIT）产品进行信息技术测评与认证。在HIT测评和认证中，ONCHIT负责颁布法律规章和认证标准，NIST负责制定测试程序、测试数据和测试工具，测试和认证机构负责对照标准和规范评估某个完整的电子健康档案（electronic health record，EHR）产品或EHR模块的符合程度（conformance testing）和功能（functionality）。
医疗信息系统集成（integrating the healthcare enterprise，IHE）是1997年由美国医疗信息和管理系统学会（Cealthcare Information and Management Systems Society，HIMSS）及北美放射学会（Radiological Society of North America，RSNA），为了实现医疗信息系统间信息交互、集成与共享，共同发起成立的。IHE以改善和提高医疗信息共享水平为目标，在现有《标准化卫生信息传输协议》（ Health Level Seven ，HL7）和《医学数字成像和通信》（ Digital imaging and communications in medicine ，DICOM）等互操作标准的基础上，建立了一套规范的工作流程和技术框架。基于HL7的IHE Connectathon测试包括医疗企业模拟器和分析仪（medical enterprise simulators and analyzer，MESA）测试，即自测系统和Connectathon互测，通过模块化功能性测试方法，测试IHE部件的功能性、系统安全性和各厂商系统的互联互通。
美国Gartner公司对于电子病历的发展阶段提出5个等级的划分方法，并不断对这种方法的具体评价内容进行修正。Gartner电子病历功能分级评价从医生应用的角度出发，将电子病历的发展分为数据采集、文档管理、助手、工作伙伴和业务指导5个逐步提高的阶段。该模型主要针对系统功能进行评价。
由Health Infoway公司提供HIT方案认证服务，目的在于降低HIT投资和购买风险，促进可信的、互操作的HIT技术应用，确保全国范围内标准的一致性。Health Infoway公司制定认证评估准则，HIT开发者提出申请，Health Infoway公司实施评估和认证。认证过程遵循包括隐私、安全、互操作性、管理4个领域的一系列标准。
国家医疗健康信息互联互通标准化成熟度测评由医院信息互联互通标准化成熟度测评和区域全民健康信息互联互通标准化成熟度测评两部分组成。其中，医院信息互联互通标准化成熟度测评是对各医疗机构组织建设的以电子病历和医院信息平台为核心的医院信息化系统进行标准符合性测试，以及对互联互通实际应用效果进行评价；区域全民健康信息互联互通标准化成熟度测评是对各级卫生健康委组织建设的以电子健康档案和区域全民健康信息平台为核心的区域全民健康信息化系统进行标准符合性测试，以及对互联互通实际应用效果进行评价。互联互通测评旨在促进卫生健康信息标准的采纳、实施和应用，为国家-省级-地市-区县四级平台之间、医疗卫生机构与区域平台之间、医疗卫生机构之间以及医疗卫生机构内部应用系统之间的标准化互联互通和信息共享提供技术保障。除互联互通测评外，国内还有一些其他医院信息化方面的应用测评。
该评价目的在于全面评估各医疗机构现阶段电子病历系统应用所达到的水平，建立适合我国国情的电子病历系统应用水平评估和持续改进体系；使医疗机构明确电子病历系统各发展阶段应实现的功能；为各医疗机构提供电子病历系统建设发展指南，引导医疗机构科学、合理地发展电子病历系统。评价对象为已实施以电子病历为核心医院信息化建设的各级各类医疗机构。
电子病历系统功能应用水平划分为0～8级共9个等级。电子病历分级评价每个等级的标准包括电子病历系统局部的要求和整体信息系统的要求。采用定量评分、整体分级的方法，综合评价医疗机构电子病历系统局部功能状态与整体应用水平。根据《电子病历系统功能规范（试行）》《电子病历应用管理规范（试行）》等规范性文件，确定了10种角色39个项目的评价内容。电子病历系统应用水平分级主要评价三个方面：电子病历系统功能状态、电子病历系统有效应用范围和电子病历系统应用的基础环境。
该评估目的是明确医院智慧管理各级别实现的功能，为医院加强智慧管理相关工作提供参照；指导各地、各医院评估智慧管理建设发展现状，建立医院智慧管理持续改进体系；完善“三位一体”智慧医院建设的顶层设计，使之成为提升医院现代化管理水平的有效工具。评估对象为应用信息化、智能化手段开展管理的医院。该评估仅针对医院管理的核心内容，从智慧管理的功能和效果两方面进行评估，评估结果分为0～5级共6个等级。
该评估目的是建立完善医院智慧服务现状评估和持续改进体系，评估医院开展的智慧服务水平；明确医院各级别智慧服务应实现的功能，为医院建设智慧服务信息系统提供指南，指导医院科学、合理、有序地开发、应用智慧服务信息系统；引导医院沿着功能实用、信息共享、服务智能的方向，建设完善智慧服务信息系统，使之成为改善患者就医体验、开展全生命周期健康管理的有效工具。评估对象为应用信息化、智能化手段开展管理的医院。该评估仅针对应用信息系统提供智慧服务的二级及以上医院，对医院应用信息化为患者提供智慧服务的功能和患者感受到的效果两方面进行评估，评估结果分为0～5级共6个等级。