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估计全国儿童血清维生素A、E水平分布的步骤如下：
（1）使用北京和合LIS系统中所有儿童保健门诊有效样本估计全国没有反复呼吸道感染症状儿童血清维生素A、E水平的分布；
（2）使用课题组中反复呼吸道感染患儿的有效样本估计全国有反复呼吸道感染症状儿童血清维生素A、E水平的分布；
（3）将反复呼吸道感染层的总体层权设定为20%，相应的非反复呼吸道感染层的总体层权设定为80%（注：由于儿童保健门诊为无明显患病症状的健康儿童，而全国儿童中仅有73%的健康儿童，因此推算全国儿童血清维生素A、E水平分布时将高估全国儿童血清维生素A、E的水平）。将两个独立随机样本的分布及其分布特征按各层的总体层权进行加权计算获得总样本的分布及其分布特征。以2016年底的儿童人口作为总体规模（目前已经公布的最新人口统计数据，同时又比较接近跨越几年的数据采集期的中间点）来估计全国儿童中血清维生素A、E缺乏的人数。具体估计步骤如图14：
图14 估计全国儿童血清维生素A、E水平分布的研究思路
由于各省市自治区饮食习惯、生活水平的不同，各省市自治区儿童血清维生素A、E水平存在一定差异。分省统计北京和合LIS系统儿童保健门诊和课题组反复呼吸道感染儿童的血清维生素A、E水平的均值及标准差，如表3和表4：
表3 各省市自治区保健儿童和反复呼吸道感染儿童血清维生素A水平的均值及标准差（mg/L）
表4 各省市自治区保健儿童和反复呼吸道感染儿童血清维生素E水平的均值及标准差（mg/L）
由于各省市自治区儿童血清维生素水平存在差异，因此在估计全国没有反复呼吸道感染症状儿童血清维生素A、E水平分布和具有反复呼吸道感染症状儿童两层总体血清维生素水平分布时，根据是否考虑血清维生素的地区差异，可以从三个视角来分别估计：
不考虑儿童血清维生素A、E水平的地区差异。将LIS保健门诊和反复呼吸道感染组儿童视为两层总体的简单随机抽样。
考虑儿童血清维生素A、E水平的省份差异。先分别计算各省市自治区儿童有/无反复呼吸道感染症状儿童的血清维生素分布（即采用分层分别估计）；再按照2016年该省14岁以下儿童人口比重加权得到各省市自治区两层总体血清维生素分布，即将LIS保健门诊和反复呼吸道感染儿童视为两层总体的分层随机抽样。
分层估计是在每一层中按照简单随机抽样估计简单估计量，然后按照层权进行加权得到估计量。其中层是：如果总体单元之间的差异较大时，可先将总体按照其某种属性划分为若干层。每一个层可视为一个子总体，同一层内的个体在目标变量上取值相近，不同层间的个体在目标变量上取值差异较大。层具有层内差异小，层间差异大的性质。
总体均值的估计公式：
考虑儿童血清维生素A、E水平的地区差异。由于一些省份如上海、甘肃等没有采集到数据，因此参考国家统计局对于地区的划分标准，将全国划分为东部、中部、西部、东北四个地区。先分别计算这四个地区儿童有/无反复呼吸道感染症状儿童的血清维生素分布（即采用分层联合估计）；再按照2016年该地区14岁以下儿童人口比重加权得到各地区两层总体的血清维生素分布，即同样将LIS保健门诊和反复呼吸道感染组儿童视为两层总体按地区的分层随机抽样。
当有些层的样本量较小时，可将若干样本量较小的层进行合并形成一个较大的层，然后按照分层估计原理进行联合估计。
以下将分别从这三个视角来估计全国儿童血清维生素A、E水平分布。