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马尾连又称马尾黄连，始载于赵学敏《本草纲目拾遗》草部。据记载：“出云南省，药肆皆有之，干者形如丝，上有小根头，土人盘曲之以市”。具有“性寒而不峻，味苦而稍减，不似川连之厚，性能去皮里膜外及筋络之邪热，小儿伤风及痘科用”的功能，在民间常用来代替黄连使用。本品小檗碱的含量较高，是提取小檗碱的良好材料。目前在云南、四川、贵州、甘肃等其他省区也将一些植物的根茎及根称马尾连，品种甚为复杂，质量不一，需要认真加以鉴别。
草黄连、唐松草。
为毛茛科植物金丝马尾连 Thalictrum glandulosissimum （Fin.et Gagn.）W.T.Wang et S.H.Wang、昭通马尾连 Thalictrum glandulosissimum （Fin.et Gagn.）W.T.Wang et S.H.Wang var. chaotungense W.T.Wang et S.H.Wang、高原唐松草 Thalictrum cultratum Wall.及多叶唐松草 Thalictrum foliolosum DC.的干燥根茎及根。
又称多腺唐松草，云南宾川称马尾连。
干燥的根茎上端常带有多数芦头，每个芦头粗约4mm，其上残留茎苗的痕迹。根茎短，根细长而多，丛生于根茎下，形如马尾而呈金黄色，金丝马尾连之名即由此得来。根茎由数个或十余个结节连生，长1～3cm，直径2～5mm，可见茎基残痕，表面粗糙，留有鳞叶的残基呈暗棕色。质坚硬，不易折断，断面鲜黄色。根细长，常为数十条，长10～25cm，直径约1mm，外表红黄色或金黄色，有光泽，具纵向细纹，老栓皮及皮层常呈环节脱落，尚未脱落者，以手搓之即脱，脱落处呈金黄色，光滑。体轻，质脆，易折断。根茎断面外圈呈棕褐色，内有黄色木心；须根断面呈深黄色，外表为一薄层金黄色的外皮，断面平坦。气微，味极苦，嚼之粘牙。
又称昭通唐松草，云南昭通一带称马尾连。
与金丝马尾连的区别在于小叶较大，长和宽为1.5～2.5cm，表面无腺毛，叶轴上的毛长达0.4mm，单歧聚伞花序多少呈伞房状，花少数而稀疏，花药顶端钝，柱头翅宽，三角形。药材鉴别特点亦与上种相似。
云南称马尾黄连、草黄连，四川也称马尾黄连。
根茎由数个节连生，细根数十条，长5～10cm，直径约1mm，表面棕色，木栓层脱落处呈浅棕色。质脆，易折断，断面黄色，略呈纤维性。气微，味苦。
四川、云南称马尾黄连。
根茎横生，较粗壮，由数个至十余个结节连生，每个结节上面具圆形空洞状的茎痕，直径约1cm。细根数条至十余条密生于根茎的下侧，直径约3mm；表面灰棕色，质硬，易折断，断面木心呈金黄色。气微，味稍苦。
上面所述品种主要分布于四川、云南、西藏等省区，其根小檗碱含量均在1%以上，可谓马尾连之佳品，而其中又以金丝马尾连和昭通马尾连为最佳。此外，在甘肃、青海、陕西、内蒙古等省区亦有出产。
本品以根条长而均匀、不带栓皮、外表色金黄光亮者为佳。
除以上主要品种外，还有一些同科同属植物的根茎及根，其小檗碱的含量相对较少，一般不作正品马尾连收购，而在产区当地就地取材作马尾连使用，有以下几种：
为毛茛科植物贝加尔唐松草 Thalictrum baicalense Turcz.的干燥根茎及根。
药材细根数十条丛生于根茎下，细根软而扭曲，表面黄褐色。据报道，藏医以本品作为黄连的代用品。
产于四川、青海、山西、陕西、甘肃、宁夏、西藏、河北、吉林、黑龙江等地。
为毛茛科植物长柱贝加尔唐松草 Thalictrum baicalense Turcz.var. megalostigma Boivin 的干燥根茎及根。在四川若尔盖地区以本品充作马尾连。
本种与原种的区别主要在于本变种的花柱较长，一般长1～1.2cm，柱头为线形而非球形。药材性状与原种相似。产于四川西部及甘肃南部地区。
为毛茛科植物腺毛唐松草 Thalictrum foetidum L.的干燥根茎及根。又称腺毛唐松草。
外形很像高原唐松草，但柱头发育，呈三角状箭头形，瘦果更扁，有短毛可以区别。本品小叶沿脉网有短柔毛和腺毛，花梗通常有白色短柔毛和极短的腺毛。
根茎短，须根密集而生，常数十条丛生于根茎下，外表呈砖红色。
分布于四川、新疆、青海、西藏、甘肃、陕西、山西、河北、内蒙古等地。
为毛茛科植物黄唐松草 Thalictrum flavum L.的干燥根茎及根。
在根茎下密集着生多数细根，细根长5～10cm，直径约2mm，表面灰黄白色。
分布于新疆阿尔泰山区。
为毛茛科植物大叶唐松草 Thalictrum faberi Ulbr.的干燥根茎及根。
在浙江天目山称为大叶马尾连或马尾连。
根茎较短，下部密生数十条细根，细根长约10cm，直径约1mm，表面棕褐色，栓皮较疏松，常易脱落。
分布于浙江、安徽、江苏南部、河南南部、江西、福建、湖南等省地。