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《神农本草经》的命名中留下了很多珍贵的信息，从神农命名的特色可发现，其中有基原的形态、生态、习性，甚至还有针对人体疾病的治疗功效。另外，每味本草一开始就是“味”的记载，这是千年万年不变的特征！有的还有“一名”，这是神农在正名中意犹未尽的表白，或者为防止后代误认误用而再选一个或几个名称以便帮助准确识别。
我们对90味名实不清或不符，药用部位不明，传承过程字迹不清发生的误写，还有少数混入的文字进行了订正。神农命名中的信息起了非常大的作用，少数辅以功效等，就可以比较有把握地解决千年未解的谜团了。
神农命名的“荩草”，历史上一直是个谜。很长的时间，有人把“荩草”之冠戴在禾本科的一种常见杂草身上，这种植物生于林下，植物体松泡状，作为炊草燃烧会产生噼噼啪啪的爆鸣声，民间称“泡泡炸”，不耐燃。这种被戴上“荩草”之名的“泡泡炸”一直没有人采用作为治病之药，或许有人试用无功就不再提了。神农言荩草之功：“味苦，平。主久欬上气喘逆，久寒惊悸，痂疥白秃，疡气。杀皮肤小虫。”我们通过仔细阅读这段叙述可知，荩草之功有四，一平咳喘，还是久咳；二安惊悸，还是久寒所致；三治痂疥白秃等皮肤病，均是难愈之疾；四杀皮肤小虫，人身最多乃虱子。能有如此之奇功，还不是“荩草”是什么！草字头，是本草的草也，能如此杀灭人体皮肤小虫，疗皮肤疾患，还能治咳喘、惊悸，功效如此奇特，若失传太可惜了！实然转而一想，有此功的现代本草一定会被发现，核对之后与现代一种常用中药的功效相似，“味甘、苦，微温。润肺下气止咳，杀虫灭虱。”这是《名医别录》所录之“百部根”。原来，《神农本草经》已发现了荩草（彩图57），并列入365岗位之中，味、气、功效也描述得相当完整。由于传承的间断，《神农本草经》与后世本草被割裂，后来竟然不知“荩草”为何物，直至东汉期间才有名医们收集“百部根”，再到后来不断补充才使功效完整。
这也是《神农本草经》记载的一味本草，但历史上一直不知道是什么。神农描述得较简单：“石长生，味咸，微寒。主寒热恶疮，大热。辟鬼气不祥。一名丹草。生山谷。”共26字，它究竟是何物？
从生态看，生山谷，在石头上生长；一名丹草，也提示生长在荫蔽环境之中。这样看来，是一种生长在山谷、溪沟边或岩石上的草本植物。味咸，微寒，这种味气产生与石生阴暗的环境也有关系。从习性上看，长生，即一年四季常绿，岁岁生长，日日可见。在以上环境中，常绿的草本是考虑的对象。
再回到神农命名原则：所选本草多数是人们常见、资源丰富的植物。
在居住环境周围的石墙上、溪边石缝中、井口下是否长有一种四季常绿的草本植物？它有没有主寒热恶疮、大热和辟鬼气不祥之功？
还真的有！蕨类植物凤尾草四季常绿，生于阴湿石壁或石缝之中，清代吴其濬的《植物名实图考》已认识到凤尾草“或谓之石长生”。它分布于华东、中南、西南及山西、陕西等地，分布十分广泛，资源也相当丰富。
再回观一下“凤尾草”的功效：“味淡，微苦，性寒”，性寒与微寒较一致，古人往往把味与生态相联系，所以神农称之为“咸”。
凤尾草清热消肿解毒，治疔疮肿毒、喉痹乳蛾、乳腺炎、高热抽搐。这与神农描述的石长生“主寒热恶疮大热”十分一致。另外一些原因不明的疾病，古人称为“鬼气不祥”。凤尾草可治五淋白浊、乳糜尿、黄疸性肝炎等，与古人认识也有相似之处。通过这种综合考证，把已失传的神农“石长生”与凤尾草对应起来，相应的凤尾草应该由民间药提升到常用中药，历史久，作用强，资源足，安全性好。这是《神农本草经》留下的珍贵信息，使几千年后还能被准确地考证出来。
神农的“药实根”确为一味良药！神农描述为：“药实根，味辛，温。主邪气诸痹疼酸。续绝伤，补骨髓。一名连木。生山谷。”字虽不多，但功效卓著。诸痹，绝伤，这非一般本草可治，补骨髓的本草更难找，而“药实根”全具备了，真乃一味好本草！但在哪儿呢？《神农本草经》虽有著录，但后人一直没有用过！有一天，我的学生付利方从“一名”与功效相连，悟出与现代本草“骨碎补”的一致性。药实根“一名连木”，由此可知，它的生态可以附生在树木之上，这是一个非常重要的信息！现代何种本草可附生于树木？蕨类植物的“骨碎补”可以！再比较功效，竟然完全吻合现代描述的骨碎补：“味苦，性温。补肾强骨，活血止痛。主治肾虚腰痛，足膝痿弱，耳鸣耳聋，牙痛，久泄，遗尿，跌打骨折及斑秃。”多好的一味本草！把它的历史推进2 000年，对这味本草是一件有意义的大事！
别慌下定论，还有两个问题未解决，为什么神农将它的正名定为“药实根”呢？这是因为骨碎补的基原为槲蕨的根状茎，它肉质肥厚，所以神农命名为“药实根”。另外，“一名连木”，是介绍它可附生树木之干上，但槲蕨在岩壁上更多，往往成片生长，为何不叫“连石”呢？这是因为在石上生长的本草非常多，神农若用“连石”作为一名，就没有特指性了。说到这里，疑虑消失，我们可以大胆承认“骨碎补”就是神农的“药实根”了。
我们对神农命名的名称稍微留心一下，就不会出现数千年《神农本草经》两味矿物本草的药用部位错误。
《神农本草经》记载为：“味甘，平。主五藏百病。柔筋强骨，安魂魄，长肌肉，益气。久服耐寒暑，不饥渴，不老。”对“玉泉”两字直接理解，“泉”是名词，“玉”乃定语以形容“泉”，此泉是产玉的泉，而不是其他的温泉、矿泉等。对于泉中可利用之物作为本草，乃知泉水，而不会是石头或玉。后人一直胶着于固态的矿物本草，因此忽略“泉”字，只见“玉”字，最后弄成了“玉”，但“玉”如何服呢？没办法，只有砸碎成细屑煎水服之，因此后来有不少本草文献就将神农的“玉泉”改为“玉屑”。黄山产玉，我们在黄山考察时见到藏玉之处有涓涓泉水渗出，饮之清醇可口，神农之“主五藏百病”还真可能体现出来。改成了玉屑，就无法体现出“玉泉”本来的功效。
是神农命名的一味本草，神农记载为：“石钟乳，味甘，温。主欬逆上气。明目，益精，安五藏，通百节，利九窍，下乳汁。一名留公乳。出山谷。”从字面上看，仍然最后一字是名词——“乳”，而前面“石钟”乃“乳”的形容词，此“乳”从何而来？石钟上滴下来。这就是人们都知道的石灰岩溶洞中倒挂的钟乳石往下滴之水滴，神农巧妙命名为“石钟乳”，但仍不放心后人能准确领会，又用“留公乳”作为“一名”，意即一定要重视这个“乳”字，不是“石钟”，也不是“留公”。但后人仍胶着在矿物类必然是固态，甚至也可能有人认为神农粗心，把名称之字放置错了，就把“石”字移至名称之后成为“钟乳石”，岂不方便？由液态改为固态，由补益而改为破结通利，药性也完全变了！所以，我们在阅读经典时，头脑不要执着于一点，要运用自己的智慧和敏锐的思维去洞察一切。
在《神农本草经》中也发现了几个传承中由于字迹模糊而导致误读、误写的名称。前人误了，后人也照葫芦画瓢留了下来，传了很多代，以讹传讹地去理解，也没想到从源头上理一理，去做一点儿正本清源的事。
从字面上看，就是白色的刺。植物的“刺”以褐色居多，或带一点红色，白色的刺真的很难见到。作为本草，不是摘取一根两根就完事，还要有足够的量满足病人服用的需求，有效才能流传开。而神农命名的白棘，始终无法传开，因为名实未明白。神农曰：“白棘，味辛，寒。主心腹痛，痈肿。溃脓，止痛。一名棘针。生川谷。”后人仅在“棘”字上下功夫。酸枣树，灌木状，刺细长而尖锐；而枣树成乔木，刺也尖少而弯短。酸枣刺多，植株矮小，两个“朿”字并排而成“棘”，枣树高大，两“朿”竖排而成“棗”，简写则成“枣”。神农还有“一名棘针”，注意力引至酸枣上，莫不就是酸枣之刺了？但人们这样思考，怪在后来近千年也无人用酸枣的刺治病，原因在哪呢？其一，酸枣之刺尖锐细长，特别难采，很难形成药材，这是一个很重要的原因；其二，即使少数病人能有机会用上它，效果如何也很难说清，最主要的原因还是酸枣之刺是红褐色，而不是白色的，这与神农命名不符！几千年的谜团使得神农名药久久不能发挥作用，真是很遗憾！
一天，我对着白棘之功效发愣，它之功与现在的皂荚刺之功不是相同吗？皂荚刺名为“天丁”，是植物当中刺又大又粗、分支又多的枝状体，莫不就是皂荚刺？名称为何称作“白棘”呢？换一思维想一想，豁然开朗！“百”字上面一横丢了，不就成了白棘了吗？“白棘”，人们又怎能想到是皂荚刺呢？原来就是《神农本草经》传承过程中发生了小故障导致。明白了其中隐情，改“白棘”为“百棘”（彩图61），使得棘刺之王的枝枝丫丫皂荚刺与神农之名形成一个整体，原来神农这么精心设计、考虑的好名称，后人还会弄错，甚至遗失！
是一味人们未重视的本草，在牧区高山草甸上，有很多马矢蒿，很简单，它就长在牧场上，路边草地有马粪之处，土壤肥沃，最适于它的生长，它的花很漂亮，功效也明显，神农记录为：“马矢蒿，味苦，平。主寒热鬼疰，中风，湿痹，女子带下病，无子。一名马屎蒿。生川泽。”这么好的本草，后世并未重视，太可惜了！该本草名称的错乱，更是不可原谅！因神农不仅给了正名，还给了一名“马屎蒿”，已经告诉后代，“马屎蒿”名称虽然很形象，但不雅，因而正名就变成了“马矢蒿”，“矢”字比“屎”字更适合书面表达。不想后世竟把“矢”字误认为“先”字，一直称为“马先蒿”。因为《神农本草经》是本草经典，其中的命名对后世本草及生物学的命名也产生着很大影响。由于这个“矢”变成了“先”，植物分类学的玄参科马矢蒿属及各种马矢蒿，统统给带上一个错误的名称，如马先蒿属、返顾马先蒿、亨氏马先蒿等。将一个自己不小心弄错的名称传遍全世界，岂不家丑向外传扬了吗？其实不怪谁，怪我们后代在应用本草名称时，连神农“马矢蒿”这味本草的短短三十个字都无耐心看完，就草率地使用了自己认为正确的“马先蒿”，乱了整个本草界和植物界！这也告诫我们，做任何事不能不慎！汉语作为联合国六种工作语言之一，如发生失误，将会传播更远、更广，告诫我们要慎之！慎之！现在称为“石斛”的本草来自《神农本草经》，是一味非常有价值的治病强身的本草。神农曰：“味甘，平。主伤中。除痹。
下气，补五藏虚劳羸瘦，强阴。久服厚肠胃，轻身延年。一名林蘭。生山谷。”味甘，滋补之性强；平，寒热体质均可用；主伤中，即人体五藏六府虚劳羸瘦均可调整；还有除痹，下气，强阴，厚肠胃，轻身延年，多好的本草！“石斛”之名是何义，后代有很多解释，均使人感到比较勉强。在最优石觓产地的大别山霍山县，见到了药农们采到的野生霍山石觓，其肉质茎短而扭曲不直，查了《古代汉语字典》发现离“斛”字不远处有一字很相似，“觓”字，只是右侧一为“斗”，一为三笔相连而成“丩”，这个后人不留意的笔画差异，正与揭开石觓真名之谜有重要的联系。
“霍山石觓”分布于大别山北坡为主的地区，已属于蘭科石觓属植物分布的北界。这样的地区，冬天气候寒冷，降水量少，林中湿度低，所以它只能艰难地生长在裸露的岩石上，寒冷，时而干燥，营养不足，要活下去只有抱团在一起，每枝肉质茎又细又不直，只有很短的数厘米长。“觓”字指生病的小山羊角的形状，山羊之角是动物中角小的类型，当然小山羊的角更小，生病的小山羊角也呈病态，又小又不直，用此与植物界具肉质茎的石觓相比较，非常贴切。原来，石斛原名“石觓”（彩图63），于石上生长瘦小扭曲之状，在同属植物中形状独特，用“石觓”命之，可见神农用心良苦也。也许在《神农本草经》传承过程中，“丩”字的一短竖出现了断痕，而被误写成了“斗”字，合而成为“石斛”这个怪异的名称。
神农在“石觓”的“一名”中加上“林蘭”二字，以便知其联系。石觓生于石上，味甘，平，它们分布于亚热带北缘的中、低海拔山区，成为最优质的石觓。到了中亚热带和南亚热带，石觓属植物就不在石头上生活，而是爬到林中的树木之上，花色鲜艳，被称为林蘭。由此可知，神农为防后世误写误用，而想得很周到。《神农本草经》还收载了木蘭，以前被误认为是木蘭科植物，但看到它的“一名”也称“林蘭”，就知道它与“石觓”同类，因而这一类本草应该是长在树上的觓类，即后世的“木觓”，它与“石觓”生态、分布有别，气、味、功效全不一样了，“一名林蘭。生山谷。”由此看来，同属植物生态、分布有别，气味由甘平变成苦寒，功由“主伤中。除痹，下气，补五藏虚劳羸瘦，强阴”而变成“主身大热在皮肤中。去面热赤疮、酒皶、恶风癞疾、阴下痒湿，明耳目。”后来的“石斛夜光丸”原料应该是“木觓”（彩图 64）了。
在现代的植物分类学中，“ Dendrobium ”作为“石觓”这一属的属名，原来植物中文名均是石斛，看来要归真，还真不是一件容易的事，因为陋习、错误持续太久了！
《神农本草经》出现了六芝，但现在常见芝类只有赤芝、紫芝。那六芝是怎么来的，如何去区分？这一问题曾经迷惑了很多代人。
曾经我们就事论事地花了很多时间思考，又收集了一些照片，把灵芝（赤芝）不同生长阶段集中起来，出现了白色、淡黄色、红、紫，最后变成黑色。《神农本草经》是这么分的吗？
后来我们又仔细对比推敲了六芝的原文，发现了一个规律。
譬如：白芝，白者按五行入肺，其味则辛，所主之病在肺。白芝的叙述确实如此：“白芝，味辛，平。主欬逆上气。益肺气，通利口鼻，强志意勇悍，安魄。久食轻身不老，延年神仙。一名玉芝，生山谷。”
真是好啊！不仅治疗肺部疾病，益肺气，还能安魄，久食轻身不老，延年神仙！多吸引人啊！天下到处去寻此药，若寻到能成仙，岂不是“仙药”了吗？
原来六芝是“五行先生”按白色推理出来与肺相关的系列文字，那么这类本草的功效记忆也变得方便了。再看看其他颜色的“芝”，是否这样？
黄芝，从“味甘”“益脾气”“一名金芝”等信息来看，真的也是五行推衍之文！
赤芝呢？也是属火而味苦，入心，一名丹芝！
青芝呢？属木，入肝，味酸，补肝气，一名龙芝！
黑芝一定属水入肾，果真如此！
秘密原来如此！这样按五行推衍出来的药性，是临床可用的吗？这种编写，稍具一点文化的古代私塾先生，每天可以编出几十、上百也不是难事！这哪里还要神农，人人都可以比神农厉害了！
话虽然这么说，六芝是怎么来的，还是要弄清楚！再看紫芝（彩图65），《神农本草经》描述为：“味甘，温。主耳聋。利关节，保神益精，坚筋骨，好颜色。久服轻身不老延年。一名木芝。生山谷。”仔细对比以上五芝（白芝、黄芝、赤芝、青芝、黑芝）有诸多不同之处。紫芝之文明显不是那位“五行先生”推衍出来的，没有与五藏关联之词，“一名”也不是那么好听的玉、金、丹、龙、玄之类。最大的区别还有两条，紫芝功效临床可验证，而以上五芝之功效纯属人为编造。另外，紫芝是本草，“久服轻身不老延年”，而其他五芝，均是“久食轻身不老，延年神仙。”六芝中，只有紫芝是“服”，是本草，而其他五芝是“食”，这是描述食用的食品。紫芝久服成不了仙，是木上所生，称木芝，而其他五芝：玉芝、金芝、丹芝、龙芝、玄芝，食后均可成仙。
谈到这里，大家也应该对六芝有一个清晰的认识了！神农时代从不谈五行，这种五行推衍的人工文章绝非神农所为，六芝中，只有“紫芝”是神农留给子孙的！因此，我们整理《神农本草经》时，清除了这些被污染的内容，使经典又纯净靓丽而光耀全球！