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预防接种的安全性和效果取决于疫苗的种类和机体2个方面。疫苗可分为减毒活疫苗、灭活疫苗和成分疫苗。减毒活疫苗通常包括卡介苗（BCG）、脊灰减毒活疫苗（OPV）、麻疹减毒疫苗、水痘减毒活疫苗、麻腮风联合减毒疫苗（MMR）、麻腮风及水痘联合减毒疫苗（MMRV）、流感减毒活疫苗（LAIV）、甲肝减毒活疫苗、乙脑减毒活疫苗和轮状病毒减毒活疫苗等。灭活疫苗和成分疫苗通常包括乙肝疫苗、脊灰灭活疫苗（IPV）、百白破联合疫苗（DTaP）、流感灭活疫苗（IIV）、甲肝灭活疫苗、EV71灭活疫苗、肺炎链球菌疫苗（PCV/PPV）、b 型流感嗜血杆菌结合疫苗（Hib）、乙脑灭活疫苗和脑膜炎球菌多糖疫苗等。总体上，原发性免疫缺陷病和HIV 感染儿童，禁忌接种减毒活疫苗；继发性免疫功能低下（血液系统和实体肿瘤、接受化疗放疗或移植、使用大剂量糖皮质激素）儿童，应该暂缓接种减毒活疫苗；使用静脉注射免疫球蛋白或血液制品的儿童，可能影响麻疹和风疹疫苗的效果，也要暂缓接种；而灭活疫苗和成分疫苗在以上儿童接种是相对安全的。急性疾病、发热和慢性病，应该等待疾病痊愈或稳定以后再接种；除非对疫苗中的成分（新霉素、链霉素、明胶）严重过敏或对接种过的疫苗发生过严重过敏反应，否则过敏体质和患过敏性疾病不是疫苗接种的禁忌证；对鸡蛋过敏也不是接种流感疫苗和麻腮风疫苗的禁忌证。
新生儿出生时皮内注射用卡介苗，肌内注射乙肝疫苗。如果母亲HBsAg 阳性，无需考虑早产和出生体重，若生命体征稳定均要尽早接种乙肝疫苗，同时在不同部位肌内注射乙肝免疫球蛋白（HBIg），该早产儿或低体重儿满1月龄后，再按0、1、6月程序完成3剂次乙肝疫苗接种。危重症新生儿，如极低出生体重儿（＜1500g 者）、严重出生缺陷、重度窒息、呼吸窘迫综合征等，应在生命体征平稳后尽早接种第1剂乙肝疫苗。早产儿胎龄＞31周且临床情况稳定时，可以接种卡介苗。胎龄≤31周的早产儿，临床情况稳定时可在出院前接种。无论是否早产儿或低出生体重儿，新生儿期以后均应按照程序正常接。
新生儿黄疸患儿生命体征平稳，可正常接种乙肝疫苗。新生儿期以后母乳性黄疸和单纯间接胆红素增高婴儿，健康状况良好，可按免疫程序接种疫苗，不能仅依据经皮胆红素增高作为禁忌证。新生儿期以后明显的病理性黄疸患儿，暂缓接种，建议转诊到专科医生。
轻度的呼吸道感染、腹泻病等不伴有发热，不影响接种的效果和安全性；发热儿童建议体温正常3天以后再接种；中重度急性疾病者，在疾病稳定期或恢复期再进行接种。
正在口服感冒、止咳、止喘、治疗腹泻病等药物，使用抗菌药物等，均不是接种的禁忌证。过去48小时内使用过抗流感药物，避免接种流感减毒活疫苗。过去24小时内使用过阿昔洛韦、泛昔洛韦、更昔洛韦等抗疱疹病毒药物，避免接种水痘减毒活疫苗。使用阿司匹林者，谨慎接种水痘减毒活疫苗。
儿童患湿疹（包括特应性皮炎）、过敏性鼻炎、过敏性结膜炎、过敏性哮喘及食物过敏，均可按程序接种。对非疫苗成分如食物（牛奶、鸡蛋、花生等）、尘螨、花粉、霉菌、动物皮毛等致敏或过敏，按照程序正常接种。正在口服抗过敏性药物如抗组胺药物、孟鲁斯特、酮替芬等也不影响接种的效果。接受过敏原特异性免疫治疗（脱敏治疗）及抗IgE 单克隆抗体治疗期间，不影响正常接种。湿疹患儿接种时要避开皮肤有病变的部位。
对已知对疫苗中的某种成分（明胶、新霉素、链霉素、庆大霉素、多黏菌素B、乳胶等）发生严重过敏反应者，避免接种含该成分的疫苗。
如果既往接种疫苗后出现严重过敏反应，如出现血管神经性水肿，呼吸道症状（如呼吸困难、喘息/支气管痉挛、喉鸣、低氧血症），血压下降或伴终末器官功能不全（循环衰竭、晕厥、尿便失禁），或需要使用肾上腺素抢救治疗者，禁忌再次接种同一种疫苗。
不影响常规接种。
不影响常规接种。
儿童患有哮喘、慢性咳嗽、先天性心脏病、肾病综合征、肾炎、肾功能不全、贫血、糖尿病、营养不良等，更容易患感染性疾病，病情稳定或处于缓解期，均应该常规接种各类疫苗。有肛周脓肿儿童也应该常规接种各类非减毒活疫苗。既往有血小板减少或血小板减少性紫癜病史，谨慎接种含麻疹或风疹成分疫苗（麻腮风、麻疹、麻腮或麻风疫苗）。婴儿期有肠套叠病史，禁忌口服轮状病毒减毒活疫苗。
儿童患先天性脾缺如或做过脾切除者，可以按程序接种，这些儿童容易发生荚膜细菌如肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌和b 型流感嗜血杆菌感染，应该积极接种这类疫苗。
惊厥、癫痫、脑炎或脑病患者，在疾病稳定期或恢复期可以进行接种。发育迟缓/智力障碍及脑瘫患儿可以按程序接种疫苗。如果既往接种含百白破疫苗以后7天内，发生不明原因脑病，禁忌再次接种含百日咳的疫苗。如果既往接种含破伤风类毒素疫苗或流感疫苗以后6周内，发生吉兰-巴雷综合征，谨慎再次接种含破伤风类毒素的疫苗和流感疫苗。
使用静脉注射免疫球蛋白或接受过输血或血液制品，可能会影响一些减毒活疫苗如麻疹减毒疫苗、水痘减毒活疫苗、麻腮风联合减毒疫苗（MMR）、麻腮风及水痘联合减毒疫苗（MMRV）的接种效果，影响的程度与使用的剂量有关，建议根据使用的制品剂量停药3～11个月以后再接种。
应用糖皮质激素（泼尼松、地塞米松、甲泼尼龙等）可以产生免疫抑制，影响疫苗效果，增加减毒活疫苗的感染风险，其作用取决于使用剂量和途径。局部使用糖皮质激素（皮肤外涂、吸入、喷鼻、滴眼等）通常不影响接种。低剂量和中剂量使用全身糖皮质激素，治疗期间虽可以接种疫苗，但建议在原发病稳定后再行接种。每日或隔日大剂量［泼尼松或等效激素≥20mg/d，或≥2mg/（kg·d）］使用者，如果疗程在14天以内，应该在疗程完成2周以后再接种；如果疗程≥14天，则应该在疗程完成4周以后再接种。
接受糖皮质激素以外的其他免疫抑制药物（如环磷酰胺、硫唑嘌呤、环孢素A、他克莫司、来氟米特、吗替麦考酚酯等）治疗者，减毒活疫苗暂缓接种，但可以接种灭活疫苗和其他疫苗，同时建议转诊到免疫专科医生。
提示原发性免疫缺陷病的线索有反复、顽固的感染，深部脓肿，真菌感染，外周血液常规明显异常，免疫球蛋白IgG、IgA 降低，IgM、IgE 明显增高，家族中有类似患者等，对于这部分儿童建议转免疫专科医生进行诊断。如果可疑或确定诊断，原则上不能接种减毒活疫苗，灭活疫苗和其他疫苗可以接种。不同的免疫缺陷病接种的疫苗指征不同，建议转诊到免疫专科医生进行精准指导。
原则上不能接种减毒活疫苗，灭活疫苗和其他疫苗可以接种。HIV 感染患者有特定的接种程序，需要依据免疫抑制的状态而定，建议转诊到专科医生。HIV 感染母亲所生儿童的预防接种，按照《国家免疫规划疫苗儿童免疫程序及说明》执行。
使用抗肿瘤坏死因子-α（TNF-α）抑制剂（阿达木单抗、英夫利昔单抗、依那西普等），或抗B 淋巴细胞单抗（如利妥昔单抗）等抑制免疫反应的生物制剂，建议转诊到专科医生。
患白血病、肿瘤、接受抗肿瘤化疗、放疗期间，暂缓接种各种疫苗。何时恢复接种，建议转诊到血液肿瘤专科医生和疫苗免疫专家。在化疗恢复期半年以上可以开始补种灭活疫苗，减毒活疫苗的接种可根据患儿的免疫功能情况来确定。
造血干细胞移植和实体器官移植以后根据免疫功能恢复情况，决定何时接种或重复接种，建议转诊到相关专业医生。一般在半年后可以接种灭活疫苗，2年后自身免疫功能恢复正常后可以考虑接种减毒活疫苗。由于移植可能造成大部分疫苗抗体阴转，已有建议重新补种。