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肝肾综合征Ⅱ型（渐进型）是TIPS的明确适应证。有关肝肾综合征Ⅰ型（急进型）临床也有应用的病例，效果良好，肾功能和尿量完全恢复正常，但病例数太少，不足以推广，需要深入研究。肝肺综合征作为适应证，疗效还有一定的争议。胆红素超过一定的数值已作为TIPS的相对禁忌证写入专家共识，然而有些疾病，如肝小静脉闭塞症、肝窦阻塞综合征、肝静脉广泛闭塞型巴德-吉亚利综合征、急性门静脉血栓等患者的胆红素有时明显升高，甚至达到中重度黄疸的水平，但TIPS术后效果良好，胆红素逐渐下降或恢复至正常水平；因此，在实际临床工作中，淤血性黄疸患者已经成为适应证。
自发性分流性反复发作的肝性脑病进行经皮肝穿刺封堵分流道治疗，已经取得良好效果，但部分患者封堵后门静脉压力明显升高，不能缓解原有门静脉高压症症状或出现新的门静脉高压并发症。因此，有TIPS联合自发分流道封堵的个别病例报道。笔者进行了一些病例的手术，结果满意，既解决了肝性脑病的问题，也降低了门静脉压力并缓解了门静脉高压的症状。处理方式为完全封堵自发性分流道，同时应用7mm支架建立小的分流道。当自发分流性脑病合并门静脉高压症，直接进行TIPS加自发分流道封堵。根据封堵前后压力变化及其他因素，决定分流直径。