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伴有阻塞性黄疸的肝门部胆管癌患者是否需要PBD，尚存争议。目前主要有两个观点：一些学者（以日本学者为主）认为阻塞性黄疸即是需要进行PBD的指征，其中多数医疗中心选择性地对血清胆红素高于 10mg/dl的肝门部胆管癌患者行 PBD，直至胆红素低于 2～3mg/dl才实施根治性手术干预；而另一些学者则不建议将黄疸作为立即进行PBD的指征，除非出现胆管炎、长期黄疸、营养不良、低白蛋白血症、肿瘤不可切除需要进行综合治疗或未来残余肝体积（future remnant liver volume，FRLV）＜ 30% 等一系列情况，才需要进行PBD。
远端胆管的恶性梗阻往往是由于胰头癌、中下段胆管癌及壶腹部癌引起的。对于此类患者是否需要常规行PBD，仍有争论。从目前的循证医学证据来看PBD适用于术前需要进行新辅助治疗的阻塞性黄疸患者，以及合并胆道感染的患者，但是不推荐作为常规术前准备。