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环境责任审计承载着独特的功能：一方面，判断领导干部是否具备从事经济工作必需的素质和水平；另一方面，对领导干部是否遵纪守法地履行其环境职责进行评价。
环境责任审计是在经济转轨的过程中，通过对党政领导干部权力大小及其行权过程实施有效的监督，对党政领导干部行使公权力时存在的违规行为进行充分、合理的披露，维护经济运行安全，促进公权力运行合法合规等，从而提升国家治理水平，达到国家治理预期目标。作为国家审计的一项具体审计内容，环境责任审计也同样被包含在国家治理的实质内涵中，并且是国家治理体系的重要的不可或缺的子系统。与其他的国家治理体系一样，环境责任审计的最终目标是实现和完善国家治理。
（1）政府环境责任审计是反腐倡廉的利器
权力的集中必然会导致权力的滥用、以权谋私、只行使权利而不履行责任等现象出现，为防止这种现象对国家治理造成不良影响，就必须时刻监督制约权力的运行过程。从政治学的角度来审视，国家审计是以法律约束作为前提条件的特殊制度安排，其目的就是使用法律赋予的权力来对政府官员的公权力进行监督和约束，是隶属于国家监督系统的重要子系统。环境责任审计直接对权力者进行监督，发现违法违纪线索，更直接地体现出这种制约，有效地揭示腐败。环境责任的任中审计还能将审计范围前伸，以便及时发现苗头性问题、倾向性问题并及时应对。另外，审计的经常性监督特性还可以对被审计对象形成威慑力，从而切断一部分有违法违纪想法的人员将思想转化为行动的道路，有效防止腐败行为的产生，维护国家和人民的根本利益。环境责任审计不仅仅局限于常规的审计，它还具有一般审计工作所没有的一些特质。作为依法治国的有效工具之一，它还能够在执行审计工作的同时注重研究和分析腐败行为产生的特点，并且能够总结归纳出这些行为发生的规律，从而有利于在审计工作中预判腐败现象高发领域和阶段，有利于揭示和查处滥用职权、贪污受贿、失职渎职等问题。
（2）政府环境责任审计是干部管理的助手
环境责任审计将职责运行中的情况客观、公正地反馈给国家决策系统，作为其做出奖惩决定的重要依据。环境责任审计工作是审计监督、干部监督和纪检监督等在经济层面的具体体现，从对人的管理发展深化到对经济责任和职权的管理，这是干部管理在更深层次上的深化和发展。
例如，某市为了促使环境责任审计与干部管理工作更好地结合在一起，采取了以下一些措施和方法：一是针对领导干部的环境责任审计情况，在报送市领导和提交市委组织部的同时，抄送市组织部考核办，以此作为被审计领导干部和单位考核评比时的必需减分项目，对问题较多和问题性质比较严重的被审计领导干部和审计单位，经市考核办考核认定后，取消其年度优秀领导班子评选资格。二是把该地区和部门领导干部考核期间的环境责任审计情况和结果纳入年度考核工作，并作为一项重要考核指标。三是该市规定，凡是参加上级评先评优、劳动模范评选以及五一劳动奖章等评比活动的地方和部门单位的领导干部，都要经过审计部门的审核把关，而未经审计部门给出审核意见并签章的，一律不准申请和上报。四是对环境责任审计展开双向问责的尝试，既对承担环境责任的被审计单位问责也对相关的领导干部进行问责。尤其在对领导干部个人进行审计问责时，对问责过程保持谨慎性，以稳妥的方式进行问责，对基础性和普遍性的问题给予足够的重视，在问责实施的过程当中发现问题并且解决问题，推进党政领导干部更好地履行环境责任。
（3）政府环境责任审计是深化改革的助推器
为了正确、有效地贯彻党的十八大以来提出的“四个全面”战略布局，实现环境责任审计参与国家治理体系的目标，作为以权力监督制约权力的一项制度安排，需要环境责任审计以更加独立、超脱的视角去行使监督权，才能够在国家治理体系中发挥“免疫系统”所应该具有的预防、监督和控制重大风险的作用和功能。国家治理在改革的过程中不断进行自我突破以及向前发展，环境责任审计的内部创新对国家正在进行的改革具有良好的推动作用。通过逐渐扩大环境责任审计所涵盖的范围，加大环境责任审计的监督力度，全面、科学地评价领导干部的环境责任，促进地方环境可持续发展，对建立健全相关制度起到很好的助推作用。
（1）鉴定评价功能
领导干部承担的环境责任相较其他责任更为重大，所以，对这种环境责任的审计也必须更加科学与谨慎，环境责任审计所承载的功能也就更需要强大。其鉴定评价结果不仅可以对被审计单位或部门的财务状况及运行的合规性、合法性进行认证，还可以通过与一些审计标准比较，对审计事项进行总结、分析、梳理，肯定成绩，指出问题，做出评价，并将在审计报告中披露这些内容作为领导干部评价的重要证据。特别是某些特殊岗位在特殊工作中的履职情况，更应成为环境责任审计重点关注的部分。
（2）监督预防功能
领导干部的环境责任履行情况，不仅能够反映出其个人环境活动的执行情况，也能够反映出被审计单位对环境活动的执行是否合法合规。环境责任审计一方面查明错误，界定环境责任，揭露违法违纪行为，促进被审计单位环境活动规范、合规；另一方面，可以强化领导干部的环境责任意识，预防环境犯罪，从而保护干部。特别是配合某些重点工作实施的环境责任审计，会把环境项目及环保资金的管理、分配、使用等情况作为必审的重点事项。
（3）评估服务功能
国家治理说到底是人的具体行为，环境责任审计以评价人的环境责任履行情况为中心，以此来对国家治理过程中权力的授予和执行进行有效的约束和监督。党政领导干部是国家政策的贯彻者和履职者，环境责任审计最终是对环境政策的贯彻者和履职者的相关责任进行审核和鉴证。因此，环境责任审计通过对环境政策的贯彻者、履职者落实国家政策的情况、财政财务收支的情况等环境事项的真实性、合法性、效益性等进行审计检查，评价工作成果，得出相应的审计结论。环境责任审计重点关注政府所作的关于重大支出项目的安排情况是否合法合规，关于重大投资项目的立项合规情况是否真实公允，关于国有资源开发利用是否合理并且有效，以及国有资产处置等重大环境事项相关的决策情况等。环境责任审计通过关注这些事项来评估政府部门对国家政策的真实执行情况，同时评估领导干部是否积极主动地对环境进行合理的管理，以及是否对社会热点问题给予了应有的关注并做出正确的应对。上述领导干部的综合履职能力能够客观地反映出国家治理综合水平，因此，需要对这些能力进行客观公正的评价。