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碳酸盐岩地区的岩溶研究先例很多，研究方法也很多，使用TCRM的研究先例比较多。如何在碳酸盐岩研究中找出创新点，是本研究的重要出发点。碳酸盐岩的TCRM研究中，有和物理、化学等学科交叉研究的先例，本研究试图将碳酸盐岩的TCRM研究和信息学技术的进展相结合，从而形成本研究的创新点。将碳酸盐岩的TCRM研究和信息学技术的进展如何结合是需要仔细思考的问题。使用碳酸盐岩的偏光显微图像进行碳酸盐岩地区的岩溶研究，是本研究的重要创新之处。在以往的碳酸盐岩地区岩溶研究中，传统碳酸盐岩研究方法是比较广泛使用的研究方法。TCRM不能说不是好的碳酸盐岩研究方法，其优点很多，比如可信度高、可重复性强等；同样地，它的缺点也很多，比如研究比较费时，研究消耗的人力成本不低，对研究设备要求很高，研究成本也比较高，和信息科学的结合程度也需要进一步提高。对一种科学研究方法，必须尽可能地发扬该方法的优点，减少该方法缺点对实验结果的影响。在碳酸盐岩的TCRM研究中，碳酸盐岩的偏光显微图像广泛地应用于碳酸盐岩的岩性分析，是很常见的碳酸盐岩岩性分析研究手段。而本书也试图使用碳酸盐岩偏光显微图像做岩溶研究，这在以往的岩溶研究中是不多见的。和碳酸盐岩的TCRM研究相比，碳酸盐岩图像分析岩溶研究获得研究结果的速度比较快，在时间花费上有明显优势；相对于碳酸盐岩的TCRM研究对劳动强度的要求，碳酸盐岩图像分析岩溶研究劳动强度明显低得多；相对于碳酸盐岩的TCRM研究对碳酸盐岩历史研究数据的利用程度，碳酸盐岩图像分析岩溶研究对碳酸盐岩的历史研究数据利用率明显更高；相对于碳酸盐岩的TCRM研究对硬件设备的要求，碳酸盐岩图像分析岩溶研究对设备的要求明显低得多，只要有多数岩石实验室都有的偏光显微镜和计算机就可以了，多数是目前碳酸盐岩实验室已有的实验设备，不会产生新增设备要求；和碳酸盐岩的TCRM研究相比，碳酸盐岩图像分析岩溶研究对现有的经费要求比较低，主要是因为本书使用的碳酸盐岩玻片的加工成本不高，利用偏光显微镜采集碳酸盐岩偏光显微图像的成本也不是很高，而且在碳酸盐岩的TCRM研究中也需要加工碳酸盐岩的玻片进行碳酸盐岩岩性分析研究；和碳酸盐岩的TCRM研究相比，碳酸盐岩图像分析岩溶研究和信息科学结合的程度较高，比较容易随着信息科学的进步而得到发展，而碳酸盐岩图像分析岩溶研究中使用的计算机，也是碳酸盐岩的TCRM研究中常见的实验设备，因此也不需要新增设备。碳酸盐岩地区的岩溶水化学分析研究的先例很多，但通过岩溶地区的微生物进行碳酸盐岩地区的岩溶研究，也是本书的重要创新之处。传统的岩溶水化学分析多数是通过对岩溶水化学反应与岩溶作用的关系入手，较少关注岩溶水中离子与微生物新陈代谢的关系。本书着重分析了碳酸盐岩地层中含有诸如硝化-反硝化菌、硫化-反硫化菌等岩溶微生物的岩溶水与地层中所含的特有矿物如黄铁矿、钾（钠）长石等矿物的关系，探讨了碳酸盐岩地层中微生物与矿物的相互作用对岩溶作用的影响，在以往的岩溶研究中是比较少见的。在传统的碳酸盐岩研究中，文档的编写一般使用自然语言来完成，这方便了阅读却不利于程序员的理解与交流。程序员一般不精通岩溶研究，如何让程序员们理解岩溶研究中的科研需求是十分重要的工作。因此，本书使用形式语言进行文档编写等工作，有力地加深了程序员对岩溶研究的理解，使较复杂的岩溶研究以形式语言的方式表述，重要的算法使用自动机技术进行建模，取得了良好的效果，是本研究的独有创新。