埃及人最著名的科学成就,在许多方面也是最为人所知的科学成就,是365天历法的发明。尽管古人对一年的长度已了如指掌,但埃及人完成了一个重大突破:将他们的年历与广泛使用的阴历(一年十二个月,每月三十天)分开,在其他历法上取得了进步。阴历遗漏了5天,这意味着这个历法总是与季节脱节。埃及人通过创建一个太阳历来解决这个问题。在太阳历中,一年有十二个月,一个月包含三十天,埃及人又在每年的末尾多加了五天。在埃及人的日历中,每十天为一个星期,每二十四个小时为一天。一年的开始,不出所料,是在洪水来临之际。一年被分为每四个月一组的三季,对应种植、收获和休耕这三个时间段。公元前2937年到公元前2821年间,这些创新已经出现,并构成了大多数人至今仍在使用的历法。事实上,埃及人使用两个历法,一个阳历和一个阴历。阳历用于行政管理,阴历用于神庙事务管理。
金字塔揭示了古代埃及人在另一个科学领域,即数学方面,有多么精通。在一些手稿中也可以看到这种技能。这些手稿尽管是在中王国时期写下的,但反映了埃及人可能在古王国时期就已经掌握了数学知识,并且建筑师和建造者在构筑神庙与金字塔时使用了这些知识。埃及人拥有一个十进制数字系统,这个系统的特征是用不同的、独立的符号代表1、10、100及更多。埃及人还把身体部位作为衡量物体长度的主要参照物。测量的主要单位是从肘部到拇指尖的长度。这被称为前臂。反过来,前臂的长度是六个手掌的长度。艺术家运用这些测量方法绘制人体。埃及最著名的数学著作是《莱因德纸草书》。它可以追溯到第二中间期(公元前1650—前1550)的中段。它说明埃及人在分数和微积分方面很在行。
最后,埃及人对人体和医学的了解给许多希腊观察者留下深刻印象。希罗多德观察到:“每位医生只致力于治疗一种疾病,仅此而已:有些人是眼睛,有些人是头部,有些人是牙齿,有些人是肠子,还有些人是内部失调。”公元前17世纪的一本《外科学》( Book of Surgery )被认为是“我们所知的第一位科学观察者的作品,发现这卷纸草文本后,我们拥有了已知最早的科学文献”。