第一节
概述

通过基因组关联研究（GWAS）对单核苷酸多态性（SNP）进行的基因组图谱分析，我们对肿瘤的发生与发展有了更深的理解。本章我们将着重解释与个体化治疗的SNP相关的系统生物学，包括与靶向治疗相关的系统和局部SNP检测。与SNP相关的系统生物学是复杂生物系统的数学模型。根据个体化精准医学的方案，整个流程包括临床取样、GWAS基因组学分析及其诊断、系统建模进行SNP特征挖掘以及从药物库中筛选出敏感度药物以供临床应用。

如何对肿瘤、遗传性疾病和其他系统性疾病进行有效的预防，以及一旦这些疾病发生发展后，如何进行有效的治疗管理 ，对人类是一个巨大的挑战。近年来，由于“个体化治疗” 和“靶向治疗” 的兴起，在提高治疗效果方面取得了突破性进展。个体化治疗是一种新型的医学模式，为每位患者量身定制治疗方案，而非传统的统一治疗方法。检测患者的基因组图谱是个体化治疗的重要基础。临床医师以基因组图谱的信息为基础，可根据患者个体的基因组变化而进行更有效的预防和治疗 。临床研究的最新发展使医师能够通过GWAS对SNP进行分析，根据基因组图谱了解相关的肿瘤疾病的发生和发展机制，实施差异化的预防和治疗策略 。化疗也是个体化治疗的一种形式，通过干扰细胞分裂发挥作用。由于大多数化疗药物的治疗指数均较低，因此现代临床医师的目标是将个体化疗法与靶向疗法结合起来，该结合在此称为个体化靶向疗法（personalized targeted therapy，PTT）。此外，SNP图谱与其他基因组图谱进行整合来研究靶向治疗也是非常重要的，如基因组图谱组合，包括GWAS-转录组图谱、GWAS-microRNA图谱、GWAS-转录组-表观遗传学图谱、全基因组图谱（GWAS-表观遗传学-microRNA-转录组-蛋白质组）或ENCODE 。目前，如果PTT组合成功，则“个体化”和“靶向”的双重作用可以更特异性地在针对疾病治疗的同时，降低靶向治疗的毒性。遵守严谨的PTT工作流程（图2-1-1）是个体化靶向疗法有效的基础，在本章中，我们将首先介绍：①用于SNP和基因组技术的临床取样；②临床SNP检测相关的分析与诊断；③与SNP特征相关的系统模型，包括系统模型概念，用于个体化治疗和临床应用的现有系统模型；④与不同验证方法有关的个体化靶向疗法。在结论部分，我们将针对个体化靶向治疗的SNP相关系统模型的未来发展进行讨论。