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经历创业的成功与失败后，雷军也逐渐找到了创业的精髓，那就是成功不仅要靠自己的努力，还需要一个风口。只不过在刚刚走出大学校门时，雷军完全没有意识到这一点，甚至有一次已经站在风口之上，却因为自己的错误判断而选择离开，让自己错失了“飞起来”的机会。
20世纪80年代末，随着电脑的日益普及，一些居心叵测的“电脑高手”开始打起了歪主意，尝试通过编写程序攻击其他用户的电脑系统，使其电脑系统瘫痪，无法工作，借此对那些用户进行勒索。这种程序就是我们后来所说的电脑病毒。
1989年底，电脑病毒刚刚在国内出现，作为计算机专业的雷军对“电脑病毒”这个新事物产生了极大的兴趣。有一次，武汉大学机房内的电脑也不幸中毒，所有电脑都瘫痪了。在兴趣的驱使之下，雷军萌生了帮助学校机房解决电脑感染病毒的想法。于是，他拉着班上编程成绩最好的同学冯志宏一起合作，开发了一款杀毒软件——免疫90。这也是雷军继加密软件Bitlok之后，参与开发的第二款商业软件。
后来，在回忆开发这款软件的过程时，雷军说：“我们做了一个病毒免疫程序，可以让程序免受病毒侵扰。如果染上病毒，该程序可以像抖落身上的灰尘一样，把病毒清除。”
而冯志宏在回忆与雷军的合作时，说道：“当时病毒流行，就起了念头要做一个杀毒软件，两个人都有这个想法，就有了合作。当时的条件并不好，我们在外面的一个公司找了一台机器上机，两个人分工合作开发程序。因为寒假自由时间比较充裕，我们就选择在寒假进行开发。武汉的冬天特别冷，每天我们都从武大骑车到那个公司去上机，风雪无阻，脚也生了冻疮，放假时食堂吃饭不方便，我们就经常自己动手煮波纹面，直到几年后雷军还在提‘我煮的波纹面很好吃’。”
就是在这样的条件下，雷军和冯志宏成功地开发出了免疫90杀毒软件。软件上市后，售价260元一套，销量很好，雷军和冯志宏每人赚了几千元。后来，在学校老师的推荐下，免疫90杀毒软件还获得了湖北省大学生科技成果一等奖。
雷军那段时间经常研究计算机病毒问题，并且小有成果，还在《计算机世界》等刊物上发表了多篇关于计算机病毒的文章。而让雷军感到最自豪的，是当时他在权威的学术刊物《计算机研究与发展》上发表了一篇学术论文，最后这篇论文还被编入第一届青年计算机大会论文集。
至此，雷军在计算机行业内开始小有名气，大家纷纷称他是“反病毒专家”，最后连湖北省公安厅都专门找到雷军，让他去讲反病毒技术。
1990年，随着防病毒市场逐渐启动，公安部介入了反病毒软件的研发及产品管理事务。此时的雷军，在软件杀毒领域可谓崭露头角，他如果能抓住这个机会，继续深耕，很可能大有作为。然而，他考虑到自己还没有正式毕业，写杀毒软件又很麻烦，于是他暂停了对免疫90杀毒软件的后续研发。