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狗狗的消化系统内部是一个复杂又壮观的世界，栖居着大量微生物。微生物组由细菌、病毒、真菌、寄生虫和其他微生物朋友与敌人组成，对狗狗的健康至关重要，能帮助狗狗消化食物、代谢营养物质、抵御病原体、阻止毒素入侵、诱导炎症介质的产生和释放、合成和分泌消化酶、参与机体免疫和合成生长发育必需的维生素（包括维生素B 12 和维生素K），并通过释放神经递质影响大脑的健康水平。狗狗的肠道健康也与慢性疾病密切相关，这些疾病会缩短他们的寿命。
有很多不健康因素会破坏狗狗体内微生物组的平衡和多样性，包括家用化学品、环境中的化学毒物、肥料、抗生素等药物、压力、疾病和导致代谢异常的单一饮食。研究显示，和那些以热加工食物为主的饮食相比，生食更能促进微生物组的平衡和多样性，让肠道功能更加健康，还能促进消化并减少之后的过敏反应。另外，与经常吃加工食品的狗狗相比，经常吃未经加工的肉类、内脏、鱼类、鸡蛋、生骨头、蔬菜和浆果的狗狗患慢性肠病的可能性要低22%。
如果你还是对微生组的神奇性表示怀疑，让我们回过头看看前面讲到的波比吧。我们把波比的大便送到实验室进行微生物组分析，其中一位研究人员说，波比拥有他们所见过的最多样化、最强大的微生物组！还记得吗？波比只吃新鲜食物，没有吃过其他类型的食物，而且他每天都接触富含微生物的土壤。微生物生态学家霍莉·甘茨（Holly Ganz）博士一直致力于研究食物如何影响狗和猫的微生物组，她告诉我们：在显微镜下观察宠物大便时，可以看出哪些宠物能吃到新鲜食物，哪些宠物不能吃到，这是多么令人震惊。他们的微生物组差异巨大，常吃新鲜食物的宠物的大便有更丰富的微生物多样性。
你的宠物微生物组中最常见也是最重要的成员之一是梭杆菌属，增加这种细菌数量的方法之一就是喂食新鲜的、以肉类为基础的食物，本书中介绍的食谱都属于此类。抗生素是必备药品，但即使只服用一个疗程（包括止泻药甲硝唑）也会摧毁肠道中的好细菌，包括梭杆菌属。即使停止用药，宠物的肠道也永远无法恢复正常状态。但不要惊慌，研究发现，自制食物能够提高狗狗肠道中的梭杆菌属水平。
微生物组是我们热衷于研究的领域，所以本书中的食谱包含了促进肠道健康的特殊食材。我们特别选择了五类长寿食物，包括蘑菇、芽苗菜和草本植物、蒲公英、鸡蛋、沙丁鱼和其他食用鱼，部分原因是它们含有有益的营养物质、化合物和益生元纤维，这都是培育充满活力、健康的微生物组的关键因素。
益生元纤维是给肠道细菌提供营养的植物纤维。没错，宠物肠道内的微生物也是要靠食物存活的生命体。摄入富含益生元纤维的食物对于肠道健康至关重要，在www.foreverdog.com上有一个可下载的PDF文件，列出了所有富含益生元纤维的新鲜水果和蔬菜，可以作为训练狗狗时的奖励零食。
如果你的狗狗胃肠道敏感，给他吃一些高纤维食物，就能减少肠道炎症，让大便更成形，减少软便、稀便，还能促进糖分解（糖可以分解成能量）。这些都是微生物组功能良好的标志。
我们喜欢把西蓝花切成片，随身带着给狗狗当零食吃。西蓝花有助于预防癌症和2型糖尿病，还能保护小肠内壁。把切碎的西蓝花放置90分钟后再喂食，能将萝卜硫素（一种可以防止或延缓癌变肿瘤生长的植物活性物质）的活性提高2.8倍！
