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质量与能量是不断发展与完善的概念。在牛顿力学中，质量和能量是相互独立的概念，质量表示物体所含物质的多少，能量被视为加速物质运动的因素。爱因斯坦在狭义相对论中证明了质量与能量的等价关系，被认为统一了物质和能量。
质量是物质的基本属性，根据度量方式的不同质量被分为惯性质量和引力质量。爱因斯坦在创立狭义相对论后把惯性质量归结为对物质能量的度量，其在广义相对论中提出的等效原理就是以惯性质量等于引力质量这一前提为基础的。如今，惯性质量等于引力质量已经在10^-12精度上得到了验证，于是惯性质量和引力质量被认为是表征物质内在属性的同一个物理量的不同表现。更为激进的观点认为“惯性质量和引力质量的属性是相同的，甚至可以说，两种质量没有任何区别，唯一的区别是两者采用的定量方法不同”。于是，物理学家普遍认为“能量=惯性质量=引力质量”，质量与能量混为一谈是现代物理学的普遍特征，这一根深蒂固的观念为物理学带来了巨大的混乱。进一步的研究表明，场论必须拓展至复合场论，才可能从根本上解决质量与能量关系的混乱。
物质复空间理论把正负能态和正负电子态的概念引入物理学研究中，把物质的惯性质量归结为物质蕴含正能量的度量，并把物质的引力质量归结为以引力场空间的形式存在的超循环的负能态（正电子态），进而构建了物质的超循环反对称的复空间结构。物质复空间理论初步解决了引力作用的物理机制、质量与能量的关系、正反物质的关系、时间与空间的关系等根本性的物理学问题。根据相对论的绝对性原理，人类基于惯性系对能量的测量具有局限性，从而导致物质的静质量具有测量意义上的不变性。