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随着女性主义者、原住民文化活动家、生态学家等对科学的政治批判研究在库恩之后的发展，以及科学知识社会学研究和对科学文本的文学研究的发展，强大的反对声浪出现了，涉及许多不同群体。有些科学家和技术专家认为，他们领域的客观性正在被科学的社会、政治和文学研究错误地否认。还有政治保守派，女性主义和民族运动的反对者，以及生态运动的反对者。人文学科中也有反对后现代主义运动的传统人文学者（见文本框6.3）。这些群体已经形成了一种不稳定的联盟，来攻击所谓“科学大战”（Science Wars）中的新科学学（new science studies）（Ross，1996；Dusek，1998）。大量文章，无论是学术性的还是论战性的，都是为了支持和反对新科学学（Koertge，1997；Ashman and Baringer，2001）。科学大战中最著名或说最臭名昭著的事件就是索卡尔骗局（Sokal hoax）。物理学家艾伦·索卡尔（Alan Sokal）写了一篇题为“超越边界：走向量子引力的变革性解释学”（1995）的文章，其中隐含着科学学和对科学的政治批判中极为荒谬和夸张的说法。他在一份文化研究杂志上成功地发表了这篇文章，然后又揭露了自己的骗局。此后，争论双方发表了数百篇新闻报道、社评和正反两方的文章，以及从保守的政治评论员拉什·林博（Rush Limbaugh）和乔治·威尔（George Will）到各位著名科学家和人文学者写给编辑（Lingua Franca，2000的编辑）的怒气冲冲的信。至少有两名科学学研究者被剥夺了有声望的职位，一名编辑因参与作为科学斗士的科学家的投书运动而提前退休。新世纪伊始，引起大众媒体关注的科学大战之火已经渐熄，但它继续以不那么公开和明确的形式闷烧。