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有几种方法可以描述瓣膜的硅化过程。第一种是分化形态发生呈水平和垂直生长，基于对两个中心物种的分析 ［27-28］ ，描述了三个连续阶段：近端水平分化；纵向分化；远端水平分化。考虑到现代形态发生数据 ［13,21-23］ ，我们可以将水平和垂直分化的概念扩展到所有具有或多或少厚瓣膜的硅藻，不仅是海链藻或圆筛藻的室瓣膜。根据数据，任何瓣膜的形态发生都始于“水平生长”，即未来瓣膜的总体形状正在布局中。随着SDV的生长，形成带有放射状肋骨的环或带有侧肋的胸骨，直到覆盖层形成。在此阶段会沉积一些二氧化硅以增加成形结构的厚度（“垂直生长”），但通常它仍然相当薄，并且垂直生长远不如水平生长明显。随着水平生长停止，形成的瓣膜变厚并且其精细结构正在分化。我们应该注意，这些阶段不会同时发生在整个瓣膜上，而是离心式扩散：瓣膜中心区域在其边缘之前变厚，因此可以在单个样本上同时看到几个连续的硅化阶段。
微观和宏观形态发生的概念 ［29］ 扩展了形态发生的早期分析 ［10］ ，允许考虑纳米级和微米级的硅化过程。