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中医学的思想基础，系指中医学的科学思想、技术思想的线索或思维过程、思维方式的渊源和发展的根本或起点。它们是中医人员在医疗实践中所形成的关于科学和技术活动本身的理性认识。其科学思想的基础是实证和逻辑的统一，仅有实证形成不了思想，仅有逻辑难以保证其成为科学。而技术思想的基础，它是科学性、创造性和社会性的统一。中医学的科学思想和技术思想及其基础是有区别的，但从历史和现实来看，二者又是紧密相联的，往往又难以截然区分。由此，我们对中医学的科学思想和技术思想一并从结构上加以论述，大体分四个层面，医学目的和医学观、医学方法论、临床操作原理、中药学理论。