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成本核算程序是指从生产费用发生开始，到算出完工产品总成本和单位成本为止的整个成本核算的过程。成本核算程序一般分为以下几个步骤。
①生产费用支出的审核。企业对发生的各项生产费用支出，应根据国家、上级主管部门和本企业的有关制度、规定进行严格审核，以便对不符合制度和规定的费用，以及各种浪费、损失等加以制止或追究经济责任。
②确定成本核算对象和成本项目，开设产品成本明细账。企业的生产类型不同，对成本管理的要求不同，成本核算对象和成本项目也就有所不同。企业应根据生产类型的特点和对成本管理的要求，确定成本核算对象和成本项目，并根据确定的成本核算对象开设产品成本明细账。
③进行要素费用的分配。对发生的各项要素费用进行汇总，编制各种要素费用分配表，按其用途分配计入有关的生产成本明细账。对能确认某一成本核算对象耗用的费用直接计入产品成本费用，如直接材料、直接工资，应直接记入“生产成本——基本生产成本”科目及其有关的产品成本明细科目；对于不能确认成本核算对象所耗用的费用，则应按其用途进行归集与分配，分别记入“制造费用”“生产成本——辅助生产成本”和“废品损失”等综合费用科目。
④进行综合费用的分配。对记入“制造费用”“生产成本——辅助生产成本”和“废品损失”等科目的综合费用，月末采用一定的分配方法进行分配，并记入“生产成本——基本生产成本”以及有关的产品成本明细科目。
⑤进行完工产品成本与在产品成本的分配。通过要素费用和综合费用的分配，以及所发生的各项生产费用的分配，所发生的各项生产费用均已归集在“生产成本——基本生产成本”科目及有关的产品成本明细科目中。在没有在产品的情况下，产品成本明细科目所归集的生产费用即为完工产品总成本；在有在产品的情况下，就需将产品成本明细科目所归集的生产费用按一定的方法在完工产品和月末在产品之间进行分配，从而计算出完工产品成本和月末在产品成本。
⑥计算产品的总成本和单位成本。在品种法、分批法下，产品成本明细账中计算出的完工产品成本即为产品的总成本；分步法下，则需根据各生产步骤成本明细账进行逐步结转或平行汇总，才能计算出产品的总成本。以产品的总成本除以产品的数量，就可以计算出产品的单位成本。
为了进行成本核算，企业一般应设置“基本生产成本”“辅助生产成本”“制造费用”“废品损失”“销售费用”“管理费用”“待摊费用”“长期待摊费用”等科目。如果需要单独核算废品损失，还应设置“废品损失”科目。下面分别对以上科目进行介绍。
基本生产是指为完成企业主要生产目的而进行的产品生产。为了归集基本生产所发生的各种生产费用，计算基本生产产品成本，应设置“基本生产成本”科目。该科目借方登记企业为进行基本生产而发生的各种费用；贷方登记转出的完工入库的产品成本；期末余额在借方，表示基本生产的在产品成本，即基本生产在产品占用的资金。
辅助生产是指为基本生产服务而进行的产品生产和劳务供应。辅助生产所提供的产品和劳务，有时也对外销售，但这不是它的主要目的。为了归集辅助生产所发生的各种生产费用，计算辅助生产所提供的产品和劳务的成本，应设置“辅助生产成本”科目。该科目借方登记企业为进行辅助生产而发生的各种费用；贷方登记完工入库产品的成本或分配转出的劳务成本；期末余额在借方，表示辅助生产在产品的成本，即辅助生产在产品占用的资金。
“辅助生产成本”科目应按辅助生产车间和生产的产品、劳务分设明细分类账，账内按辅助生产的成本项目或费用项目分设专栏或专行进行明细登记。
为了核算企业为生产产品和提供劳务而发生的各项制造费用，应设置“制造费用”科目。该科目借方登记实际发生的制造费用；贷方登记分配转出的制造费用；除季节性生产企业外，该科目月末应无余额。
“制造费用”科目应按车间、部门设置明细分类账，账内按费用项目设立专栏进行明细登记。
需要单独核算废品损失的企业，应设置“废品损失”科目。该科目借方登记不可修复废品的生产成本和可修复废品的修复费用；贷方登记废品残料回收的价值、应收的赔款以及转出的废品净损失；该科目月末应无余额。
“废品损失”科目应按车间设置明细分类账，账内按产品品种分设专户，并按成本项目设置专栏或专行进行明细登记。
为了核算企业在产品销售过程中所发生的各项费用以及为销售本企业产品而专设的销售机构的各项经费，应设置“销售费用”科目。该科目借方登记实际发生的各项产品销售费用；贷方登记期末转入“本年利润”科目的销售费用；期末结转后该科目应无余额。
“销售费用”科目的明细分类账，应按费用项目设置专栏，进行明细登记。
为了核算企业行政管理部门为组织和管理生产经营活动而发生的各项管理费用，应设置“管理费用”科目。该科目借方登记发生的各项管理费用；贷方登记期末转入“本年利润”科目的管理费用；期末结转后该科目应无余额。
“管理费用”科目的明细分类账，应按费用项目设置专栏，进行明细登记。
为了核算企业为筹集生产经营所需资金而发生的各项费用，应设置“财务费用”科目。该科目借方登记发生的各项财务费用；贷方登记应冲减财务费用的利息收入、汇兑收益以及期末转入“本年利润”科目的财务费用；期末结转后该科目应无余额。
“财务费用”科目的明细分类账，应按费用项目设置专栏，进行明细登记。
为了核算企业已经支出，但摊销期限在一年以上（不含一年）的各项费用，应设置“长期待摊费用”科目。该科目借方登记实际支付的各项长期待摊费用；贷方登记分期摊销的长期待摊费用；该科目的余额在借方，表示企业尚未摊销的各项长期待摊费用的摊余价值。
“长期待摊费用”科目应按费用种类设置明细分类账，进行明细核算。