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系统是普遍存在的，从基本粒子到河外星系，从人类社会到人的思维，从无机界到有机界，从自然科学到社会科学，系统无所不在。系统论认为，系统是由若干要素结合而成的、具有特定功能的有机整体，它不断地同外界进行物质和能量的交换而维持一种稳定、有序的状态。
区域物流系统是区域社会经济大系统的一个子系统或组成部分。区域物流系统完全具备一般系统的条件，有自己的运动规律和发展阶段。物流系统是指在一定的时间和空间里，将其所从事的物流事务和全过程作为一个整体处理，以实现其空间和时间的经济效益。区域物流系统是指在一定的地理区域范围内，物流活动所需的基础设施、物质资料、物流主体等要素相互联系、相互制约的有机整体。
区域物流系统是由区域物流各要素组成的，各要素之间存在有机联系并具有使物流总体合理化功能的综合体。区域物流的结构是多层次、多维度的，其基本要素包括物流主体（政府、企业及服务组织）、物流客体（物流对象）和物流载体（物流基础设施等），而物流主体、物流客体和物流载体又各有其完整的结构体系，每一种要素都表现出各自不同的功能，从而形成区域物流的整体功能。所以，可以认为，区域物流是空间范围建立在区域基础之上的一种宏观物流。
基础平台系统。区域物流基础平台系统在区域物流系统中起支撑作用。区域物流基础平台是物流服务的承担方，为支撑区域物流活动高效运行提供了基础条件。区域物流基础平台是在区域物流整体服务功能上和某些环节上，满足物流组织与管理需要的、具有综合或单一功能的物流基础平台系统，包括公路、铁路、港口、机场、物流园区、物流中心、配送中心、仓库、堆场、货运场站等基础平台，也影响着第一、第二和第三产业中物流需求主体的物流外包决策，进而影响物流专业化和市场化的进程。物流基础设施是区域物流正常运行的必要条件和平台，包括线状设施和点状设施等。物流系统的物质基础要素是保证物流活动有效、协调运行的基础条件。
运营组织系统。区域物流运营组织系统包括直接参与或专门为物流市场提供物流（运输、仓储、转运、装卸搬运、配送、流通加工、组织管理等）服务的物流组织，包括第三方物流企业、运输企业、仓储企业等。物流运营组织是供应链物流渠道起点和终点的连接者，在整个物流活动过程中起着主导和决定性作用。这些企业可为本区域、中心城市、跨区域或国际物流市场提供综合物流服务、专业化物流服务或功能性的物流服务，从而形成多层次、多功能、不同主体的现代物流运营群体，即区域物流供给主体、区域物流需求主体、物流信息运营商主体、区域物流产业集群。区域物流运营主体在空间分布上具有相对集中或分散的组织特征，它们集聚货流、衔接物流作业环节，因而，其组织运作水平决定了区域物流的服务质量，其专业化发展程度直接影响着区域物流的运行效率。
供求载体系统。区域物流供求载体系统由物流对象、区域资源条件、社会物流需求与供给、生产流通消费环节中的产业运行、物流活动在区域经济社会环境背景下的产业或者行业循环系统、各类物流互动的表现形式等诸多要素构成，即区域物流客体、区域资源条件、产业部门供求条件、社会生产循环系统或市场系统。区域物流供求载体系统的功能包括：依托市场机制，协调社会物流供求关系；通过输入、输出功能，与社会经济系统实现衔接；维持区域性物流活动的可持续发展；促进宏观物流的合理化。
宏观环境系统。区域物流宏观环境是对区域物流供给主体和需求主体产生影响作用的环境主体集合，主要包括政府管理主体、中介服务主体、知识支持主体。区域物流宏观环境系统对物流供需主体有不同影响，对物流供需主体的经营活动具有直接、具体的支配力和影响力，主要功能有：体制、制度功能；法律、规章功能；命令功能；标准化系统功能；产业政策功能。区域物流宏观环境系统是物流系统的体制层，体制层对协调社会物流系统与企业物流系统的目标，促进二者有机结合和协调发展，发挥物流系统在经济生活中的特定功能具有举足轻重的作用。
区域物流的主体、客体和载体要素及其关系决定了区域物流的组织结构，物流客体要素决定了区域物流的物品类型和规模，物流载体要素决定了区域物流的空间结构。因此，区域物流总体结构往往决定了区域物流的发展水平和规模，推动区域经济活动的效率和水平。从系统论观点看，区域物流系统内各子系统之间存在杂合有机联系和相互作用，使系统保持相对稳定；各子系统具有自身的结构，构成系统的结构，这种结构保障系统的有序性，从而使系统具有特定的功能；物流系统整体又是社会经济大系统的子系统。社会经济系统构成物流系统的外部环境，外部环境的制约是物流系统形成、存在和发展的条件。
物流基础设施是区域物流系统运行的必要条件和平台，例如，综合枢纽型物流平台能够根据客户的要求，将各种功能进行有机组合，为其提供综合性物流服务，并能扩大服务范围，提供个性化增值服务。物流系统的运营组织层解决各种物流渠道之间的衔接与匹配，物流系统如何与现行的生产、流通和消费环节相适应，降低物流运营成本，提高运营效率的问题。社会物流的需求是一种宏观物流需求，涉及整个社会再生产系统和宏观产业部门。社会宏观物流需求和宏观物流供给通过物流对象和产业部门等载体来实现相互对接和互动。
区域物流系统的运行除了需要物流供给主体和物流需求主体的协作配合外，还需要由许许多多政府部门以及行业协会、商业保险等中介服务与知识支持服务的各类主体提供保障，这些机构或组织构成区域物流环境主体。区域物流环境主体对区域物流供给主体、物流需求主体的经营行为、运作管理、产业聚集、发展方式、技术支持、知识服务等产生重要影响，会影响区域物流供需主体的迁入、集聚或迁出，从而对区域物流多主体系统的整体结构、空间等形态演化产生重要影响。从系统发展的角度看，区域物流环境主体对区域物流供给主体和区域物流需求主体的发展起保障作用。