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专利信息数据来源于国家知识产权局专利检索及分析网站数据库。2019年1月1日，在该网站的专利检索项“地址”中分别输入粤港澳大湾区11个城市进行检索，可得到有关专利信息数据并建立原始信息数据库。对原始信息数据库进行人工筛选，剔除系统无法自动识别的部分，以其“地址”归属进行统计。
基于数据库“申请人”一项再进行筛选。根据《中华人民共和国专利法》，两个及以上单位合作完成的发明创造，专利的权利属于共同完成的单位。
因此，当“申请人”单位分布在粤港澳大湾区两个或以上城市时，则认定为技术创新协同关系产生。对“申请人”包含分布在粤港澳大湾区之外单位的专利，只提取粤港澳大湾区城市的专利信息。本书中，“申请日”截至2017年12月31日，按自然年份分阶段进行分类汇总，形成可用于研究分析的有效信息。最早开展合作申请专利的时间是1992年，广州的中山大学与肇庆市味精厂于该年合作申请专利1项。
如果“申请人”单位所在粤港澳大湾区城市超过两个，该项专利另重复计算，例如“申请人”为“华南农业大学、东莞畜牧科学研究所、生物源生物技术（深圳）有限公司”，则“华南农业大学、东莞畜牧科学研究所”“东莞畜牧科学研究所、生物源生物技术（深圳）有限公司”“华南农业大学、生物源生物技术（深圳）有限公司”分别各计1项专利。
本书中的其他相关数据来源：①“珠三角九市”每年公布的《国民经济和社会发展统计公报》。②“珠三角九市”每年公布的《政府工作报告》。③历年《广东统计年鉴》和“珠三角九市”的《统计年鉴》。④“香港创新活动统计”、《香港统计年刊》、《澳门资料》等。