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《内经》文章中的神、神明、神情、精明、精神、魂魄、意志、思虑、喜乐、智等为代表的很多概念，无疑与现代医学《神经系统》的神经功能是一回事；脑、髓、目、皮肤等为代表的很多组织，也无疑与现代医学《神经系统》神经组织内容的同名组织是同一回事。
现将《内经》内容体现有神明概念的篇章整理于下。
【原文】……粗守形者，守刺法也。上守神者，守人之血气有余不足，可补泻也。神客者，正邪共会也。神者，正气也。
【原文】岐伯曰：真气者，所受于天，与谷气并而充身也。
【原文】……脑为髓之海，其输上在于其盖，下在风府……髓海有余，则轻劲多力，自过其度；髓海不足，则脑转耳鸣，胫痠眩冒，目无所见，懈怠安卧。
【原文】黄帝曰：五藏者，所以藏精神魂魄者也。
【原文】黄帝问于岐伯曰：凡刺之法，先必本于神……岐伯答曰：天之在我者德也，地之在我者气也，德流气薄而生者也。故生之来谓之精，两精相搏谓之神，随神往来者谓之魂，并精而出入者谓之魄，所以任物者谓之心，心有所忆谓之意，意之所存谓之志，因志而存变谓之思，因思而远慕谓之虑，因虑而处物谓之智。
【原文】岐伯对曰：目者，心使也，心者，神之舍也，故神精乱而不转，卒然见非常处，精神魂魄，散不相得，故曰惑也。
【原文】苍天之气，清净则志意治，顺之则阳气固，虽有贼邪，弗能害也，此因时之序。故圣人传精神，服天气，而通神明。
【原文】心者，君主之官也，神明出焉。肝者，将军之官，谋虑出焉。胆者，中正之官，决断出焉。膻中者，臣使之官，喜乐出焉。
【原文】帝曰：泣涕者，脑也，脑者，阴也，髓者，骨之充也，故脑渗为涕。
【原文】真气者，经气也，经气太虚，故曰其来不可逢，此之谓也。故曰候邪不审，大气已过，泻之则真气脱，脱则不复，邪气复至，而病益蓄。故曰其往不可追，此之谓也。
【原文】五藏所藏：心藏神，肺藏魄，肝藏魂，脾藏意，肾藏志，是谓五藏所藏。
【原文】岐伯曰：心者，生之本，神之变也，其华在面，其充在血脉，为阳中之太阳，通于夏气。
【原文】岐伯对曰：夫五藏者，身之强也，头者精明之府，头顷视深，精神将夺矣。背者胸中之府，背曲肩随，府将坏矣。腰者肾之府，转摇不能，肾将惫矣。膝者筋之府，屈伸不能，行则偻附，筋将惫矣。骨者髓之府，不能久立，行则振掉，骨将惫矣。得强则生，失强则死。
【原文】岐伯曰：请言神，神乎神，耳不闻，目明，心开而志先，慧然独悟，口弗能言，俱视独见，适若昏，昭然独明，若风吹云，故曰神。
【原文】岐伯曰：神有余则笑不休，神不足则悲。
【原文】岐伯曰：心者，君主之官，神明出焉，可刺手少阴之原。
上面篇章中的《内经·素问》灵兰秘典论篇第八“心者，君主之官也，神明出焉”，使得后来的中医人士一直坚持着“心主神明”的定义，导致目前社会里，依然存在“心主神明”与西医“脑主神明”的争论。然而，无数心脏和血循环正常的植物人，无数心脏和血循环正常的偏瘫或截瘫患者，都无情地肯定了“脑主神明”的正确！这个错误的“心主神明”为何要继续坚持呢？能够改正错误，是具有勇气的人的表现。更何况这个错误，还是受几千年前社会科技条件限制出现的认识错误呢！
尤其在八正神明论篇第二十六说到的“岐伯曰：请言神，神乎神，耳不闻，目明，心开而志先，慧然独悟，口弗能言，俱视独见，适若昏，昭然独明，若风吹云，故曰神”难道对“神明”的系统组织和生理，就这样“神乎神”的口弗能言明下去吗？如果这种局面继续下去，不能改变，则说明我辈中医人还处在几千年前的社会科技水平里，没有进入到现代的社会中来。
中医学的现代化，应该是用现代社会科技水平的能力，进行“修残补缺”，从而发展起来的中医学体系。中医学抛开了对现代社会科技水平的运用，就无法谈及中医学的现代化。