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对于生物医学工程这一术语的（英语）表述，不同的国家也不同，如在欧洲称为MBES（Medical and Biological Engineering and Science），在美国称为EMB（Engineering in Medicine and Biology），在中国称为BME（Biomedical Engineering）。
对于生物医学工程学会，也是一样。欧洲生物医学工程学会称为EAMBES（European Alliance for Medical and Biological Engineering and Science），美国生物医学工程学会称为EMBS（Engineering in Medicine and Biology Society），中国生物医学工程学会称为CSBME（Chinese Society of Biomedical Engineering）。
对于刊物，也有类似的情况。美国的生物医学工程典型刊物为《生物医学工程学报》或《生物医学工程学会会刊》）（ IEEE Transactions on Biomedical Engineering ）；欧洲有《生物医学工程计算》（ Medical and Biological Engineering and Computing ）；中国有《中国生物医学工程学报》（ Chinese Journal of Biomedical Engineering ）；美国还有Biomedical Engineering Society的刊物《生物医学工程年鉴》（ Annals of Biomedical Engineering ）。