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公元657年，当时还年轻的伊斯兰教经历了它的第一次重要分裂，一个被其敌人称为“哈里哲”或“哈瓦利吉”（Kharijites或Khawarij，来自阿拉伯语中的“分离”一词）的教派发生了叛变 18 。信徒们称自己为卖主，这个称谓来源于《古兰经》中关于出卖现世生命以换取天堂里永生的经文 19 。
哈里哲派与伊斯兰哈里发国在一场关于继承权的争端中决裂，该运动希望恢复他们想象中两代人之前的伊斯兰教实践传统。当时的哈里发阿里残酷镇压了哈里哲派叛乱，后来又被该教派的一名信徒暗杀。
与许多历史运动一样，人们对哈里哲派的看法随着时间的推移和众所周知的胜者写史的影响而变化。例如，一位教会的教父爱任纽多年来一直是早期基督教诺斯替派（Gnostic）的主要权威。但1945年发现的一批保存完好的诺斯替派原始文档表明，他对这个教派的描述经常有许多明显不准确的地方 20 。异端的历史是由赢得正统地位的胜利者写就的 21 。
因此，由于主流伊斯兰历史学家多年的工作，哈里哲派一直与暴力极端主义联系在一起，但是尚不完全清楚他们的这一名声有多少是符合历史事实的。政治伊斯兰教学者奈利·拉胡德写道，哈里哲派臭名昭著的程度，与阿里的名声和地位呈正相关。另外，穆斯林学者近年来开始把该词作为一个贬义词来谴责“圣战”恐怖主义，进一步影响了对该组织的看法 22 。
带着这样的警惕，将哈里哲派理解为极端主义者可能有一定的依据。就像奋锐党一样，哈里哲派因其严格践行伊斯兰教的激情和以政治暴力来捍卫教义的激情而被人们记住。大部分的历史记录都一致认为他们是一群回头盯着伊斯兰黄金时代不放的硬核原教旨主义者，尽管他们的人生只是刚刚与这个黄金时代擦肩而过。他们的献身精神如此纯粹，以至于据说敌人都会被深深吸引而变成其信徒。
据说哈里哲派会以信仰是否纯洁正确来评判其他的穆斯林，然后杀掉那些不符合他们的穆斯林标准的人。据称他们残忍地杀害了未通过测试的穆斯林及其家人，包括女性和从子宫中剖出的胎儿 23 。他们大概相信任何罪孽都会使罪人成为伊斯兰教的叛徒 24 。
整个中世纪，基督教和伊斯兰教之间（以及内部）的战争多不胜数，无法在这里详细探讨。但在13世纪罗马天主教会发生了一件特别令人印象深刻的猎杀异端事件。活跃在法国南部的清洁派是基督教的一个教派，他们的信仰与罗马的正统信仰很不一样，行为也大相径庭。他们有着非常独特的圣礼，崇尚简朴的生活，这也与当时的天主教牧师形成鲜明对比。
一个又一个教皇派遣使者并发送信件，以越来越严厉 11的措辞敦促他们悔改。其中一些请求据说遭到了暴力的回应。最后，教皇英诺森三世召集十字军征讨异端，赦免那些“从主的葡萄园中拔除无用之根”的人所有的罪孽，并号召基督徒“用正统信仰的热情点燃为正义之血复仇的火焰——让哭号响彻天地，直到复仇的主从天降下，挫败那些叛逆和叛逆者” 25 。
伤亡惊人，导致广泛的酷刑，可能有数十万清洁派教众被屠杀，直到该教派及其支持者被彻底根除。天主教会和清洁派的冲突也直接导致了历史上最可怕的机构之一的宗教裁判所设立 26 。