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话说这王善源，虽称不上出世的高人，却也颇有来历。年轻的时候，他游历四方，给达官贵人、王公大臣都看过病，甚至还走进紫禁城，给末代皇帝溥仪把过脉。要不是他淡泊名利、看破红尘，习惯了逍遥自在、闲云野鹤的生活，累积下的家业，恐怕比杜鹃的父亲还要多许多。只是他另有追求，所以才隐居到这山野古庙，驻守扁鹊庙，不再入红尘。
但事实上，王善源的真实身份，却是中国共产党中原地下党党员，而且还是中国共产党中央特别行动科中原分队的小队长，扁鹊庙，其实就是当时中国共产党中原地下党的地下交通站。只是在抗日战争之前，中共特科的力量非常薄弱，中共特科的所有成员为了安全起见，也都分别和中央特科单线联系，所以，王善源的身份鲜有人知。加之花园口小决堤来的突然，扁鹊庙被黄河水冲毁，王善源和组织失去了联系。于是，他便决定，先尽医生的天职，治病救人、救人危难，而且既然做了男婴二五的师父，他就担当起了一日为师，终身为父的责任，带着杜鹃和杜鹃的儿子，逃离苦海，远遁他乡。
其实最初，王善源也想过留守，毕竟自己不是一个人，带着刚出月子的杜鹃和刚刚满月的二五，可谓寸步难行。可眼看黄河水越来越大、越来越猛，连扁鹊庙都被淹了，粮食眼看就吃完了，他只得横下一条心来，带着这羸弱的母子俩上了路。
事实证明，老药师王善源的决定完全正确，再耽搁几日，恐怕连逃走都没机会了。当时，扁鹊庙附近的一户村民，不肯离开祖祖辈辈安居乐业的故土，坚信洪水不久就会退去，于是便举家搬到了山顶的高地上。结果，肆虐的洪水久久不退。粮食吃完了，他们吃野菜，野菜吃完了，他们吃老鼠。最后，洪水越来越凶猛，就连宋天程派去救援百姓的搜救船，都无法穿越洪水的漩涡靠近他们。等洪水稍退，宋天程的官兵将他们接到安全之地时，一家老小，已被连日的饥饿和折磨得所剩无几了。
这一路上，要不是老药师王善源凭着自己年轻时习得的一身功夫，四处寻找野猫野狗、兔子老鼠，给杜鹃母子俩充饥，恐怕杜鹃和二五，也早就做了路边的饿死鬼了。
而大灾之后必有大疫，洪水过后，伤寒、霍乱流行。这一路上，王善源凭着自己的医术救人无数，也正因如此，才为杜鹃和二五寻到了一些衣物和被褥，也才得以觅得寄宿之所，使得母子俩在这逃亡路上，不至于衣不遮体、风餐露宿。
再说这男婴二五，这一路上，在母亲杜鹃和老药师王善源的怀里，一天天成长起来。从睁开眼睛看这个世界，到牙牙学语蹒跚学步，无不被杜鹃和王善源呵护着、关怀着。而对于杜鹃和王善源来说，这弱小的生命，就是他们在这乱世中，最开心最欣慰的希望。
随着二五一天天长大，王善源和杜鹃竟愈发惊奇起来。
这小小的二五，仿若真的沾染了扁鹊庙里的仙气，显示出了超凡的灵气。王善源以前只听说过这世上有过目不忘之人，却没想到，这小小的二五，天赋秉异，聪慧过人。二五刚刚牙牙学语，就会跟着王善源背诵汤头歌，而且仅仅听王善源背了一遍，便会咿咿呀呀地背诵了；二五刚刚学会走路，便跟在王善源身后采摘草药，而且只要教他一遍，便能辨识草药。如此天赋，令年仅半百的王善源和出身医学世家的杜鹃都惊诧不已。
二五在王善源的严格督促之下，从《汤头歌诀》、《医学三字经》、《药性赋》开始学起，五岁时，就学了《平湖脉诀》、《黄帝内经》、《伤寒论》甚至连成年人都很难读懂的《金匮要略》。而出身医学世家的杜鹃，也不忘父亲临终前的嘱托，逃亡前，将父亲的医术带了些在身上。于是，小小的二五，自然也接受了不少来自母亲的有关西医的知识。超群的天赋加上老药师王善源和母亲杜鹃不倦的教导，二五四五岁就会给人看病了，不仅懂得“望闻问切”，而且会给人开方抓药。当然，二五看病，都是以老药师王善源之名，谁又肯相信一个乳臭未干的黄毛小儿呢？