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在中美合作所紧锣密鼓地开展同时的过程中，中美双方签订了《中美特种技术合作协定草案》，并于1943年4月15日，在美国华盛顿正式签订了《中美特种技术合作协定》。
《中美特种技术合作协定》的签订仪式，较之《中美特种技术合作协定草案》的签订更为正式，中美双方的最高首脑分别指派相关人员参加了该协定的签订仪式。
出席《中美特种技术合作协定》的签订仪式的美方代表有美国海军部长欧内斯特·金上将以及美国陆军战略业务局局长，二人在该协定的签订仪式上，还就在此后的中美特种技术合作中，美国向中国派驻陆军和海军等事宜进行了商讨。当然，梅乐斯也作为美方代表出席了该协议的签订仪式，并在协议上签了字。
出席该协议的签订的中方代表本应是戴笠，然而1943年4月15日，戴笠却因故没能赴华盛顿出席该协议的签字仪式，于是由当时的国民政府外交部部长宋子文负责签署了该协议。
不过，在《中美特种技术合作协定》的协议书上，还是给时任国民党军统局局长的戴笠留出了签名的位置，以便于戴笠在以后某个合适的时间再补签该份协议。
后来，戴笠在1943年7月4日庆祝美国国庆时，在《中美特种技术合作协定》上补签了自己的名字。也就是说，在1943年7月4日，戴笠又隆重地安排了一次仪式，在当时已经在重庆乡下建成的中美合作所总部补签了这个协议。
这里，将戴笠补签协议的过程提前叙述于此，以确保读者对《中美特种技术合作协议》的签订有较为全面的了解。
1943年7月4日，军统局邀请了很多人到位于重庆乡下的歌乐山下的钟家山的中美合作所总部来参加此次《中美特种技术合作协议》的补签仪式。
主持这次合同补签仪式的美方代表，不仅有时任美国海军部部长的诺克斯上将和美国海军情报署代表梅乐斯中校，还有美国总统罗斯福的私人代表、美国《生活》杂志的总裁鲁斯。
主持这次合同补签仪式的中方代表，是国民政府外交部常务次长胡世泽和军统局局长戴笠。
出席这次合同补签仪式的有：
中美合作所美方参谋长贝乐利、美方主任秘书史密斯和中美合作所美方组长若干；
中美合作所军统参谋长李崇诗、军统主任秘书潘其武和军统组长若干。
此外，出席该补签仪式的，还有戴笠指定的军统局“三巨头”——郑介民、唐纵和毛人凤，以及军统局第一处处长鲍志鸿、第二处处长何芝园、第三处处长徐业道、第四处处长魏大铭、第五处处长沈维翰、第六处处长龚仙舫、第七处处长徐人骥和第八处处长沈醉等。
这是因为双方在业务和事务工作上需要紧密配合，他希望中美合作所与军统能打成一片，所以在中美合作所与军统的一些重要集会上，两个单位的组长和处长级的人员都要参加。
当天下午，礼堂布置一新，中悬双方国旗。仪式是在宴会前举行的，参加的人员都先坐在摆成马蹄形的餐桌前等候。五点整，戴笠领着鲁斯等和胡世泽等在热烈掌声中进入会场，在上首就座后，先由戴笠简单地表达了对鲁斯等远道而来主持这次合同签订的谢意，并介绍在场参加的人和鲁斯等见面。他用点名的方式，把每个参加的人的名字叫了一声，站起来后，便补充一句是什么职务，鲁斯微笑点一点头后便又坐下来。只有郑介民、唐纵和毛人凤三人和鲁斯握了握手。介绍完毕即由潘其武将合同的中文本宣读一遍，然后由史密斯宣读英文本，便由双方主持人在中英文本各两份上签字。接着由诺克斯讲话。他首先谈到，为了早日战胜共同的敌人——日本帝国主义而举行的合作，是符合两国共同的利益和目的的。他说美国总统对这项工作寄以很殷切的期望，相信双方今后一定能忠实地执行合同中所规定的一切，能做出出色的惊人成绩。他表示对合同中所列各点感到满意，并主动提出今后双方在合作期间，如果发现没有订入合同的问题而又为工作需要时，美国方面愿尽一切可能帮助中国。
诺克斯讲话后由胡世泽讲话。他代表蒋介石政府向美方表示最大的谢意和敬意，对美国代表诺克斯与鲁斯远道而来主持这一合同的签订极感满意，并盛赞鲁斯为美国杰出的人物。胡世泽表示中国方面一定能忠实地履行合同，今后希望在美国不断帮助下打垮日本帝国主义。戴笠和梅乐斯也在最后表示，一定能很好地履行合同所规定的事项，保证双方能做到忠诚合作，亲密无间，不负两国元首的期望，等等。
就这样，中美合作所算是正式成立了，成立以后，中美合作所快马加鞭，加速运转，美国派来了一批又一批的专家、技术人员前来，而且携带了一些先进的设备，还有武器以及炸药等。他们开始在中国按照已有的工作计划按部就班地工作起来。