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清代的科举制，一个读书人真正做到“学而优则仕”，需要经历童试、院试、乡试、会试、殿试等考试。通过童试，则为童生。院试分为岁试与科试两项，通过岁试，即可入州学，成为生员，俗称秀才；通过科试，则生员具有参加乡试的资格。乡试，三年一次，在秋季举行，又称“秋闱”，通过乡试则成为举人，其中第一名称“解元”。会试在乡试后次年的春季举行，故又称“春闱”，通过会试则成为贡士，其中第一名称“会元”。会试之后，还有保和殿覆试、殿试、朝试。前三名状元、榜眼、探花，列为一甲，称进士及第；第二甲若干人，称进士出身；第三甲又若干名，称同进士出身。
唐文治15岁通过了太仓州的童试，翌年春江苏学政夏同善主持岁试，唐文治以第六名的成绩被取入州学，从此唐文治就位于生员之列，成为一名秀才。这预示着他未来大致会走上“学而优则仕”的道路。
此时的唐文治，多数情况跟随父亲在上海读书。唐受祺在白天为唐文治传经授课，晚上则讲乡贤遗事。某晚，唐受祺提到了太仓孙子福先生。孙先生讳寿祺，道光甲辰进士，为官刑曹，刚正不阿。曾出任广西柳州知府，勤政爱民，因正直而去官。归舟经洞庭湖，暴风骤作，即将倾覆。孙子福盛服立于船头，对天发誓说：“我这个船上倘有丝毫不义之财，请上天淹死我；如果没有，我义不当死，请上天明鉴！”不一会儿，果然风浪平息，全舟无恙。唐受祺讲了这个故事后，特意交代唐文治，“廉洁者，人生之大节也。一介之取予，必须折中于道义。世界上从来没有贪财而可以修己治人的，你要好好记住。”唐文治秉训不敢忘，此后的人生，无论居官讲学，都是兢兢业业，以孙子福先生为榜样。
就此时唐文治的学问而论，已经有了扎实的儒家经典文献的基础，但如何加深对儒家经典的理解，则是其学问精进之瓶颈。而精益求精的方向，大致有两条途径：一条是注重义理思辨、心性理气的宋学途径；一条是注重章句训诂、名物度数的汉学途径。唐文治17岁受业于太仓理学家王紫翔先生，为其宋学的学习途径；而21岁求学于江阴南菁书院，师从黄以周、王先谦等经学大师，为其汉学的学习途径。
王紫翔（1842—1918），字祖畲，号漱山，太仓州镇洋县人。学宗程朱，推崇清初理学家陆陇其之学，先后讲学于宿迁、海门、崇明等地，曾任河南汤阴知县。主要著作有《读左质疑》《读孟随笔》《礼记经注校正》《王文贞公文集》等，并编纂《太仓州志》《镇洋县志》。
王紫翔与唐文治父亲唐受祺同辈，又是好友。在唐文治14岁时，王紫翔就见过唐文治，非常赞赏唐文治的文章，认为他将来必成大器，并嘱咐唐文治多读历代大家的文章，用来扩充才气。唐受祺也有意让唐文治跟随王紫翔学习。在唐文治17岁时，经由姨丈黄镜渠
的介绍，唐文治正式受业于王紫翔。唐文治每过三四日，就去王紫翔处听讲。“先生忻然，凡文章之奥、性命之幽，旁逮训诂笺疏之谊、诸子百家之言，靡不口讲指画，统贯旁通。至于朝夕训诲，则必龂龂然以制行为先务。”
王紫翔给唐文治开列的书目有汪武曹的《孟子大全》、陆清献的《三鱼堂集》《唐宋文醇》《熊锺陵制义》。《孟子大全》《三鱼堂集》是理学家的著作；《唐宋文醇》是乾隆御选的唐宋散文选本；《熊锺陵制义》是熊伯龙的八股文范例。从书目的选择上看，王紫翔可谓颇具苦心，他训练唐文治既要学习理学要义，又要学习文章撰写，并最终将此训练成果融贯到八股文的写作中，从而获得良好的应试效果。王紫翔告诫唐文治：“凡文之博大昌明者，必其人之光明磊落者也；文之精深坚卓者，必其人之忠厚笃实者也；至尖新险巧，则人必刻薄；圆熟软美，则人必鄙陋。汝学作文，先从立品始，不患不为天下第一等人，亦不患不为天下第一等文。”
王紫翔所说“人品即文品”的道理，传承了中国传统“文以载道”的精神，可谓读书作文的大根大本。唐文治对于先生的教诲憬然受命，其日后颇具特色的文章学理论，亦大抵发端于此。
在学问志向上，王紫翔有严格的义利之辨，“境遇之穷困，当随时退一步想，人之不如我者正多也。学问之高深，当随时进一步想，我之不如人者正多也。居易俟命，随处皆乐境。升沉得失，奚足重轻？”
在物质条件上，不要去与人攀比；而在学问境界上，则处处要自强不息。正是在这样的人生信条下，王紫翔面对道义所要求之事，敢于挺身而出、主持公义。
光绪八年（1882），圣公会华人牧师吴虹玉
由上海赴太仓传教，准备购买太仓城南门寡妇宋张氏的房屋用于传教。王紫翔知晓此事之后，将庠序中学子会集娄东书院，倡言道：“传教本为条约所许，但吾娄城中向未设有教堂，生恐滋生事端，于教士转有不利。请诸君同赴州署请愿，商阻兹事。”
于是王紫翔与唐文治等诸生同赴州署。由于南门地属县境，此事由县署办理。知县当晚坐堂，提讯牧师吴虹玉与宋张氏。刚开始吴虹玉坚持认为知县无权干涉其传教，但在场的诸生群情激愤，吴虹玉只得退让。由于最初吴虹玉以三百金购买宋张氏房屋，故王紫翔筹集公款三百金还给吴虹玉，原来房屋买卖作废。吴虹玉在太仓的传教受挫，第二天就离娄返沪了。如果单就王紫翔、唐文治、吴虹玉等人的人品来看，他们皆是充满爱国热情的君子式人物。在王紫翔、唐文治等人看来，吴虹玉是挟洋自重，传播异端；而在吴虹玉看来，王紫翔等乡绅是仗势欺人，泥古不化。双方之间的矛盾，似乎裹挟了更多的学说与立场的对抗。
唐文治经历了这次护教的斗争，对老师的义举敬佩万分。王紫翔倡议将此房屋改建为陆世仪、陈瑚、江士韶、盛敬四先生的祠堂。陆世仪，字道威，号刚斋，晚号桴亭，江苏太仓人，明末清初著名的理学家，被誉为江南大儒。明亡，隐居讲学，与陆陇其并称“二陆”。一生为学，志存经世。天文地理、礼乐农桑、河渠贡赋、战阵刑法，无所不通，而其学又以理学为归。陈瑚，字言夏，号确庵，少时与陆世仪游，以实学为务。明亡，无意仕进，奉父隐居，不应诏举。江士韶，字虞九，号药园，其学以陆世仪为归，以为圣贤之旨，尽于昔儒之论说，后人惟在躬行而已。盛敬，字宗传，号寒溪，与陆世仪同学，以存诚主敬、笃于孝友为学问宗旨。此四位先生都是太仓历史上德望所归的先贤，久为后人仰慕，故对于王紫翔的提议，大家一致同意。于是将房屋略加修葺，是年五月就将四先生的神主送入祠堂。自此以后，春秋二祭，肃肃雍雍，德化一方。后来王紫翔魂归道山，唐文治亦力主将老师王紫翔附祀四先生祠，以纪念王紫翔倡建祠堂之功。
唐文治本来性颇疏狂，经常持简高谈，以为名教自有乐地，吾辈当在第一流中。而在王紫翔门下，则常被师友鞭策提醒，自此愈加收敛，知道学问应该在省身修德处用力。在这段求学的时光里，他写了“毋不敬，毋自欺”的座右铭，路不斜视，收束身心，细读《近思录》《性理精义》《学蔀通辨》《程氏读书分年日程》等，抄录《王学质疑》《明辨录》等书。而在读《孟子》时，又抄录王紫翔的《读孟随笔》，将其读书心得写成《读孟札记》。经过这一番勤学苦练，唐文治对于宋明理学有了更深刻的体会。
唐文治18岁时，与郁冰雪（1861—1894）完婚。婚后，郁夫人服侍堂上公婆，起敬起孝，劳而不怨。婆婆胡太夫人肝郁病时常发作，郁氏夫人朝夕侍疾，毫无怨言。胡太夫人尝语人曰：“吾妇无他胜人者，惟德性差胜人耳。”
这一年秋季，就要进行乡试。王紫翔嘱咐唐文治购买一批参考书。唐文治身手拮据，无钱买书。郁夫人典质了奁中陪嫁物作为资助，唐文治遂购得《二程遗书》《朱子全书》《拙修集》等性理学书籍。八月，唐文治告别母亲与夫人，随父亲唐受祺赴南京参加乡试。乡试一共考三场。为了防止徇私舞弊，上交的考卷为墨卷，需要糊名，由誊录人用朱笔誊写一遍，称为朱卷。再将朱卷送交考官批阅。榜发，唐文治中式第二十名举人。当时左宗棠任两江总督，为乡试的监临官，对唐文治所写的文章大为叹赏，并在发榜揭晓后，又将唐文治的墨卷索去细阅，并云：“此人三场字迹一丝不苟，必有后福。”唐文治后来闻知此事，虽一生无缘亲见左宗棠
，但对左宗棠报以终身知己之感，并以“先师”称之。
唐文治中举后，顺便随父去了一趟扬州，游玩了平山堂、小金山等名胜。下一年春，唐文治随王紫翔一起赴北京参加会试。王紫翔是年42岁，唐文治19岁。榜发，王紫翔中式，入词林，授庶吉士。唐文治则未能中式，落第而归。
这次会试的失利，让唐文治认识到自己学问的不足，这促使他在求学的道路上更加精进。当时宁波知府宗源瀚创办宁波辨志文会，分汉学、宋学、史学兼掌故、算法、舆地、词章六斋课士。每斋延请专精的学者为斋长，校阅课卷。成绩分为超等、特等、一等三个级别，并发放相应的奖励。唐文治就经常参与辨志文会的宋学、汉学课艺之撰作。其课艺的成绩，几乎都在超等的级别，且多次拿到宋学超等第一名的好成绩。