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中央档案馆馆藏抗战档案内容丰富、系统权威，是客观、全面反映中国共产党领导中国人民抗击日本侵略的珍贵史料。鉴于馆藏抗战档案数量众多、涵盖面广，仅选取具有代表性的部分档案进行介绍。
九一八事变后，中国共产党立即旗帜鲜明地提出了坚决抗日的主张，号召全国人民掀起反对日本帝国主义侵略东北的抗日斗争，这在馆藏档案中有充分体现。例如：1931年9月20日，中共中央发表《中国共产党为日本帝国主义强暴占领东三省事件宣言》；9月22日中共中央又作出《关于日本帝国主义强占满洲事变的决议》。中国共产党在民族危亡的紧要关头又多次发表宣言、通电或训令，号召全国人民共同抗击日本帝国主义。“一·二八”淞沪抗战爆发之际，1932年1月27日发表《中国共产党中央委员会为武装保卫中国革命告全国民书》；1月31日发出《中国共产党中央为上海事变第二次宣言》；4月5日针对《淞沪停战协定》的签订，发出《中国共产党中央委员会为以民族的革命战争反对帝国主义进攻苏联与瓜分中国告民众书》；4月15日发出《中华苏维埃共和国临时中央政府宣布对日战争宣言》《中华苏维埃共和国临时中央政府为对日宣战向全世界无产阶级和被压迫民族宣言》《中华苏维埃共和国临时中央政府关于动员对日宣战的训令》。随着日本帝国主义向华北地区侵略形势的严峻，中国共产党又通过各种途径，号召停止内战、共同抗日，这些都在档案中有充分体现。
中国共产党为建立以国共合作为基础的抗日民族统一战线进行了长期不懈的努力。如馆藏的1935年8月1日由中共驻共产国际代表团草拟的《中国苏维埃政府、中国共产党中央为抗日救国告全体同胞书》（即《八一宣言》）和同年12月在瓦窑堡召开中共中央政治局扩大会议通过的《中央关于目前政治形势与党的任务决议》等档案，是反映中国共产党号召建立抗日民族统一战线的早期文献。
西安事变发生后，中国共产党以中华民族利益的大局为重，确定了以和平方式解决西安事变的方针，并积极奔走，争取事变和平解决。中央档案馆保存有大量为解决西安事变与各有关方面的来往电报、信件，这些档案真实记录了这一重大历史事件，反映了中国共产党对促成以国共两党合作为基础的抗日民族统一战线的建立所发挥的重要作用。
全面抗战爆发后，中国共产党提出了一系列正确的抗日战略，中央档案馆馆藏中有大量这方面的档案。在全面抗战一开始，中国共产党就提出了全民族抗战的全面抗战路线，如：1937年7月8日发表《中国共产党为日军进攻卢沟桥通电》《红军将领为日寇进攻华北致蒋委员长电》；7月9日发表《人民抗日红军要求改编为国民革命军并请授命为抗日前驱的通电》；7月23日毛泽东发表《反对日本进攻的方针、办法和前途》；8月22日至25日中共中央在陕北洛川召开政治局扩大会议通过的《中国共产党抗日救国十大纲领》等。1938年5—6月，毛泽东总结了全面抗战以来10个月的经验，作了题为《论持久战》的长篇讲演，系统阐明了中国共产党的持久战理论，阐明了夺取抗战胜利的正确道路，馆藏有《论持久战》多个版本的档案资料。
为了早日实现国共两党合作抗日，进一步推动全面抗战，1937年7月中旬，周恩来将《中共中央为公布国共合作宣言》送交蒋介石。8月25日中共中央革命军事委员会发布《关于红军改编为国民革命军第八路军的命令》。10月，南方八省红军和游击队整编为新四军。这些档案充分表现了中国共产党为实现国共合作、夺取抗战胜利的决心。
中国共产党不仅是抗日民族统一战线的积极倡导者和组织者，而且是其坚定的维护者和力行者，在馆藏中有许多反映中国共产党坚持统一战线主张、立场和行动的档案。如：1939年1月26日中共中央作出《关于帮助国民党及其军队工作原则的决定》；同年3月20日中共中央作出《关于统战部工作的指示》；1940年5月4日毛泽东发表《放手发展抗日力量，抵抗反共顽固派的进攻》一文；同年8月15日中共中央作出《关于开展统一战线工作的指示》；1941年1月18日中共中央作出《关于皖南事变的指示》；同年12月9日中共中央作出《关于太平洋反日统一战线的指示》；1943年2月7日毛泽东、朱德、王稼祥、叶剑英发出《关于主动加强统战工作的指示》致各战略区域电；1945年4月30日，周恩来在中国共产党第七次全国代表大会上作题为《论统一战线》的报告等。
中国共产党在推动和坚持国共合作的同时，还积极倡导、努力建立和扩大包括各民主党派、人民团体以及一切爱国阶级、阶层的广泛的抗日民族统一战线。如：1940年4月1日中共中央作出《关于争取小党派及中间分子的指示》，同年10月11日中共中央作出《关于对苏北名绅进行统战工作的指示》，10月30日中共中央宣传部作出《关于向全国教育界各小派别小团体推广统一战线工作的指示》等，馆藏这方面的档案也为数不少。
九一八事变后，中国共产党领导的东北抗日武装，在杨靖宇、王德泰、赵尚志、周保中等领导下，坚持武装斗争，发展成为东北抗日联军的基本力量，有力支援了全国的抗日战争。如馆藏的1933年1月26日由中共中央发出的《给满洲各级党部及全体党员的信》（即“一·二六指示信”）和1936年2月发表的《东北抗日联军统一军队建制宣言》等档案，是中国共产党在东北积极组织并领导抗日武装斗争的具体体现。
中国共产党从全面抗战大局出发，领导八路军、新四军深入敌后，取得了许多重大胜利。在馆藏档案中，许多关于战略方针、作战部署、形势分析、战斗情况等方面的电报、照片对此都有反映。如平型关战斗、雁门关伏击战、阳明堡战斗、广阳伏击战、响堂铺战斗、晋东南反九路围攻、百团大战、车桥战役等，在档案中都有详细记载。以平型关战斗为例，与之有关的档案有1937年9月25日朱德、彭德怀关于平型关战况的电报；9月26日朱德、彭德怀关于一一五师平型关大捷的电报，八路军参谋处关于平型关战斗的捷报，平型关战斗胜利后战士们凯旋归来的照片；平型关会战经过要图；10月18日朱德、彭德怀关于平型关战斗胜利后应注意轻敌和骄傲致各师电；1937年10月八路军后方留守警备一团团长贺晋年率全体指战员祝贺平型关大捷电；11月24日《新中华报》刊发平型关战斗纪实等。
在馆藏档案中，还保存有大量反映中国共产党领导八路军、新四军在敌后建立根据地，实行独立自主游击战的档案；有广泛发动群众开辟敌后战场，有力支援正面战场的档案；还有在敌后抗日根据地同日军进行反“扫荡”和反“蚕食”斗争的档案等。
中央档案馆保存着中国共产党领导的各敌后抗日根据地的珍贵档案，这些档案包含党的建设、政权建设、军事斗争、财政经济、组织宣传、文化教育、卫生事业等各方面内容。
在艰苦的抗战环境中，中国共产党非常注意加强自身建设。馆藏档案反映了中国共产党在抗战时期为加强自身建设所进行的各项工作。例如：1938年3月15日中共中央作出《关于大量发展党员的决议》；1939年7月刘少奇起草《论共产党员的修养》；8月25日中共中央政治局通过《关于巩固党的决定》；1940年2月15日中共中央发出《关于办理党校的指示》；同年10月17日中共中央宣传部发出《关于各抗日根据地内党支部教育的指示》；1941年7月1日中共中央政治局通过《关于增强党性的决定》；8月中共中央作出《关于调查研究的决定》；1942年9月1日中共中央政治局通过《关于统一抗日根据地党的领导及调整各组织间关系的决定》；1943年6月1日中共中央发出《关于领导方法的决定》等。
整风运动是抗日战争时期一次全党范围内的马克思主义思想教育运动，也是破除党内把马克思主义教条化、把共产国际决议和苏联经验神圣化错误倾向的伟大思想解放运动，为抗日战争的胜利奠定了重要的思想政治基础。馆藏档案中记载着整风运动的全过程。如：1941年5月毛泽东在延安高级干部会议上作题为《改造我们的学习》的报告；9月至10月毛泽东在中共中央政治局扩大会议上作反对主观主义和宗派主义的主题报告等。馆藏中还保存有中共中央书记处编印的《马恩列斯思想方法论》和《六大以来》等学习文件；1942年2月毛泽东所作题为《整顿党的作风》和《反对党八股》的报告；同年4月3日中共中央宣传部《关于在延安讨论中央决定及毛泽东整顿三风报告的决定》；毛泽东在西北局高级干部会议上所作题为《论布尔什维克化十二条》的讲演等档案。1944年5月21日至1945年4月20日，中共中央在延安举行扩大的六届七中全会，会议通过了《关于若干历史问题的决议》，该《决议》草案及历次草案修正稿、定稿等不同版本均保存在中央档案馆。
在政权建设方面，馆藏有1940年3月中共中央发出的《关于抗日根据地的政权问题》的指示，1942年12月陕甘宁边区政府第三次政府委员会通过的《陕甘宁边区简政实施纲要》等档案。在经济建设方面，包括1942年1月28日中共中央作出的《关于抗日根据地土地政策的决定》，1942年12月毛泽东在陕甘宁边区高级干部会议上所作题为《经济问题和财政问题》的报告，为中共中央起草的题为《开展根据地的减租、生产和拥政爱民运动》的党内指示等档案。在根据地文化教育建设方面，馆藏有关于中国人民抗日军政大学、陕北公学、鲁迅艺术学院、中共中央党校等机构档案。