明初三代帝君与佛教有甚深因缘。洪武帝朱元璋为明代开国皇帝,早年先出家为僧,转而投入红巾军抗元,以金陵为龙兴基地,逐步削灭群雄,推翻蒙元统治,成就辉煌帝业。建文帝朱允炆继承皇祖父朱元璋大统,即帝位仅4年,因靖难之变而不知所终,或曰遁入佛门,或传燕军攻破南京城后焚于宫火。而最新史料表明《洪武南藏》刻竣于建文年间,板藏于天禧寺,惜乎也被寺火焚毁。永乐帝朱棣为朱元璋第四子,受封为燕王藩守北平,以僧人道衍为主谋师,发动靖难之变,夺得帝位,后建大报恩寺,并刻《永乐南藏》于南京。明初帝王确立了明代赞护、管控和利用佛教政策制度的基础和典范,而其基本政策制度都是在明朝建国后首都南京这个特定的时空中产生和颁行的,不仅作为不可违背的“祖训”影响明朝近300年,而且由于清沿明制,对有清一代佛教政策制度的制定和实施也产生了深远影响。