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明清鼎革，伴随着王朝的更替、社会的巨变，清代佛教承嗣晚明佛教的精髓余绪，以禅宗之临济和曹洞二宗最为兴盛。其中临济幻有正传门下出天童（密云圆悟）、磬山（天隐圆修）二系，曹洞宗镜宗书下出寿昌（无明慧经）、云门（湛然圆澄）二系，双峰对峙，竞相流传。清初禅宗在乱世变革之际，并未沉寂消亡，随明王朝一同被埋葬，反而出现一度兴盛的景象。其中的重大缘由可能与大量遗民逃禅有关，其沉痛和血性激发老迈的机体产生新的活力。而从另一个角度看，山河破碎、风雨飘摇、国破家亡之时，遁入佛门听老衲说禅诵经，青灯古佛伴残生，又何尝不是莫大的安慰，或休养生机以待时的极好去处呢？
清初遗民是亡明遗臣，是明清易代之际衍生出来的一个不仕新朝的特殊士人群体。这个群体的最明显标志是“多怀故国之思”，不与新朝合作，不投降做顺民。明清易代，对于汉族士人尤其是遗民来说，不仅意味着民族政权的移易，而且意味着汉文化面临“以夷变夏”的严峻挑战，甚至有中断之虞。所以他们除了参加抗清斗争和反清复明的行动外，还在思想文化上进行深刻反思，一面浸淫着山河破碎、故国飘零的亡国之痛，一面孜孜矻矻于保存和赓续中华文化命脉。易代之初，遗民们大都投笔从戎，举义抗清；武装反抗失败后，又转入文化抗争的战场，以笔作枪，为中华文化之存亡继绝而著书立说。其中还有不少遗民纷纷埋身荒野，入山“逃禅”。披阅易代之际国破家亡后遗民逃禅的史料，隐然可见浩气长存，精魄不散，这无疑是解读清代佛教历史和思想的一个极好视点。