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高等学校应当至少按照年度编制财务报告和决算报告。财务报告和决算报告相互补充，共同反映高等学校的财务信息和预算执行信息。
高等学校应当根据《政府会计制度》的规定编制真实、完整的财务报告和决算报告报表，不得违反规定随意改变财务报告和决算报告的编制基础、编制依据、编制原则和编制方法，不得随意改变规定的财务报告和决算报告有关数据的会计口径。财务报告和决算报告应当根据登记完整、核对无误的账簿记录和其他有关资料编制，做到数字真实、计算准确、内容完整、编报及时。
财务报告和决算报告报表应当由高等学校负责人和主管会计工作的负责人、财务部门负责人签名并盖章。应当重视并不断推进会计信息化的应用，开展会计信息化工作，符合财政部制定的相关会计信息化工作规范和标准，确保利用现代信息技术手段开展会计核算及生成的会计信息符合规定。
高等学校财务报告是反映高等学校某一特定日期的财务状况和某一会计期间的运行情况及现金流量等信息的文件。高等学校财务报告的编制主要以权责发生制为基础，以财务会计核算生成的数字为准。高等学校财务报告的目标兼顾受托责任和决策有用。
高等学校财务报告由会计报表及附注构成。高等学校财务会计报表一般包括资产负债表、收入费用表、净资产变动表。高等学校可根据实际情况自行选择编制现金流量表。
资产负债表反映高等学校在某一特定日期全部资产、负债和净资产的情况。收入费用表反映高等学校在某一会计期间内发生的收入、费用及当期盈利情况。净资产变动表反映高等学校在某一会计年度内净资产项目的变动情况。现金流量表反映高等学校在某一会计年度内现金流入和流出的信息。附注是对会计报表中列示的项目所做的进一步说明以及对未能在会计报表中列示项目的说明，是财务报告的重要组成部分。
高等学校决算报告是综合反映高等学校年度预算收支执行结果的文件。高等学校决算报告的编制主要以收付实现制为基础，以预算会计核算生成的数字为准。高等学校决算报告的目标以决策有用为主。
高等学校决策报表主要包括预算收入支出表、预算结转结余变动表和财政拨款预算收入支出表。预算收入支出表反映高等学校在某一会计年度内各预算收入、预算支出和预算收支差额的情况，编制期限为年度。预算结转结余变动表反映高等学校在某一会计年度内预算结转结余的变动情况，编制期限为年度。财政拨款预算收入支出表反映高等学校本年财政拨款预算资金收入、支出及相关变动的具体情况，编制期限为年度。